MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 22938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020941	GCA	2	6	114236	114241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456834
2502	NC_020941	CTA	2	6	114267	114272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456834
2503	NC_020941	TC	3	6	114294	114299	0 %	50 %	0 %	50 %	478456834
2504	NC_020941	CTC	2	6	114345	114350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2505	NC_020941	A	7	7	114364	114370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_020941	A	8	8	114373	114380	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_020941	GCTCT	2	10	114407	114416	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2508	NC_020941	ATT	2	6	114441	114446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_020941	AGA	2	6	114469	114474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456835
2510	NC_020941	TTC	3	9	114475	114483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2511	NC_020941	AG	3	6	114595	114600	50 %	0 %	50 %	0 %	478456835
2512	NC_020941	TAC	2	6	114709	114714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456835
2513	NC_020941	T	7	7	114798	114804	0 %	100 %	0 %	0 %	478456835
2514	NC_020941	CTTT	2	8	114806	114813	0 %	75 %	0 %	25 %	478456835
2515	NC_020941	ACAG	2	8	114818	114825	50 %	0 %	25 %	25 %	478456835
2516	NC_020941	T	6	6	114850	114855	0 %	100 %	0 %	0 %	478456835
2517	NC_020941	T	6	6	114880	114885	0 %	100 %	0 %	0 %	478456835
2518	NC_020941	CTG	2	6	114975	114980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456835
2519	NC_020941	TTC	2	6	115006	115011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2520	NC_020941	TGTTT	2	10	115031	115040	0 %	80 %	20 %	0 %	478456835
2521	NC_020941	GA	4	8	115051	115058	50 %	0 %	50 %	0 %	478456835
2522	NC_020941	AGAA	2	8	115081	115088	75 %	0 %	25 %	0 %	478456835
2523	NC_020941	ACT	2	6	115091	115096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456835
2524	NC_020941	TCA	2	6	115103	115108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456835
2525	NC_020941	TTG	2	6	115112	115117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456835
2526	NC_020941	CTT	2	6	115188	115193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2527	NC_020941	AAGG	2	8	115215	115222	50 %	0 %	50 %	0 %	478456835
2528	NC_020941	GGA	2	6	115256	115261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456835
2529	NC_020941	TCT	2	6	115266	115271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2530	NC_020941	TTTG	2	8	115299	115306	0 %	75 %	25 %	0 %	478456835
2531	NC_020941	GAT	2	6	115348	115353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478456835
2532	NC_020941	CATGT	2	10	115409	115418	20 %	40 %	20 %	20 %	478456835
2533	NC_020941	TCT	2	6	115570	115575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2534	NC_020941	ACA	2	6	115580	115585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456835
2535	NC_020941	CGA	2	6	115592	115597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456835
2536	NC_020941	ATC	2	6	115645	115650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478456835
2537	NC_020941	TCT	2	6	115662	115667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2538	NC_020941	GGAA	2	8	115688	115695	50 %	0 %	50 %	0 %	478456835
2539	NC_020941	ACC	2	6	115723	115728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478456835
2540	NC_020941	TTG	2	6	115809	115814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456835
2541	NC_020941	AAC	2	6	115831	115836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456835
2542	NC_020941	ACTTCG	2	12	115871	115882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478456835
2543	NC_020941	ACA	3	9	115961	115969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456835
2544	NC_020941	CAA	2	6	115986	115991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456835
2545	NC_020941	TTC	3	9	116035	116043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2546	NC_020941	TCT	2	6	116096	116101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478456835
2547	NC_020941	AAGC	2	8	116105	116112	50 %	0 %	25 %	25 %	478456835
2548	NC_020941	TATCG	2	10	116113	116122	20 %	40 %	20 %	20 %	478456835
2549	NC_020941	T	6	6	116129	116134	0 %	100 %	0 %	0 %	478456835
2550	NC_020941	ATG	2	6	116170	116175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_020941	AGT	2	6	116204	116209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_020941	A	6	6	116225	116230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_020941	TAA	2	6	116256	116261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_020941	A	7	7	116278	116284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_020941	TTTTAG	2	12	116306	116317	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_020941	TG	3	6	116322	116327	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_020941	GGTT	2	8	116437	116444	0 %	50 %	50 %	0 %	478456836
2558	NC_020941	T	7	7	116453	116459	0 %	100 %	0 %	0 %	478456836
