MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 2363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020941	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478456740
2	NC_020941	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	478456740
3	NC_020941	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	478456740
4	NC_020941	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020941	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	478456743
6	NC_020941	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	478456743
7	NC_020941	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	478456744
8	NC_020941	TC	3	6	5864	5869	0 %	50 %	0 %	50 %	478456745
9	NC_020941	GA	3	6	5875	5880	50 %	0 %	50 %	0 %	478456745
10	NC_020941	AT	3	6	5979	5984	50 %	50 %	0 %	0 %	478456745
11	NC_020941	TG	3	6	6132	6137	0 %	50 %	50 %	0 %	478456745
12	NC_020941	AG	3	6	6540	6545	50 %	0 %	50 %	0 %	478456745
13	NC_020941	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020941	AC	3	6	8248	8253	50 %	0 %	0 %	50 %	478456747
15	NC_020941	AG	3	6	8991	8996	50 %	0 %	50 %	0 %	478456748
16	NC_020941	CT	4	8	9110	9117	0 %	50 %	0 %	50 %	478456748
17	NC_020941	GT	3	6	9192	9197	0 %	50 %	50 %	0 %	478456748
18	NC_020941	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478456750
19	NC_020941	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478456750
20	NC_020941	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020941	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478456751
22	NC_020941	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478456751
23	NC_020941	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478456752
24	NC_020941	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478456752
25	NC_020941	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478456752
26	NC_020941	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020941	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020941	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478456753
29	NC_020941	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478456754
30	NC_020941	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478456754
31	NC_020941	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478456755
32	NC_020941	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478456755
33	NC_020941	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478456755
34	NC_020941	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020941	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020941	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478456756
37	NC_020941	TC	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	478456756
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39	NC_020941	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478456757
40	NC_020941	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478456757
41	NC_020941	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478456757
42	NC_020941	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478456757
43	NC_020941	AG	4	8	20116	20123	50 %	0 %	50 %	0 %	478456757
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45	NC_020941	AG	3	6	20607	20612	50 %	0 %	50 %	0 %	478456758
46	NC_020941	TG	3	6	20720	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	478456758
47	NC_020941	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020941	GA	3	6	21274	21279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020941	AG	3	6	21791	21796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020941	CT	3	6	21860	21865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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53	NC_020941	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478456759
54	NC_020941	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478456759
55	NC_020941	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478456759
56	NC_020941	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	478456759
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63	NC_020941	AT	3	6	27405	27410	50 %	50 %	0 %	0 %	478456761
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66	NC_020941	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020941	TG	3	6	28993	28998	0 %	50 %	50 %	0 %	478456763
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70	NC_020941	TA	3	6	29582	29587	50 %	50 %	0 %	0 %	478456763
71	NC_020941	GA	3	6	30533	30538	50 %	0 %	50 %	0 %	478456764
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91	NC_020941	AG	3	6	38675	38680	50 %	0 %	50 %	0 %	478456773
92	NC_020941	AG	3	6	39202	39207	50 %	0 %	50 %	0 %	478456773
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103	NC_020941	GA	3	6	41628	41633	50 %	0 %	50 %	0 %	478456775
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112	NC_020941	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020941	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_020941	AG	4	8	46626	46633	50 %	0 %	50 %	0 %	478456781
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121	NC_020941	AG	3	6	47071	47076	50 %	0 %	50 %	0 %	478456781
122	NC_020941	AG	3	6	48643	48648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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