MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 2845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020936	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478450426
2	NC_020936	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478450426
3	NC_020936	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478450426
4	NC_020936	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478450426
5	NC_020936	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478450426
6	NC_020936	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478450426
7	NC_020936	AAGG	2	8	1906	1913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020936	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478450427
9	NC_020936	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478450428
10	NC_020936	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478450428
11	NC_020936	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478450429
12	NC_020936	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478450429
13	NC_020936	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478450430
14	NC_020936	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478450430
15	NC_020936	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478450430
16	NC_020936	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478450430
17	NC_020936	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478450431
18	NC_020936	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478450431
19	NC_020936	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478450431
20	NC_020936	GGAG	2	8	6903	6910	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020936	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478450432
22	NC_020936	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478450432
23	NC_020936	TATG	2	8	7552	7559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020936	ATTT	2	8	7693	7700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020936	TTTG	2	8	7785	7792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020936	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478450433
27	NC_020936	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478450434
28	NC_020936	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478450434
29	NC_020936	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478450434
30	NC_020936	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478450434
31	NC_020936	TATT	2	8	9908	9915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020936	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478450435
33	NC_020936	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478450435
34	NC_020936	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478450435
35	NC_020936	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478450436
36	NC_020936	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478450436
37	NC_020936	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478450436
38	NC_020936	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478450436
39	NC_020936	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020936	GTTT	2	8	13158	13165	0 %	75 %	25 %	0 %	478450438
41	NC_020936	ATGC	2	8	13588	13595	25 %	25 %	25 %	25 %	478450438
42	NC_020936	AAGG	2	8	14023	14030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020936	TTGT	2	8	14624	14631	0 %	75 %	25 %	0 %	478450439
