MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 2871

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020941	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478456740
2	NC_020941	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	478456740
3	NC_020941	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	478456740
4	NC_020941	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	478456740
5	NC_020941	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	478456740
6	NC_020941	AAGG	2	8	1909	1916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020941	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	478456741
8	NC_020941	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	478456742
9	NC_020941	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	478456742
10	NC_020941	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	478456743
11	NC_020941	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	478456743
12	NC_020941	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	478456743
13	NC_020941	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	478456744
14	NC_020941	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	478456744
15	NC_020941	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	478456744
16	NC_020941	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	478456744
17	NC_020941	TGGA	2	8	5923	5930	25 %	25 %	50 %	0 %	478456745
18	NC_020941	CTTT	2	8	6300	6307	0 %	75 %	0 %	25 %	478456745
19	NC_020941	GGGA	2	8	6815	6822	25 %	0 %	75 %	0 %	478456745
20	NC_020941	GGAG	2	8	6906	6913	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020941	GGTG	2	8	7118	7125	0 %	25 %	75 %	0 %	478456746
22	NC_020941	AAAT	2	8	7184	7191	75 %	25 %	0 %	0 %	478456746
23	NC_020941	TATG	2	8	7555	7562	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020941	ATTT	2	8	7696	7703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020941	TTTG	2	8	7788	7795	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020941	AAGC	2	8	8421	8428	50 %	0 %	25 %	25 %	478456747
27	NC_020941	ATTG	2	8	8819	8826	25 %	50 %	25 %	0 %	478456748
28	NC_020941	AGCG	2	8	9286	9293	25 %	0 %	50 %	25 %	478456748
29	NC_020941	AAAG	2	8	9307	9314	75 %	0 %	25 %	0 %	478456748
30	NC_020941	CTTT	2	8	9647	9654	0 %	75 %	0 %	25 %	478456748
31	NC_020941	TATT	2	8	9910	9917	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020941	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478456749
33	NC_020941	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478456749
34	NC_020941	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478456749
35	NC_020941	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478456750
36	NC_020941	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478456750
37	NC_020941	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478456750
38	NC_020941	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478456750
39	NC_020941	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020941	AATG	2	8	12141	12148	50 %	25 %	25 %	0 %	478456751
41	NC_020941	ATTT	2	8	12918	12925	25 %	75 %	0 %	0 %	478456751
42	NC_020941	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478456752
43	NC_020941	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478456752
44	NC_020941	AAGG	2	8	14038	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020941	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478456753
46	NC_020941	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478456753
47	NC_020941	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478456754
48	NC_020941	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478456754
49	NC_020941	CAAA	2	8	16672	16679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020941	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478456755
51	NC_020941	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478456755
52	NC_020941	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478456755
53	NC_020941	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478456755
54	NC_020941	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478456757
55	NC_020941	CTTT	2	8	19165	19172	0 %	75 %	0 %	25 %	478456757
56	NC_020941	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478456757
57	NC_020941	TTTG	2	8	20136	20143	0 %	75 %	25 %	0 %	478456757
58	NC_020941	TGTA	2	8	20828	20835	25 %	50 %	25 %	0 %	478456758
59	NC_020941	CGCT	2	8	21868	21875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020941	TTAA	2	8	21889	21896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020941	GTTA	2	8	21926	21933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020941	GATC	2	8	21981	21988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020941	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478456759
64	NC_020941	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478456759
65	NC_020941	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478456759
66	NC_020941	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478456759
67	NC_020941	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478456759
