MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_020936	GAA	2	6	91153	91158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_020936	GA	3	6	91169	91174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2005	NC_020936	TCA	2	6	91282	91287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450501
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2260	NC_020936	GA	3	6	101660	101665	50 %	0 %	50 %	0 %	478450510
2261	NC_020936	GGT	2	6	101674	101679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450510
2262	NC_020936	AG	3	6	101730	101735	50 %	0 %	50 %	0 %	478450510
2263	NC_020936	GAT	2	6	101787	101792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450510
2264	NC_020936	T	6	6	101800	101805	0 %	100 %	0 %	0 %	478450510
2265	NC_020936	AC	3	6	101812	101817	50 %	0 %	0 %	50 %	478450510
2266	NC_020936	GTA	2	6	101821	101826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450510
2267	NC_020936	A	7	7	101833	101839	100 %	0 %	0 %	0 %	478450510
2268	NC_020936	TC	3	6	101840	101845	0 %	50 %	0 %	50 %	478450510
2269	NC_020936	GA	3	6	101886	101891	50 %	0 %	50 %	0 %	478450510
2270	NC_020936	TGC	2	6	101894	101899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450510
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2274	NC_020936	GA	3	6	102133	102138	50 %	0 %	50 %	0 %	478450510
2275	NC_020936	TATC	2	8	102174	102181	25 %	50 %	0 %	25 %	478450510
2276	NC_020936	GAT	2	6	102214	102219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450510
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2279	NC_020936	A	6	6	102333	102338	100 %	0 %	0 %	0 %	478450511
2280	NC_020936	AGC	2	6	102475	102480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450511
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2282	NC_020936	TTG	2	6	102584	102589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450511
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2285	NC_020936	GC	3	6	102698	102703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2286	NC_020936	TTA	2	6	102709	102714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2287	NC_020936	AGGT	2	8	102751	102758	25 %	25 %	50 %	0 %	478450512
2288	NC_020936	GAG	2	6	102793	102798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450512
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2290	NC_020936	GCT	2	6	102898	102903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450512
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2292	NC_020936	GAA	2	6	102956	102961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450512
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2295	NC_020936	A	6	6	103160	103165	100 %	0 %	0 %	0 %	478450512
2296	NC_020936	AT	3	6	103209	103214	50 %	50 %	0 %	0 %	478450512
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2310	NC_020936	GCA	2	6	103920	103925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450512
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2313	NC_020936	TCT	2	6	103995	104000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2344	NC_020936	GGCAT	2	10	105656	105665	20 %	20 %	40 %	20 %	478450513
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2366	NC_020936	TCAGAA	2	12	106967	106978	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	478450514
2367	NC_020936	T	6	6	106987	106992	0 %	100 %	0 %	0 %	478450514
2368	NC_020936	ATA	2	6	106995	107000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450514
2369	NC_020936	A	6	6	107076	107081	100 %	0 %	0 %	0 %	478450514
2370	NC_020936	T	6	6	107164	107169	0 %	100 %	0 %	0 %	478450514
2371	NC_020936	T	6	6	107207	107212	0 %	100 %	0 %	0 %	478450514
2372	NC_020936	TA	3	6	107268	107273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_020936	AAGA	2	8	107286	107293	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_020936	T	8	8	107356	107363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_020936	TAA	3	9	107421	107429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2376	NC_020936	CTT	2	6	107465	107470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2377	NC_020936	TAG	2	6	107504	107509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450515
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2379	NC_020936	CCT	2	6	107567	107572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450515
2380	NC_020936	AGC	2	6	107721	107726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450515
2381	NC_020936	T	6	6	107751	107756	0 %	100 %	0 %	0 %	478450515
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