44	NC_020936	TTCT	2	8	14795	14802	0 %	75 %	0 %	25 %	478450439
45	NC_020936	ATTT	2	8	15001	15008	25 %	75 %	0 %	0 %	478450439
46	NC_020936	TTTC	2	8	15663	15670	0 %	75 %	0 %	25 %	478450440
47	NC_020936	AAAT	2	8	16145	16152	75 %	25 %	0 %	0 %	478450440
48	NC_020936	CAAA	2	8	16657	16664	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020936	CTAT	2	8	16844	16851	25 %	50 %	0 %	25 %	478450441
50	NC_020936	GTAA	2	8	16987	16994	50 %	25 %	25 %	0 %	478450441
51	NC_020936	CTAA	2	8	17180	17187	50 %	25 %	0 %	25 %	478450441
52	NC_020936	AGAA	2	8	17443	17450	75 %	0 %	25 %	0 %	478450441
53	NC_020936	ATTT	2	8	17589	17596	25 %	75 %	0 %	0 %	478450441
54	NC_020936	TGCG	2	8	19111	19118	0 %	25 %	50 %	25 %	478450443
55	NC_020936	GAAG	2	8	20095	20102	50 %	0 %	50 %	0 %	478450443
56	NC_020936	GCCA	2	8	21605	21612	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020936	CGCT	2	8	21853	21860	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020936	TTAA	2	8	21874	21881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020936	GTTA	2	8	21911	21918	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020936	GATC	2	8	21966	21973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020936	GATG	2	8	22229	22236	25 %	25 %	50 %	0 %	478450445
62	NC_020936	CATT	2	8	23288	23295	25 %	50 %	0 %	25 %	478450445
63	NC_020936	GCTT	2	8	23631	23638	0 %	50 %	25 %	25 %	478450445
64	NC_020936	GGTT	2	8	23679	23686	0 %	50 %	50 %	0 %	478450445
65	NC_020936	TTCT	2	8	24049	24056	0 %	75 %	0 %	25 %	478450445
66	NC_020936	TAAC	2	8	24151	24158	50 %	25 %	0 %	25 %	478450445
67	NC_020936	CATT	2	8	24274	24281	25 %	50 %	0 %	25 %	478450445
68	NC_020936	GGTA	2	8	24644	24651	25 %	25 %	50 %	0 %	478450445
69	NC_020936	TTGA	2	8	25639	25646	25 %	50 %	25 %	0 %	478450446
70	NC_020936	TAGG	2	8	25863	25870	25 %	25 %	50 %	0 %	478450446
71	NC_020936	TTCC	2	8	25987	25994	0 %	50 %	0 %	50 %	478450446
72	NC_020936	TAGG	2	8	26101	26108	25 %	25 %	50 %	0 %	478450446
73	NC_020936	GCTT	2	8	26873	26880	0 %	50 %	25 %	25 %	478450446
74	NC_020936	GGAA	2	8	27456	27463	50 %	0 %	50 %	0 %	478450447
75	NC_020936	TTAA	2	8	27529	27536	50 %	50 %	0 %	0 %	478450447
76	NC_020936	AAAG	2	8	27579	27586	75 %	0 %	25 %	0 %	478450447
77	NC_020936	GTTT	2	8	28142	28149	0 %	75 %	25 %	0 %	478450448
78	NC_020936	CAGA	2	8	28164	28171	50 %	0 %	25 %	25 %	478450448
79	NC_020936	ATTG	2	8	28523	28530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020936	CTTT	2	8	30136	30143	0 %	75 %	0 %	25 %	478450450
81	NC_020936	TTTG	2	8	30151	30158	0 %	75 %	25 %	0 %	478450450
82	NC_020936	TTGT	2	8	30186	30193	0 %	75 %	25 %	0 %	478450450
83	NC_020936	TGGC	2	8	30349	30356	0 %	25 %	50 %	25 %	478450450
84	NC_020936	AAAG	2	8	30909	30916	75 %	0 %	25 %	0 %	478450451
85	NC_020936	AAAC	2	8	30979	30986	75 %	0 %	0 %	25 %	478450451
86	NC_020936	GATG	2	8	31122	31129	25 %	25 %	50 %	0 %	478450451
87	NC_020936	GATA	2	8	32231	32238	50 %	25 %	25 %	0 %	478450453
88	NC_020936	TGAT	2	8	34726	34733	25 %	50 %	25 %	0 %	478450456
89	NC_020936	AAGA	3	12	34854	34865	75 %	0 %	25 %	0 %	478450456
90	NC_020936	AAGC	2	8	35074	35081	50 %	0 %	25 %	25 %	478450457
91	NC_020936	GTTC	2	8	35107	35114	0 %	50 %	25 %	25 %	478450457
92	NC_020936	GGCA	2	8	35486	35493	25 %	0 %	50 %	25 %	478450458
93	NC_020936	TGCT	2	8	35896	35903	0 %	50 %	25 %	25 %	478450458