68	NC_020941	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478456759
69	NC_020941	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478456759
70	NC_020941	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478456759
71	NC_020941	TTCG	2	8	25799	25806	0 %	50 %	25 %	25 %	478456760
72	NC_020941	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478456760
73	NC_020941	TTCC	2	8	26002	26009	0 %	50 %	0 %	50 %	478456760
74	NC_020941	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478456760
75	NC_020941	GCTT	2	8	26888	26895	0 %	50 %	25 %	25 %	478456760
76	NC_020941	GGAA	2	8	27471	27478	50 %	0 %	50 %	0 %	478456761
77	NC_020941	TTAA	2	8	27544	27551	50 %	50 %	0 %	0 %	478456761
78	NC_020941	AAAG	2	8	27594	27601	75 %	0 %	25 %	0 %	478456761
79	NC_020941	GGGC	2	8	27874	27881	0 %	0 %	75 %	25 %	478456761
80	NC_020941	GTTT	2	8	28157	28164	0 %	75 %	25 %	0 %	478456762
81	NC_020941	CAGA	2	8	28179	28186	50 %	0 %	25 %	25 %	478456762
82	NC_020941	ATTG	2	8	28538	28545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020941	CTTT	2	8	30151	30158	0 %	75 %	0 %	25 %	478456764
84	NC_020941	TTTG	2	8	30166	30173	0 %	75 %	25 %	0 %	478456764
85	NC_020941	TTGT	2	8	30201	30208	0 %	75 %	25 %	0 %	478456764
86	NC_020941	TGGC	2	8	30364	30371	0 %	25 %	50 %	25 %	478456764
87	NC_020941	AAAG	2	8	30924	30931	75 %	0 %	25 %	0 %	478456765
88	NC_020941	AAAC	2	8	30994	31001	75 %	0 %	0 %	25 %	478456765
89	NC_020941	GATG	2	8	31137	31144	25 %	25 %	50 %	0 %	478456765
90	NC_020941	GATA	2	8	32246	32253	50 %	25 %	25 %	0 %	478456767
91	NC_020941	TGAT	2	8	34741	34748	25 %	50 %	25 %	0 %	478456770
92	NC_020941	AAGA	3	12	34869	34880	75 %	0 %	25 %	0 %	478456770
93	NC_020941	AAGC	2	8	35089	35096	50 %	0 %	25 %	25 %	478456771
94	NC_020941	GTTC	2	8	35122	35129	0 %	50 %	25 %	25 %	478456771
95	NC_020941	GGCA	2	8	35501	35508	25 %	0 %	50 %	25 %	478456772
96	NC_020941	TCGA	2	8	35758	35765	25 %	25 %	25 %	25 %	478456772
97	NC_020941	TGCT	2	8	35911	35918	0 %	50 %	25 %	25 %	478456772
98	NC_020941	TATG	2	8	36054	36061	25 %	50 %	25 %	0 %	478456772
99	NC_020941	TTGG	2	8	36143	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	478456772
100	NC_020941	AGAT	2	8	36863	36870	50 %	25 %	25 %	0 %	478456772
101	NC_020941	CTTT	2	8	37236	37243	0 %	75 %	0 %	25 %	478456773
102	NC_020941	ATGA	2	8	37726	37733	50 %	25 %	25 %	0 %	478456773
103	NC_020941	TAGG	2	8	37885	37892	25 %	25 %	50 %	0 %	478456773
104	NC_020941	CAAT	2	8	38069	38076	50 %	25 %	0 %	25 %	478456773
105	NC_020941	AATG	2	8	38856	38863	50 %	25 %	25 %	0 %	478456773
106	NC_020941	AGAA	2	8	39693	39700	75 %	0 %	25 %	0 %	478456774
107	NC_020941	AAGA	2	8	39745	39752	75 %	0 %	25 %	0 %	478456774
108	NC_020941	ATCC	2	8	39753	39760	25 %	25 %	0 %	50 %	478456774
109	NC_020941	TAAT	2	8	39964	39971	50 %	50 %	0 %	0 %	478456774
110	NC_020941	GTGC	2	8	42053	42060	0 %	25 %	50 %	25 %	478456776
111	NC_020941	AGAA	2	8	42472	42479	75 %	0 %	25 %	0 %	478456776
112	NC_020941	GGAT	2	8	42624	42631	25 %	25 %	50 %	0 %	478456776
113	NC_020941	AAAC	2	8	43833	43840	75 %	0 %	0 %	25 %	478456778
114	NC_020941	CAAT	2	8	44037	44044	50 %	25 %	0 %	25 %	478456778
115	NC_020941	TGTT	2	8	44417	44424	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020941	AATA	2	8	44656	44663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020941	ATTT	2	8	44794	44801	25 %	75 %	0 %	0 %	478456779
118	NC_020941	GCTC	2	8	45102	45109	0 %	25 %	25 %	50 %	478456779
119	NC_020941	TTCT	2	8	45244	45251	0 %	75 %	0 %	25 %	478456779
120	NC_020941	TTGA	2	8	45844	45851	25 %	50 %	25 %	0 %	478456780
121	NC_020941	TGTT	2	8	46016	46023	0 %	75 %	25 %	0 %	478456780
122	NC_020941	CTAT	2	8	46046	46053	25 %	50 %	0 %	25 %	478456780
123	NC_020941	TGTT	2	8	46075	46082	0 %	75 %	25 %	0 %	478456780
124	NC_020941	CTAT	2	8	46371	46378	25 %	50 %	0 %	25 %	478456780
125	NC_020941	AAGA	2	8	46866	46873	75 %	0 %	25 %	0 %	478456781
126	NC_020941	AAGA	2	8	46923	46930	75 %	0 %	25 %	0 %	478456781
127	NC_020941	AAAG	2	8	46963	46970	75 %	0 %	25 %	0 %	478456781
128	NC_020941	AAGA	2	8	47078	47085	75 %	0 %	25 %	0 %	478456781
129	NC_020941	ACTT	2	8	47339	47346	25 %	50 %	0 %	25 %	478456781
130	NC_020941	ATGG	2	8	47965	47972	25 %	25 %	50 %	0 %	478456781
131	NC_020941	AGGA	2	8	47996	48003	50 %	0 %	50 %	0 %	478456781
132	NC_020941	GAAC	2	8	48543	48550	50 %	0 %	25 %	25 %	478456781
133	NC_020941	AAGT	2	8	48578	48585	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020941	AACA	2	8	48787	48794	75 %	0 %	0 %	25 %	478456782
135	NC_020941	CTTT	2	8	49868	49875	0 %	75 %	0 %	25 %	478456783
136	NC_020941	GTAG	2	8	49886	49893	25 %	25 %	50 %	0 %	478456783
137	NC_020941	GAAG	2	8	51314	51321	50 %	0 %	50 %	0 %	478456784
138	NC_020941	TTCA	2	8	51736	51743	25 %	50 %	0 %	25 %	478456784
139	NC_020941	TATT	2	8	52672	52679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020941	GGAA	2	8	52903	52910	50 %	0 %	50 %	0 %	478456786
141	NC_020941	TTAA	2	8	53644	53651	50 %	50 %	0 %	0 %	478456786
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143	NC_020941	TTTA	2	8	54018	54025	25 %	75 %	0 %	0 %	478456787
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