MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_020942	AAAAG	2	10	69557	69566	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_020942	A	6	6	69658	69663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020942	TTC	2	6	69733	69738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_020942	CTT	3	9	69742	69750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_020942	AT	3	6	69755	69760	50 %	50 %	0 %	0 %	478455902
1507	NC_020942	TTCG	2	8	69775	69782	0 %	50 %	25 %	25 %	478455902
1508	NC_020942	TGT	2	6	69800	69805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478455902
1509	NC_020942	TGAT	2	8	69892	69899	25 %	50 %	25 %	0 %	478455902
1510	NC_020942	T	6	6	69940	69945	0 %	100 %	0 %	0 %	478455902
1511	NC_020942	TCT	2	6	70056	70061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478455902
1512	NC_020942	GGAGC	2	10	70179	70188	20 %	0 %	60 %	20 %	478455902
1513	NC_020942	TGC	2	6	70262	70267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455902
1514	NC_020942	A	7	7	70299	70305	100 %	0 %	0 %	0 %	478455902
1515	NC_020942	CT	3	6	70307	70312	0 %	50 %	0 %	50 %	478455902
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1517	NC_020942	GCGAT	2	10	70369	70378	20 %	20 %	40 %	20 %	478455902
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1519	NC_020942	GCT	2	6	70413	70418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478455902
1520	NC_020942	GCA	3	9	70515	70523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455902
1521	NC_020942	AAAG	2	8	70548	70555	75 %	0 %	25 %	0 %	478455902
1522	NC_020942	GCA	2	6	70562	70567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478455902
1523	NC_020942	ATT	2	6	70576	70581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455902
1524	NC_020942	TAT	2	6	70684	70689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455902
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1532	NC_020942	GA	3	6	70916	70921	50 %	0 %	50 %	0 %	478455902
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1534	NC_020942	TGA	2	6	71003	71008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455902
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1539	NC_020942	CT	3	6	71273	71278	0 %	50 %	0 %	50 %	478455902
1540	NC_020942	GA	3	6	71294	71299	50 %	0 %	50 %	0 %	478455902
1541	NC_020942	AGT	2	6	71336	71341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455902
1542	NC_020942	AGGGG	2	10	71369	71378	20 %	0 %	80 %	0 %	478455902
1543	NC_020942	AAGAA	2	10	71411	71420	80 %	0 %	20 %	0 %	478455902
1544	NC_020942	AGA	2	6	71483	71488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455902
1545	NC_020942	TGA	2	6	71519	71524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455902
1546	NC_020942	TAT	2	6	71530	71535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478455902
1547	NC_020942	T	6	6	71619	71624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_020942	T	8	8	71640	71647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_020942	CAT	2	6	71705	71710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455903
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1552	NC_020942	A	6	6	71859	71864	100 %	0 %	0 %	0 %	478455903
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1555	NC_020942	TCC	2	6	72080	72085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478455903
1556	NC_020942	TTCT	2	8	72102	72109	0 %	75 %	0 %	25 %	478455903
1557	NC_020942	ATG	2	6	72114	72119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455903
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1559	NC_020942	AGA	2	6	72157	72162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478455903
1560	NC_020942	GAGC	2	8	72176	72183	25 %	0 %	50 %	25 %	478455903
1561	NC_020942	TCA	2	6	72201	72206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455903
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1563	NC_020942	CTATTT	2	12	72219	72230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478455903
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1565	NC_020942	ATG	2	6	72291	72296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455903
1566	NC_020942	AGA	2	6	72421	72426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_020942	CGT	2	6	72469	72474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1569	NC_020942	CTTGC	2	10	72500	72509	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1603	NC_020942	A	7	7	73779	73785	100 %	0 %	0 %	0 %	478455904
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1609	NC_020942	TAC	2	6	73983	73988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478455905
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1611	NC_020942	TGA	2	6	74061	74066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478455905
1612	NC_020942	G	6	6	74119	74124	0 %	0 %	100 %	0 %	478455905
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1614	NC_020942	A	6	6	74167	74172	100 %	0 %	0 %	0 %	478455905
1615	NC_020942	TGGGA	2	10	74190	74199	20 %	20 %	60 %	0 %	478455905
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