MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis E/SotonE8 high quality draft genome

Total Repeats: 23107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5503	NC_020942	AACT	2	8	253011	253018	50 %	25 %	0 %	25 %	478456061
5504	NC_020942	TC	3	6	253078	253083	0 %	50 %	0 %	50 %	478456061
5505	NC_020942	TCCCC	2	10	253122	253131	0 %	20 %	0 %	80 %	478456061
5506	NC_020942	CTT	2	6	253184	253189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456061
5507	NC_020942	GAT	2	6	253244	253249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456061
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5509	NC_020942	TCT	2	6	253273	253278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456061
5510	NC_020942	GAA	2	6	253454	253459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456061
5511	NC_020942	CAAG	2	8	253490	253497	50 %	0 %	25 %	25 %	478456061
5512	NC_020942	ATA	2	6	253500	253505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456061
5513	NC_020942	TTA	2	6	253568	253573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456061
5514	NC_020942	TAAA	2	8	253600	253607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_020942	ATA	2	6	253622	253627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_020942	TTA	2	6	253643	253648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5521	NC_020942	GTA	2	6	253829	253834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456062
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5529	NC_020942	AAG	2	6	254151	254156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456062
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5531	NC_020942	TCG	2	6	254344	254349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456062
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5536	NC_020942	T	6	6	254599	254604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_020942	TACAA	2	10	254628	254637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5538	NC_020942	ATA	2	6	254660	254665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_020942	CAG	2	6	254699	254704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456063
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5541	NC_020942	TCT	2	6	254750	254755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456063
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5543	NC_020942	TC	3	6	254792	254797	0 %	50 %	0 %	50 %	478456063
5544	NC_020942	TC	3	6	254823	254828	0 %	50 %	0 %	50 %	478456063
5545	NC_020942	T	6	6	254843	254848	0 %	100 %	0 %	0 %	478456063
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5555	NC_020942	TTA	2	6	255200	255205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456063
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5560	NC_020942	TCT	2	6	255405	255410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456063
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5579	NC_020942	A	6	6	255935	255940	100 %	0 %	0 %	0 %	478456064
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5602	NC_020942	GTATG	2	10	257039	257048	20 %	40 %	40 %	0 %	478456065
5603	NC_020942	GA	3	6	257081	257086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_020942	ACT	2	6	257141	257146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_020942	TG	3	6	257191	257196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_020942	AATA	2	8	257258	257265	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_020942	T	6	6	257280	257285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_020942	T	7	7	257299	257305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_020942	A	6	6	257307	257312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_020942	AAG	2	6	257445	257450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_020942	GCA	2	6	257464	257469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_020942	TTG	2	6	257484	257489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_020942	CAAA	2	8	257648	257655	75 %	0 %	0 %	25 %	478456066
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5617	NC_020942	CAAT	2	8	257758	257765	50 %	25 %	0 %	25 %	478456066
5618	NC_020942	CTTT	3	12	257810	257821	0 %	75 %	0 %	25 %	478456066
5619	NC_020942	CGA	2	6	257852	257857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456066
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5621	NC_020942	ACA	2	6	257885	257890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456066
5622	NC_020942	CTC	2	6	257904	257909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5623	NC_020942	CAA	2	6	257948	257953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_020942	AG	3	6	257993	257998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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