MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/795 complete genome

Total Repeats: 22940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_020938	AATA	2	8	249374	249381	75 %	25 %	0 %	0 %	478469588
5503	NC_020938	GCT	2	6	249384	249389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478469588
5504	NC_020938	ACA	2	6	249449	249454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478469588
5505	NC_020938	CCA	2	6	249481	249486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478469588
5506	NC_020938	CAA	2	6	249529	249534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478469588
5507	NC_020938	CCCA	2	8	249654	249661	25 %	0 %	0 %	75 %	478469589
5508	NC_020938	CTT	2	6	249783	249788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478469589
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5511	NC_020938	ACT	2	6	249881	249886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478469589
5512	NC_020938	GAA	2	6	249899	249904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478469589
5513	NC_020938	CTC	2	6	249930	249935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478469589
5514	NC_020938	GCAA	2	8	249944	249951	50 %	0 %	25 %	25 %	478469589
5515	NC_020938	AAC	2	6	249961	249966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478469589
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5517	NC_020938	AAC	2	6	250045	250050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_020938	A	6	6	250059	250064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_020938	TAA	2	6	250110	250115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020938	TTC	2	6	250128	250133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478469590
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5522	NC_020938	T	7	7	250169	250175	0 %	100 %	0 %	0 %	478469590
5523	NC_020938	AGCA	2	8	250206	250213	50 %	0 %	25 %	25 %	478469590
5524	NC_020938	CTT	2	6	250223	250228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478469590
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5529	NC_020938	TCC	2	6	250368	250373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478469590
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5539	NC_020938	TA	3	6	250677	250682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_020938	CCAA	2	8	250712	250719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_020938	A	7	7	250736	250742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_020938	TAT	2	6	250755	250760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478469591
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5545	NC_020938	TGTT	2	8	250861	250868	0 %	75 %	25 %	0 %	478469591
5546	NC_020938	CGA	2	6	250982	250987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478469591
5547	NC_020938	GCAAA	2	10	250994	251003	60 %	0 %	20 %	20 %	478469591
5548	NC_020938	AATA	2	8	251080	251087	75 %	25 %	0 %	0 %	478469591
5549	NC_020938	A	6	6	251146	251151	100 %	0 %	0 %	0 %	478469591
5550	NC_020938	A	7	7	251177	251183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020938	ATA	2	6	251191	251196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020938	CCT	2	6	251246	251251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_020938	AAAC	2	8	251320	251327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_020938	AAG	2	6	251444	251449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478469592
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5556	NC_020938	CAAT	2	8	251584	251591	50 %	25 %	0 %	25 %	478469592
5557	NC_020938	TTA	2	6	251656	251661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478469592
5558	NC_020938	CTTCT	2	10	251688	251697	0 %	60 %	0 %	40 %	478469592
5559	NC_020938	T	6	6	251731	251736	0 %	100 %	0 %	0 %	478469592
5560	NC_020938	CA	3	6	251790	251795	50 %	0 %	0 %	50 %	478469592
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5567	NC_020938	GAG	2	6	252169	252174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5584	NC_020938	CAG	2	6	252610	252615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478469593
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5592	NC_020938	AG	3	6	252968	252973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020938	A	8	8	252986	252993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_020938	TC	3	6	252994	252999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_020938	TC	3	6	253080	253085	0 %	50 %	0 %	50 %	478469594
5596	NC_020938	A	6	6	253089	253094	100 %	0 %	0 %	0 %	478469594
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5599	NC_020938	T	7	7	253191	253197	0 %	100 %	0 %	0 %	478469594
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5602	NC_020938	T	6	6	253232	253237	0 %	100 %	0 %	0 %	478469594
5603	NC_020938	CT	4	8	253300	253307	0 %	50 %	0 %	50 %	478469594
5604	NC_020938	TTA	2	6	253365	253370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478469594
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5612	NC_020938	TC	3	6	253791	253796	0 %	50 %	0 %	50 %	478469594
5613	NC_020938	TCT	2	6	253853	253858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478469594
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5615	NC_020938	GTTTT	2	10	253926	253935	0 %	80 %	20 %	0 %	478469594
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5624	NC_020938	A	6	6	254249	254254	100 %	0 %	0 %	0 %	478469594
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