MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 23054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_020939	GCA	2	6	631339	631344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449191
14003	NC_020939	AGGA	2	8	631540	631547	50 %	0 %	50 %	0 %	478449191
14004	NC_020939	GCA	2	6	631592	631597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449191
14005	NC_020939	TCT	2	6	631610	631615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449191
14006	NC_020939	A	6	6	631805	631810	100 %	0 %	0 %	0 %	478449191
14007	NC_020939	ATT	2	6	631816	631821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449191
14008	NC_020939	GGT	2	6	631825	631830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449191
14009	NC_020939	AAGC	2	8	631892	631899	50 %	0 %	25 %	25 %	478449191
14010	NC_020939	AAT	2	6	631918	631923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449191
14011	NC_020939	GAA	2	6	632050	632055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449191
14012	NC_020939	TGA	2	6	632133	632138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449191
14013	NC_020939	TCA	2	6	632241	632246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449191
14014	NC_020939	GCA	2	6	632257	632262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449191
14015	NC_020939	CAG	2	6	632360	632365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449191
14016	NC_020939	CAA	3	9	632368	632376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449191
14017	NC_020939	A	6	6	632375	632380	100 %	0 %	0 %	0 %	478449191
14018	NC_020939	ACT	2	6	632476	632481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449191
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14023	NC_020939	A	6	6	632706	632711	100 %	0 %	0 %	0 %	478449192
14024	NC_020939	ATA	2	6	632782	632787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449192
14025	NC_020939	TTG	2	6	632849	632854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449192
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14028	NC_020939	TGA	2	6	633032	633037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449192
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14031	NC_020939	CA	3	6	633087	633092	50 %	0 %	0 %	50 %	478449192
14032	NC_020939	TGC	2	6	633146	633151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449192
14033	NC_020939	CTAT	2	8	633181	633188	25 %	50 %	0 %	25 %	478449192
14034	NC_020939	ACTC	2	8	633215	633222	25 %	25 %	0 %	50 %	478449192
14035	NC_020939	CTAC	2	8	633241	633248	25 %	25 %	0 %	50 %	478449192
14036	NC_020939	ATG	2	6	633261	633266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449192
14037	NC_020939	TGA	2	6	633298	633303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449192
14038	NC_020939	ATT	2	6	633469	633474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449192
14039	NC_020939	TTTA	2	8	633504	633511	25 %	75 %	0 %	0 %	478449192
14040	NC_020939	TTCG	2	8	633522	633529	0 %	50 %	25 %	25 %	478449192
14041	NC_020939	AACCTC	2	12	633578	633589	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	478449192
14042	NC_020939	A	6	6	633651	633656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14043	NC_020939	TGG	2	6	633691	633696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_020939	T	6	6	633748	633753	0 %	100 %	0 %	0 %	478449193
14045	NC_020939	TCT	2	6	633767	633772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449193
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14052	NC_020939	AAG	2	6	634073	634078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449193
14053	NC_020939	TCG	2	6	634124	634129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449193
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14056	NC_020939	TAT	2	6	634233	634238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449193
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14069	NC_020939	TCCC	2	8	634895	634902	0 %	25 %	0 %	75 %	478449194
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14078	NC_020939	ACGGA	2	10	635233	635242	40 %	0 %	40 %	20 %	478449194
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14087	NC_020939	A	6	6	635676	635681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14088	NC_020939	CCTG	2	8	635767	635774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14093	NC_020939	TC	3	6	635867	635872	0 %	50 %	0 %	50 %	478449195
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14102	NC_020939	CT	3	6	636303	636308	0 %	50 %	0 %	50 %	478449195
14103	NC_020939	A	6	6	636429	636434	100 %	0 %	0 %	0 %	478449195
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14106	NC_020939	GATT	2	8	636499	636506	25 %	50 %	25 %	0 %	478449196
14107	NC_020939	TCT	2	6	636517	636522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449196
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14109	NC_020939	CTT	2	6	636586	636591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449196
14110	NC_020939	CTC	2	6	636610	636615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449196
14111	NC_020939	A	6	6	636640	636645	100 %	0 %	0 %	0 %	478449196
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14118	NC_020939	CCT	2	6	636885	636890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449196
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14246	NC_020939	TTC	2	6	641513	641518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449203
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14274	NC_020939	CCT	2	6	642717	642722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14275	NC_020939	CGGAA	2	10	642933	642942	40 %	0 %	40 %	20 %	478449205
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14284	NC_020939	GTC	2	6	643430	643435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449205
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14293	NC_020939	TA	3	6	643992	643997	50 %	50 %	0 %	0 %	478449205
14294	NC_020939	AAT	2	6	644014	644019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449205
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14300	NC_020939	CAT	2	6	644224	644229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449205
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14354	NC_020939	CTG	2	6	646910	646915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449207
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14489	NC_020939	GCTTCT	2	12	652280	652291	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478449212
14490	NC_020939	AGC	2	6	652317	652322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449212
14491	NC_020939	GAAA	2	8	652339	652346	75 %	0 %	25 %	0 %	478449212
14492	NC_020939	AGCT	2	8	652393	652400	25 %	25 %	25 %	25 %	478449212
14493	NC_020939	CAA	2	6	652403	652408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478449212
14494	NC_020939	AGA	2	6	652414	652419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449212
14495	NC_020939	TCT	2	6	652442	652447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449212
14496	NC_020939	CTA	2	6	652521	652526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449212
14497	NC_020939	AAG	2	6	652590	652595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449212
14498	NC_020939	AGC	2	6	652654	652659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449212
14499	NC_020939	A	7	7	652760	652766	100 %	0 %	0 %	0 %	478449212
14500	NC_020939	TGA	2	6	652824	652829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449212

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