MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis A/5291 complete genome

Total Repeats: 23054

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020939	TCT	2	6	250746	250751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448840
5502	NC_020939	TTC	2	6	250782	250787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448840
5503	NC_020939	CAA	2	6	250838	250843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448840
5504	NC_020939	TTTC	2	8	250846	250853	0 %	75 %	0 %	25 %	478448840
5505	NC_020939	T	6	6	250880	250885	0 %	100 %	0 %	0 %	478448840
5506	NC_020939	GTG	2	6	250936	250941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478448841
5507	NC_020939	GTATT	2	10	250961	250970	20 %	60 %	20 %	0 %	478448841
5508	NC_020939	CAT	2	6	251008	251013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448841
5509	NC_020939	TCA	2	6	251021	251026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448841
5510	NC_020939	A	6	6	251042	251047	100 %	0 %	0 %	0 %	478448841
5511	NC_020939	TAT	2	6	251053	251058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448841
5512	NC_020939	T	6	6	251076	251081	0 %	100 %	0 %	0 %	478448841
5513	NC_020939	TTC	2	6	251117	251122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448841
5514	NC_020939	AT	3	6	251126	251131	50 %	50 %	0 %	0 %	478448841
5515	NC_020939	ATC	2	6	251151	251156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448841
5516	NC_020939	TAT	2	6	251181	251186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478448841
5517	NC_020939	GCA	2	6	251212	251217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448841
5518	NC_020939	AAG	2	6	251247	251252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448841
5519	NC_020939	GAAA	2	8	251271	251278	75 %	0 %	25 %	0 %	478448841
5520	NC_020939	A	6	6	251276	251281	100 %	0 %	0 %	0 %	478448841
5521	NC_020939	CTC	2	6	251309	251314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448841
5522	NC_020939	CTCC	2	8	251371	251378	0 %	25 %	0 %	75 %	478448841
5523	NC_020939	AGA	2	6	251412	251417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448841
5524	NC_020939	TCT	2	6	251566	251571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448842
5525	NC_020939	AGA	2	6	251626	251631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448842
5526	NC_020939	ACC	2	6	251652	251657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448842
5527	NC_020939	TGCA	2	8	251661	251668	25 %	25 %	25 %	25 %	478448842
5528	NC_020939	GCC	2	6	251850	251855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478448842
5529	NC_020939	GAA	2	6	251868	251873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448842
5530	NC_020939	CT	3	6	251909	251914	0 %	50 %	0 %	50 %	478448842
5531	NC_020939	GAT	2	6	251925	251930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448842
5532	NC_020939	TCCGT	2	10	251941	251950	0 %	40 %	20 %	40 %	478448842
5533	NC_020939	CTC	2	6	251957	251962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448842
5534	NC_020939	AAT	2	6	251970	251975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448842
5535	NC_020939	CCA	2	6	252004	252009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448842
5536	NC_020939	ATA	2	6	252106	252111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448842
5537	NC_020939	ATC	2	6	252121	252126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448842
5538	NC_020939	ATG	2	6	252166	252171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448842
5539	NC_020939	ACA	2	6	252185	252190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448842
5540	NC_020939	GGAA	2	8	252202	252209	50 %	0 %	50 %	0 %	478448842
5541	NC_020939	GCT	2	6	252229	252234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448842
5542	NC_020939	CCA	2	6	252256	252261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448842
5543	NC_020939	GA	3	6	252422	252427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_020939	GCG	2	6	252462	252467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_020939	ACT	2	6	252482	252487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_020939	TG	3	6	252532	252537	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_020939	AATA	2	8	252599	252606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_020939	T	6	6	252621	252626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020939	T	7	7	252640	252646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020939	A	6	6	252648	252653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020939	ACA	2	6	252748	252753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_020939	CTT	2	6	252755	252760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_020939	AAG	2	6	252786	252791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_020939	GCA	2	6	252805	252810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_020939	TTG	2	6	252825	252830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_020939	CAAA	2	8	252989	252996	75 %	0 %	0 %	25 %	478448843
5557	NC_020939	ATA	2	6	253012	253017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478448843
5558	NC_020939	CAAT	2	8	253099	253106	50 %	25 %	0 %	25 %	478448843
5559	NC_020939	CTTT	3	12	253151	253162	0 %	75 %	0 %	25 %	478448843
5560	NC_020939	CGA	2	6	253193	253198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478448843
5561	NC_020939	CTT	2	6	253204	253209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448843
5562	NC_020939	ACA	2	6	253226	253231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448843
5563	NC_020939	CTC	2	6	253245	253250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_020939	CAA	2	6	253289	253294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_020939	AG	3	6	253334	253339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_020939	A	8	8	253340	253347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_020939	AAG	2	6	253358	253363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_020939	CAT	4	12	253408	253419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448844
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5571	NC_020939	AGT	2	6	253609	253614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478448844
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5573	NC_020939	TCTT	2	8	253673	253680	0 %	75 %	0 %	25 %	478448844
5574	NC_020939	C	7	7	253685	253691	0 %	0 %	0 %	100 %	478448844
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5579	NC_020939	TTG	2	6	253832	253837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448844
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5581	NC_020939	TCGC	2	8	253877	253884	0 %	25 %	25 %	50 %	478448844
5582	NC_020939	CAA	2	6	253911	253916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448844
5583	NC_020939	AGA	3	9	253984	253992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478448844
5584	NC_020939	GGC	2	6	253995	254000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478448844
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5588	NC_020939	ACA	2	6	254073	254078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448844
5589	NC_020939	T	8	8	254107	254114	0 %	100 %	0 %	0 %	478448844
5590	NC_020939	TCC	2	6	254198	254203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_020939	T	7	7	254240	254246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020939	TAT	2	6	254366	254371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020939	ACA	2	6	254407	254412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_020939	A	6	6	254456	254461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_020939	TTG	2	6	254636	254641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448845
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5597	NC_020939	T	7	7	254741	254747	0 %	100 %	0 %	0 %	478448845
5598	NC_020939	CCA	2	6	254754	254759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478448845
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5601	NC_020939	GCT	2	6	254871	254876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478448845
5602	NC_020939	ACA	2	6	254936	254941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448845
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5604	NC_020939	CAA	2	6	255016	255021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448845
5605	NC_020939	CCCA	2	8	255124	255131	25 %	0 %	0 %	75 %	478448846
5606	NC_020939	CA	3	6	255164	255169	50 %	0 %	0 %	50 %	478448846
5607	NC_020939	CTT	2	6	255253	255258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448846
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5610	NC_020939	ACT	2	6	255351	255356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478448846
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5612	NC_020939	CTC	2	6	255400	255405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478448846
5613	NC_020939	GCAA	2	8	255414	255421	50 %	0 %	25 %	25 %	478448846
5614	NC_020939	AAC	2	6	255431	255436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478448846
5615	NC_020939	GTT	2	6	255476	255481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478448846
5616	NC_020939	AAC	2	6	255515	255520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_020939	A	6	6	255529	255534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_020939	TAA	2	6	255580	255585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_020939	TTC	2	6	255598	255603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448847
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5621	NC_020939	T	7	7	255639	255645	0 %	100 %	0 %	0 %	478448847
5622	NC_020939	AGCA	2	8	255676	255683	50 %	0 %	25 %	25 %	478448847
5623	NC_020939	CTT	2	6	255693	255698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448847
5624	NC_020939	TCT	3	9	255704	255712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478448847
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