MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/SotonG1 complete genome

Total Repeats: 22938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_020941	TTA	2	6	634104	634109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457311
14003	NC_020941	CCTC	2	8	634143	634150	0 %	25 %	0 %	75 %	478457311
14004	NC_020941	ATC	2	6	634181	634186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457311
14005	NC_020941	AAC	2	6	634308	634313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457311
14006	NC_020941	A	7	7	634327	634333	100 %	0 %	0 %	0 %	478457311
14007	NC_020941	CT	3	6	634361	634366	0 %	50 %	0 %	50 %	478457311
14008	NC_020941	A	6	6	634487	634492	100 %	0 %	0 %	0 %	478457311
14009	NC_020941	AAGA	2	8	634529	634536	75 %	0 %	25 %	0 %	478457311
14010	NC_020941	GATT	2	8	634557	634564	25 %	50 %	25 %	0 %	478457312
14011	NC_020941	TCT	2	6	634575	634580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457312
14012	NC_020941	GCA	2	6	634628	634633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478457312
14013	NC_020941	CTT	2	6	634644	634649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457312
14014	NC_020941	CTC	2	6	634668	634673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457312
14015	NC_020941	A	6	6	634698	634703	100 %	0 %	0 %	0 %	478457312
14016	NC_020941	CCT	2	6	634763	634768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457312
14017	NC_020941	AAG	2	6	634770	634775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457312
14018	NC_020941	TCC	2	6	634781	634786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457312
14019	NC_020941	CCT	2	6	634878	634883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457312
14020	NC_020941	ATT	2	6	634895	634900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457312
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14022	NC_020941	CCT	2	6	634943	634948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457312
14023	NC_020941	A	6	6	635030	635035	100 %	0 %	0 %	0 %	478457312
14024	NC_020941	TCGAG	2	10	635040	635049	20 %	20 %	40 %	20 %	478457312
14025	NC_020941	T	6	6	635067	635072	0 %	100 %	0 %	0 %	478457312
14026	NC_020941	TTG	2	6	635097	635102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457312
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14029	NC_020941	ATC	2	6	635243	635248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457312
14030	NC_020941	TCA	2	6	635259	635264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457312
14031	NC_020941	CTTT	2	8	635313	635320	0 %	75 %	0 %	25 %	478457312
14032	NC_020941	ATG	3	9	635363	635371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457312
14033	NC_020941	TC	4	8	635388	635395	0 %	50 %	0 %	50 %	478457312
14034	NC_020941	CTA	2	6	635441	635446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457312
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14038	NC_020941	TTA	2	6	635545	635550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457313
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14040	NC_020941	TAT	2	6	635574	635579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457313
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14052	NC_020941	TGC	2	6	635978	635983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457314
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14054	NC_020941	TGC	2	6	636108	636113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457314
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14056	NC_020941	CT	3	6	636174	636179	0 %	50 %	0 %	50 %	478457314
14057	NC_020941	ATT	2	6	636221	636226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478457314
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14071	NC_020941	A	6	6	636668	636673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14074	NC_020941	TGC	2	6	636751	636756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457315
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14110	NC_020941	TCCAT	2	10	638374	638383	20 %	40 %	0 %	40 %	478457317
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14123	NC_020941	ACAT	2	8	638939	638946	50 %	25 %	0 %	25 %	478457318
14124	NC_020941	CAA	2	6	638949	638954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457318
14125	NC_020941	GA	3	6	638975	638980	50 %	0 %	50 %	0 %	478457318
14126	NC_020941	TCC	2	6	639011	639016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457318
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14128	NC_020941	ATGC	2	8	639038	639045	25 %	25 %	25 %	25 %	478457318
14129	NC_020941	ACGA	2	8	639078	639085	50 %	0 %	25 %	25 %	478457318
14130	NC_020941	GA	4	8	639137	639144	50 %	0 %	50 %	0 %	478457318
14131	NC_020941	AAG	2	6	639145	639150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457318
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14134	NC_020941	ACA	2	6	639240	639245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457319
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14138	NC_020941	AAG	2	6	639302	639307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457319
14139	NC_020941	TTTC	2	8	639308	639315	0 %	75 %	0 %	25 %	478457319
14140	NC_020941	CAC	2	6	639324	639329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478457319
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14142	NC_020941	CAT	2	6	639401	639406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457319
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14145	NC_020941	CAT	2	6	639527	639532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457319
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14147	NC_020941	TTC	2	6	639570	639575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457319
14148	NC_020941	CCT	2	6	639584	639589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14149	NC_020941	GAA	2	6	639623	639628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457320
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14153	NC_020941	TCC	2	6	639852	639857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478457320
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14176	NC_020941	CCT	2	6	640774	640779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14177	NC_020941	CGGAA	2	10	640990	640999	40 %	0 %	40 %	20 %	478457321
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14179	NC_020941	CA	3	6	641087	641092	50 %	0 %	0 %	50 %	478457321
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14186	NC_020941	GTC	2	6	641487	641492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457321
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14223	NC_020941	T	7	7	643145	643151	0 %	100 %	0 %	0 %	478457322
14224	NC_020941	CAA	2	6	643170	643175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478457322
14225	NC_020941	ATCTTG	2	12	643177	643188	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478457322
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14227	NC_020941	CTT	2	6	643268	643273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457322
14228	NC_020941	ACT	2	6	643362	643367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478457322
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14230	NC_020941	CT	3	6	643483	643488	0 %	50 %	0 %	50 %	478457322
14231	NC_020941	AGCG	2	8	643558	643565	25 %	0 %	50 %	25 %	478457322
14232	NC_020941	AGA	2	6	643605	643610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457322
14233	NC_020941	TCT	2	6	643612	643617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457322
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14235	NC_020941	GCT	2	6	643645	643650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478457322
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14237	NC_020941	C	6	6	643794	643799	0 %	0 %	0 %	100 %	478457322
14238	NC_020941	AGA	2	6	643878	643883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478457322
14239	NC_020941	CTT	2	6	644063	644068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457322
14240	NC_020941	GAT	2	6	644186	644191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478457322
14241	NC_020941	C	9	9	644216	644224	0 %	0 %	0 %	100 %	478457322
14242	NC_020941	GTT	2	6	644270	644275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478457322
14243	NC_020941	TC	3	6	644324	644329	0 %	50 %	0 %	50 %	478457322
14244	NC_020941	GA	3	6	644340	644345	50 %	0 %	50 %	0 %	478457322
14245	NC_020941	CTT	2	6	644351	644356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478457322
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14282	NC_020941	A	7	7	645886	645892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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