MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis Ia/SotonIa3 complete genome

Total Repeats: 22983

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020940	GA	3	6	251298	251303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_020940	ACT	2	6	251358	251363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_020940	TG	3	6	251408	251413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_020940	AATA	2	8	251475	251482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_020940	T	6	6	251497	251502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_020940	T	7	7	251516	251522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_020940	A	6	6	251524	251529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_020940	ACA	2	6	251624	251629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_020940	CTT	2	6	251631	251636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_020940	AAG	2	6	251662	251667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_020940	GCA	2	6	251681	251686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_020940	TTG	2	6	251701	251706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_020940	CAAA	2	8	251865	251872	75 %	0 %	0 %	25 %	478474991
5514	NC_020940	ATA	2	6	251888	251893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478474991
5515	NC_020940	CAAT	2	8	251975	251982	50 %	25 %	0 %	25 %	478474991
5516	NC_020940	CTTT	3	12	252027	252038	0 %	75 %	0 %	25 %	478474991
5517	NC_020940	CGA	2	6	252069	252074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474991
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5519	NC_020940	ACA	2	6	252102	252107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478474991
5520	NC_020940	CTC	2	6	252121	252126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_020940	CAA	2	6	252165	252170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_020940	AG	3	6	252210	252215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_020940	A	7	7	252216	252222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_020940	AAG	2	6	252233	252238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_020940	CAT	4	12	252283	252294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478474992
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5527	NC_020940	CTC	2	6	252460	252465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478474992
5528	NC_020940	AGT	2	6	252484	252489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478474992
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5530	NC_020940	TCTT	2	8	252548	252555	0 %	75 %	0 %	25 %	478474992
5531	NC_020940	C	7	7	252560	252566	0 %	0 %	0 %	100 %	478474992
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5535	NC_020940	TC	3	6	252650	252655	0 %	50 %	0 %	50 %	478474992
5536	NC_020940	TTG	2	6	252707	252712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474992
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5539	NC_020940	AGA	3	9	252859	252867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474992
5540	NC_020940	GGC	2	6	252870	252875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478474992
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5542	NC_020940	CAC	2	6	252907	252912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478474992
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5545	NC_020940	TCC	2	6	253073	253078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5546	NC_020940	GAAA	2	8	253094	253101	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_020940	T	7	7	253115	253121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020940	GCAG	2	8	253143	253150	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_020940	AG	3	6	253218	253223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020940	TAT	2	6	253241	253246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020940	ACA	2	6	253282	253287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_020940	A	6	6	253331	253336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_020940	A	6	6	253471	253476	100 %	0 %	0 %	0 %	478474993
5554	NC_020940	TTG	2	6	253511	253516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478474993
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5557	NC_020940	T	7	7	253616	253622	0 %	100 %	0 %	0 %	478474993
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5597	NC_020940	TA	3	6	255024	255029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_020940	CCAA	2	8	255059	255066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_020940	A	7	7	255083	255089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5604	NC_020940	CGA	2	6	255329	255334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478474996
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5607	NC_020940	A	6	6	255493	255498	100 %	0 %	0 %	0 %	478474996
5608	NC_020940	A	7	7	255524	255530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_020940	ATA	2	6	255537	255542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_020940	AACCCT	2	12	255583	255594	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
5611	NC_020940	AAAC	2	8	255666	255673	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5612	NC_020940	AAG	2	6	255790	255795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478474997
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5617	NC_020940	T	6	6	256077	256082	0 %	100 %	0 %	0 %	478474997
5618	NC_020940	CA	3	6	256136	256141	50 %	0 %	0 %	50 %	478474997
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5626	NC_020940	GAG	2	6	256515	256520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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