MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020936	A	6	6	135568	135573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_020936	GTTT	2	8	135574	135581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_020936	T	7	7	135589	135595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_020936	AAT	2	6	135614	135619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_020936	AG	4	8	135735	135742	50 %	0 %	50 %	0 %	478450539
3006	NC_020936	GGATA	2	10	135747	135756	40 %	20 %	40 %	0 %	478450539
3007	NC_020936	AG	3	6	135765	135770	50 %	0 %	50 %	0 %	478450539
3008	NC_020936	GGC	2	6	135813	135818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478450539
3009	NC_020936	GTT	2	6	135856	135861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450539
3010	NC_020936	TTG	2	6	135868	135873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450539
3011	NC_020936	TGT	2	6	135903	135908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450539
3012	NC_020936	TTC	2	6	135922	135927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450539
3013	NC_020936	AGG	2	6	135948	135953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450539
3014	NC_020936	GGA	2	6	135964	135969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450539
3015	NC_020936	AG	3	6	135994	135999	50 %	0 %	50 %	0 %	478450539
3016	NC_020936	AAC	2	6	136030	136035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450539
3017	NC_020936	CAG	2	6	136049	136054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450539
3018	NC_020936	A	6	6	136126	136131	100 %	0 %	0 %	0 %	478450539
3019	NC_020936	AGG	2	6	136200	136205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_020936	AAC	2	6	136293	136298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450540
3021	NC_020936	AGC	2	6	136317	136322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450540
3022	NC_020936	GTT	2	6	136336	136341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450540
3023	NC_020936	ATT	2	6	136348	136353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450540
3024	NC_020936	GTG	2	6	136397	136402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450540
3025	NC_020936	TAT	2	6	136422	136427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450540
3026	NC_020936	ATTGT	2	10	136444	136453	20 %	60 %	20 %	0 %	478450540
3027	NC_020936	TGG	2	6	136493	136498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450540
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3029	NC_020936	TGA	2	6	136623	136628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450541
3030	NC_020936	TCA	2	6	136666	136671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450541
3031	NC_020936	TG	3	6	136694	136699	0 %	50 %	50 %	0 %	478450541
3032	NC_020936	GCTA	2	8	136708	136715	25 %	25 %	25 %	25 %	478450541
3033	NC_020936	CGC	2	6	136741	136746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478450541
3034	NC_020936	TG	3	6	136767	136772	0 %	50 %	50 %	0 %	478450541
3035	NC_020936	TG	3	6	136793	136798	0 %	50 %	50 %	0 %	478450541
3036	NC_020936	TAG	2	6	136830	136835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450541
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3039	NC_020936	GT	3	6	136858	136863	0 %	50 %	50 %	0 %	478450541
3040	NC_020936	GCT	2	6	136883	136888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450541
3041	NC_020936	GGAT	2	8	136898	136905	25 %	25 %	50 %	0 %	478450541
3042	NC_020936	T	6	6	136967	136972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_020936	TGT	2	6	137020	137025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450542
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3045	NC_020936	GTT	2	6	137110	137115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450542
3046	NC_020936	TTTG	2	8	137127	137134	0 %	75 %	25 %	0 %	478450542
3047	NC_020936	GCG	2	6	137170	137175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478450542
3048	NC_020936	CTG	3	9	137192	137200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450542
3049	NC_020936	TTC	2	6	137201	137206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450542
3050	NC_020936	CTG	2	6	137212	137217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450542
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3054	NC_020936	GAA	2	6	137314	137319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450542
3055	NC_020936	GCT	2	6	137329	137334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450542
3056	NC_020936	CAG	2	6	137347	137352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450542
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3059	NC_020936	GAT	2	6	137470	137475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450542
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3061	NC_020936	ACA	2	6	137486	137491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450542
3062	NC_020936	AGG	2	6	137547	137552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_020936	CCT	2	6	137557	137562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_020936	T	8	8	137564	137571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_020936	TG	3	6	137603	137608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_020936	TTGCA	2	10	137659	137668	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3067	NC_020936	GAG	2	6	137723	137728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450543
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3069	NC_020936	CT	3	6	137762	137767	0 %	50 %	0 %	50 %	478450543
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3073	NC_020936	TCT	2	6	138011	138016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450543
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3090	NC_020936	AG	3	6	138848	138853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_020936	AAGAG	2	10	138911	138920	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_020936	A	6	6	138927	138932	100 %	0 %	0 %	0 %	478450545
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3096	NC_020936	GTT	2	6	139083	139088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450545