94	NC_020936	TTGG	2	8	36128	36135	0 %	50 %	50 %	0 %	478450458
95	NC_020936	AGAT	2	8	36848	36855	50 %	25 %	25 %	0 %	478450458
96	NC_020936	CTTT	2	8	37220	37227	0 %	75 %	0 %	25 %	478450459
97	NC_020936	ATGA	2	8	37710	37717	50 %	25 %	25 %	0 %	478450459
98	NC_020936	TAGG	2	8	37869	37876	25 %	25 %	50 %	0 %	478450459
99	NC_020936	CAAT	2	8	38053	38060	50 %	25 %	0 %	25 %	478450459
100	NC_020936	AATG	2	8	38840	38847	50 %	25 %	25 %	0 %	478450459
101	NC_020936	AGAA	2	8	39677	39684	75 %	0 %	25 %	0 %	478450460
102	NC_020936	AAGA	2	8	39729	39736	75 %	0 %	25 %	0 %	478450460
103	NC_020936	ATCC	2	8	39737	39744	25 %	25 %	0 %	50 %	478450460
104	NC_020936	TAAT	2	8	39948	39955	50 %	50 %	0 %	0 %	478450460
105	NC_020936	GTGC	2	8	42036	42043	0 %	25 %	50 %	25 %	478450462
106	NC_020936	AGAA	2	8	42455	42462	75 %	0 %	25 %	0 %	478450462
107	NC_020936	GGAT	2	8	42607	42614	25 %	25 %	50 %	0 %	478450462
108	NC_020936	AAAC	2	8	43746	43753	75 %	0 %	0 %	25 %	478450464
109	NC_020936	CAAT	2	8	43950	43957	50 %	25 %	0 %	25 %	478450464
110	NC_020936	TGTT	2	8	44330	44337	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020936	AATA	2	8	44568	44575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020936	ATTT	2	8	44706	44713	25 %	75 %	0 %	0 %	478450465
113	NC_020936	GCTC	2	8	45014	45021	0 %	25 %	25 %	50 %	478450465
114	NC_020936	TTCT	2	8	45156	45163	0 %	75 %	0 %	25 %	478450465
115	NC_020936	TTGA	2	8	45756	45763	25 %	50 %	25 %	0 %	478450466
116	NC_020936	TGTT	2	8	45928	45935	0 %	75 %	25 %	0 %	478450466
117	NC_020936	CTAT	2	8	45958	45965	25 %	50 %	0 %	25 %	478450466
118	NC_020936	TGTT	2	8	45987	45994	0 %	75 %	25 %	0 %	478450466
119	NC_020936	CTAT	2	8	46283	46290	25 %	50 %	0 %	25 %	478450466
120	NC_020936	AAGA	2	8	46778	46785	75 %	0 %	25 %	0 %	478450467
121	NC_020936	AAGA	2	8	46835	46842	75 %	0 %	25 %	0 %	478450467
122	NC_020936	AAAG	2	8	46875	46882	75 %	0 %	25 %	0 %	478450467
123	NC_020936	AAGA	2	8	46990	46997	75 %	0 %	25 %	0 %	478450467
124	NC_020936	ACTT	2	8	47251	47258	25 %	50 %	0 %	25 %	478450467
125	NC_020936	ATGG	2	8	47877	47884	25 %	25 %	50 %	0 %	478450467
126	NC_020936	AGGA	2	8	47908	47915	50 %	0 %	50 %	0 %	478450467
127	NC_020936	GAAC	2	8	48455	48462	50 %	0 %	25 %	25 %	478450467
128	NC_020936	AAGT	2	8	48490	48497	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020936	AACA	2	8	48699	48706	75 %	0 %	0 %	25 %	478450468
130	NC_020936	CTTT	2	8	48895	48902	0 %	75 %	0 %	25 %	478450468
131	NC_020936	CTTT	2	8	49780	49787	0 %	75 %	0 %	25 %	478450469
132	NC_020936	GTAG	2	8	49798	49805	25 %	25 %	50 %	0 %	478450469
133	NC_020936	GAAG	2	8	51228	51235	50 %	0 %	50 %	0 %	478450470
134	NC_020936	TTCA	2	8	51650	51657	25 %	50 %	0 %	25 %	478450470
135	NC_020936	TCTA	2	8	51867	51874	25 %	50 %	0 %	25 %	478450470
136	NC_020936	TATT	2	8	52753	52760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020936	GGAA	2	8	52984	52991	50 %	0 %	50 %	0 %	478450472
138	NC_020936	TTAA	2	8	53725	53732	50 %	50 %	0 %	0 %	478450472
139	NC_020936	CCTT	2	8	53932	53939	0 %	50 %	0 %	50 %	478450473
140	NC_020936	TTTA	2	8	54099	54106	25 %	75 %	0 %	0 %	478450473
141	NC_020936	AAAG	2	8	54323	54330	75 %	0 %	25 %	0 %	478450473
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143	NC_020936	AATC	2	8	54515	54522	50 %	25 %	0 %	25 %	478450473
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