MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/440/LN complete genome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020937	AAG	3	9	181540	181548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447879
4003	NC_020937	TGA	2	6	181661	181666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020937	TTCC	2	8	181791	181798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_020937	ACA	2	6	181818	181823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_020937	TCTA	2	8	181859	181866	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_020937	GAA	2	6	181938	181943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_020937	ATT	2	6	181974	181979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_020937	AATT	2	8	181993	182000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020937	TGT	2	6	182017	182022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020937	T	6	6	182121	182126	0 %	100 %	0 %	0 %	478447880
4012	NC_020937	TTGAA	2	10	182147	182156	40 %	40 %	20 %	0 %	478447880
4013	NC_020937	TTTG	2	8	182161	182168	0 %	75 %	25 %	0 %	478447880
4014	NC_020937	ATC	2	6	182258	182263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478447880
4015	NC_020937	TGCA	2	8	182279	182286	25 %	25 %	25 %	25 %	478447880
4016	NC_020937	TGT	2	6	182297	182302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478447880
4017	NC_020937	AGT	2	6	182316	182321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478447880
4018	NC_020937	CT	3	6	182361	182366	0 %	50 %	0 %	50 %	478447880
4019	NC_020937	T	6	6	182366	182371	0 %	100 %	0 %	0 %	478447880
4020	NC_020937	GA	3	6	182440	182445	50 %	0 %	50 %	0 %	478447880
4021	NC_020937	GAT	2	6	182495	182500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478447880
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4023	NC_020937	CGA	2	6	182829	182834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478447880
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4026	NC_020937	GTTT	2	8	182951	182958	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020937	TGAGT	2	10	182961	182970	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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4035	NC_020937	AGAAA	2	10	183325	183334	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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4039	NC_020937	A	6	6	183396	183401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020937	TCG	2	6	183436	183441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478447882
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4043	NC_020937	T	7	7	183473	183479	0 %	100 %	0 %	0 %	478447882
4044	NC_020937	AAG	2	6	183526	183531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478447882
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4051	NC_020937	CT	3	6	183782	183787	0 %	50 %	0 %	50 %	478447882
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4069	NC_020937	GCA	2	6	184228	184233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4097	NC_020937	GA	3	6	185151	185156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4111	NC_020937	TTA	2	6	186204	186209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478447885
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4126	NC_020937	T	6	6	186963	186968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_020937	T	7	7	187058	187064	0 %	100 %	0 %	0 %	478447887
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