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3099	NC_020936	AGAA	2	8	139391	139398	75 %	0 %	25 %	0 %	478450545
3100	NC_020936	GAAG	2	8	139437	139444	50 %	0 %	50 %	0 %	478450545
3101	NC_020936	TTGA	2	8	139449	139456	25 %	50 %	25 %	0 %	478450545
3102	NC_020936	GGT	2	6	139464	139469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450545
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3105	NC_020936	GAAA	2	8	139562	139569	75 %	0 %	25 %	0 %	478450545
3106	NC_020936	GAA	2	6	139590	139595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450545
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3109	NC_020936	GA	3	6	139747	139752	50 %	0 %	50 %	0 %	478450546
3110	NC_020936	AAG	2	6	139778	139783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450546
3111	NC_020936	T	6	6	139955	139960	0 %	100 %	0 %	0 %	478450546
3112	NC_020936	AGG	2	6	140034	140039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450546
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3117	NC_020936	AAGA	2	8	140333	140340	75 %	0 %	25 %	0 %	478450547
3118	NC_020936	AG	3	6	140382	140387	50 %	0 %	50 %	0 %	478450547
3119	NC_020936	GAA	2	6	140394	140399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450547
3120	NC_020936	TTA	2	6	140489	140494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450547
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3122	NC_020936	AGA	2	6	140589	140594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450547
3123	NC_020936	TCCAG	2	10	140616	140625	20 %	20 %	20 %	40 %	478450547
3124	NC_020936	GAA	2	6	140667	140672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450548
3125	NC_020936	ATTG	2	8	140676	140683	25 %	50 %	25 %	0 %	478450548
3126	NC_020936	ATT	2	6	140710	140715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450548
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3129	NC_020936	GCA	2	6	140827	140832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450548
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3131	NC_020936	GCT	2	6	140863	140868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450548
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3142	NC_020936	CTG	2	6	141752	141757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450548
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3149	NC_020936	T	8	8	142042	142049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_020936	T	6	6	142087	142092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_020936	AAG	2	6	142096	142101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_020936	AAAAG	2	10	142132	142141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_020936	T	6	6	142156	142161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_020936	GCT	2	6	142192	142197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3156	NC_020936	ATC	2	6	142216	142221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3157	NC_020936	A	6	6	142265	142270	100 %	0 %	0 %	0 %	478450549
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3164	NC_020936	CTT	2	6	143041	143046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450550
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3166	NC_020936	A	6	6	143075	143080	100 %	0 %	0 %	0 %	478450550
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3168	NC_020936	CTT	2	6	143170	143175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3193	NC_020936	AGA	2	6	143887	143892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450551
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3214	NC_020936	T	7	7	144932	144938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3216	NC_020936	T	7	7	144994	145000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3232	NC_020936	GTA	2	6	145556	145561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450553
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3236	NC_020936	GTTTT	2	10	145907	145916	0 %	80 %	20 %	0 %	478450554
3237	NC_020936	CAA	2	6	145918	145923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450554
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3240	NC_020936	GA	4	8	145996	146003	50 %	0 %	50 %	0 %	478450554
3241	NC_020936	TCT	2	6	146025	146030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450554
3242	NC_020936	TCA	2	6	146070	146075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450554
3243	NC_020936	TGCTCT	2	12	146115	146126	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478450554
3244	NC_020936	TGA	2	6	146148	146153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450554
3245	NC_020936	TTC	2	6	146192	146197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450554
3246	NC_020936	ACG	2	6	146333	146338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450554
3247	NC_020936	AAG	2	6	146381	146386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450554
3248	NC_020936	ATT	2	6	146411	146416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450555
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3372	NC_020936	GTT	2	6	152124	152129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3373	NC_020936	T	9	9	152213	152221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3375	NC_020936	ATCT	2	8	152293	152300	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3376	NC_020936	GCTG	2	8	152332	152339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3377	NC_020936	GA	3	6	152383	152388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3378	NC_020936	GCG	2	6	152420	152425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3379	NC_020936	GGA	2	6	152426	152431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3496	NC_020936	AG	3	6	157950	157955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3497	NC_020936	TAA	2	6	157964	157969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3498	NC_020936	ATT	2	6	158058	158063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450564
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