2559	NC_020941	GCT	2	6	116579	116584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456836
2560	NC_020941	TTTCT	2	10	116629	116638	0 %	80 %	0 %	20 %	478456836
2561	NC_020941	ACA	2	6	116666	116671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478456836
2562	NC_020941	TAT	2	6	116854	116859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456836
2563	NC_020941	TATC	2	8	116886	116893	25 %	50 %	0 %	25 %	478456836
2564	NC_020941	TTTG	2	8	116983	116990	0 %	75 %	25 %	0 %	478456836
2565	NC_020941	AGG	3	9	116995	117003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456836
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2567	NC_020941	GA	3	6	117070	117075	50 %	0 %	50 %	0 %	478456836
2568	NC_020941	A	6	6	117123	117128	100 %	0 %	0 %	0 %	478456836
2569	NC_020941	GTTC	2	8	117179	117186	0 %	50 %	25 %	25 %	478456836
2570	NC_020941	TAA	2	6	117199	117204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456836
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2572	NC_020941	GCT	2	6	117233	117238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456836
2573	NC_020941	AGG	2	6	117283	117288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478456836
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2579	NC_020941	TGC	2	6	117627	117632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478456837
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2588	NC_020941	TTG	2	6	117951	117956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_020941	CAA	2	6	117967	117972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2590	NC_020941	AGA	2	6	117973	117978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_020941	AAG	2	6	118019	118024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456838
2592	NC_020941	TAA	2	6	118032	118037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456838
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2594	NC_020941	CA	3	6	118240	118245	50 %	0 %	0 %	50 %	478456838
2595	NC_020941	ATC	2	6	118288	118293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_020941	T	6	6	118302	118307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_020941	TAA	2	6	118359	118364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_020941	AT	3	6	118446	118451	50 %	50 %	0 %	0 %	478456839
2599	NC_020941	T	6	6	118456	118461	0 %	100 %	0 %	0 %	478456839
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2602	NC_020941	GTAG	2	8	118544	118551	25 %	25 %	50 %	0 %	478456839
2603	NC_020941	G	6	6	118592	118597	0 %	0 %	100 %	0 %	478456839
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2605	NC_020941	GTT	2	6	118733	118738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456839
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2607	NC_020941	TTA	2	6	118763	118768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456839
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2609	NC_020941	A	8	8	118818	118825	100 %	0 %	0 %	0 %	478456839
2610	NC_020941	CTC	2	6	118833	118838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456839
2611	NC_020941	AAAGA	2	10	118874	118883	80 %	0 %	20 %	0 %	478456839
2612	NC_020941	AAT	2	6	118884	118889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478456839
2613	NC_020941	AG	4	8	118908	118915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_020941	CTT	2	6	118916	118921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2615	NC_020941	TTA	2	6	118938	118943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478456840
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2618	NC_020941	TCC	2	6	119142	119147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478456840
2619	NC_020941	TTTA	2	8	119160	119167	25 %	75 %	0 %	0 %	478456840
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2623	NC_020941	GA	4	8	119433	119440	50 %	0 %	50 %	0 %	478456840
2624	NC_020941	GAA	2	6	119447	119452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478456840
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2626	NC_020941	TACT	2	8	119548	119555	25 %	50 %	0 %	25 %	478456840
2627	NC_020941	GTT	2	6	119592	119597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478456840
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2653	NC_020941	GA	3	6	120730	120735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_020941	TAT	2	6	120754	120759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2655	NC_020941	ATA	2	6	120775	120780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2746	NC_020941	ATAA	2	8	125086	125093	75 %	25 %	0 %	0 %	478456844
2747	NC_020941	T	6	6	125109	125114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2748	NC_020941	T	7	7	125134	125140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2998	NC_020941	CAG	2	6	135773	135778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478456852
2999	NC_020941	A	6	6	135851	135856	100 %	0 %	0 %	0 %	478456852
3000	NC_020941	AGG	2	6	135925	135930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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