MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_020936	CCT	2	6	631541	631546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450992
14003	NC_020936	A	6	6	631628	631633	100 %	0 %	0 %	0 %	478450992
14004	NC_020936	TCGAG	2	10	631638	631647	20 %	20 %	40 %	20 %	478450992
14005	NC_020936	T	6	6	631665	631670	0 %	100 %	0 %	0 %	478450992
14006	NC_020936	TTG	2	6	631695	631700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450992
14007	NC_020936	TCCT	2	8	631730	631737	0 %	50 %	0 %	50 %	478450992
14008	NC_020936	CAA	2	6	631814	631819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450992
14009	NC_020936	ATC	2	6	631841	631846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450992
14010	NC_020936	TCA	2	6	631857	631862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450992
14011	NC_020936	CTTT	2	8	631911	631918	0 %	75 %	0 %	25 %	478450992
14012	NC_020936	ATG	3	9	631961	631969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450992
14013	NC_020936	TC	4	8	631986	631993	0 %	50 %	0 %	50 %	478450992
14014	NC_020936	CTA	2	6	632039	632044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450992
14015	NC_020936	TGA	2	6	632052	632057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450992
14016	NC_020936	CAA	2	6	632096	632101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450993
14017	NC_020936	TTTG	2	8	632115	632122	0 %	75 %	25 %	0 %	478450993
14018	NC_020936	TTA	2	6	632143	632148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450993
14019	NC_020936	CTC	2	6	632165	632170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450993
14020	NC_020936	TAT	2	6	632172	632177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450993
14021	NC_020936	TGG	2	6	632201	632206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450993
14022	NC_020936	AGC	2	6	632217	632222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450993
14023	NC_020936	GGCT	2	8	632299	632306	0 %	25 %	50 %	25 %	478450993
14024	NC_020936	TGC	2	6	632328	632333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450993
14025	NC_020936	GGCTC	2	10	632402	632411	0 %	20 %	40 %	40 %	478450994
14026	NC_020936	TA	3	6	632425	632430	50 %	50 %	0 %	0 %	478450994
14027	NC_020936	AGCC	2	8	632438	632445	25 %	0 %	25 %	50 %	478450994
14028	NC_020936	TCTT	2	8	632462	632469	0 %	75 %	0 %	25 %	478450994
14029	NC_020936	ATC	2	6	632503	632508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450994
14030	NC_020936	CT	3	6	632560	632565	0 %	50 %	0 %	50 %	478450994
14031	NC_020936	TGC	2	6	632576	632581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450994
14032	NC_020936	CTT	2	6	632644	632649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450994
14033	NC_020936	TGC	2	6	632706	632711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450994
14034	NC_020936	ACCA	2	8	632734	632741	50 %	0 %	0 %	50 %	478450994
14035	NC_020936	CT	3	6	632772	632777	0 %	50 %	0 %	50 %	478450994
14036	NC_020936	ATT	2	6	632819	632824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450994
14037	NC_020936	AGG	2	6	632850	632855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450994
14038	NC_020936	ATC	2	6	632896	632901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450994
14039	NC_020936	ATG	2	6	632929	632934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450994
14040	NC_020936	CAG	2	6	633014	633019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450994
14041	NC_020936	ATC	2	6	633055	633060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450994
14042	NC_020936	CTC	2	6	633071	633076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450994
14043	NC_020936	CTAC	2	8	633090	633097	25 %	25 %	0 %	50 %	478450994
14044	NC_020936	TGG	2	6	633145	633150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450994
14045	NC_020936	ATT	2	6	633170	633175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450994
14046	NC_020936	CTA	2	6	633203	633208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450994
14047	NC_020936	TCC	2	6	633225	633230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450994
14048	NC_020936	A	9	9	633247	633255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_020936	CTCC	2	8	633259	633266	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14050	NC_020936	A	6	6	633267	633272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_020936	TTC	2	6	633280	633285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_020936	TTG	2	6	633306	633311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_020936	TGC	2	6	633350	633355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450995
14054	NC_020936	AAT	2	6	633376	633381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450995
14055	NC_020936	CAA	2	6	633549	633554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450995
14056	NC_020936	CAC	2	6	633609	633614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450995
14057	NC_020936	C	6	6	633655	633660	0 %	0 %	0 %	100 %	478450995
14058	NC_020936	TG	3	6	633673	633678	0 %	50 %	50 %	0 %	478450995
14059	NC_020936	GAG	2	6	633734	633739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450995
14060	NC_020936	CT	3	6	633740	633745	0 %	50 %	0 %	50 %	478450995
14061	NC_020936	T	6	6	633779	633784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020936	A	6	6	633845	633850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_020936	TCT	2	6	633867	633872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450996
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14065	NC_020936	CTT	2	6	633963	633968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450996
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14067	NC_020936	GCA	2	6	634066	634071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450996
14068	NC_020936	CTG	2	6	634101	634106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450996
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14070	NC_020936	ATT	2	6	634164	634169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450996
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14073	NC_020936	GGA	2	6	634322	634327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450996
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14082	NC_020936	TCGTT	2	10	634671	634680	0 %	60 %	20 %	20 %	478450996
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14088	NC_020936	TGG	2	6	634889	634894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478450997
14089	NC_020936	CCTT	2	8	634906	634913	0 %	50 %	0 %	50 %	478450997
14090	NC_020936	TCCAT	2	10	634972	634981	20 %	40 %	0 %	40 %	478450997
14091	NC_020936	AGAA	2	8	634982	634989	75 %	0 %	25 %	0 %	478450997
14092	NC_020936	CCT	2	6	635023	635028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450997
14093	NC_020936	CT	3	6	635027	635032	0 %	50 %	0 %	50 %	478450997
14094	NC_020936	CTA	2	6	635041	635046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450997
14095	NC_020936	GAAA	2	8	635135	635142	75 %	0 %	25 %	0 %	478450997
14096	NC_020936	A	6	6	635140	635145	100 %	0 %	0 %	0 %	478450997
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14101	NC_020936	TAAACA	2	12	635371	635382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478450997
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14103	NC_020936	CAA	2	6	635547	635552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450998
14104	NC_020936	GA	3	6	635573	635578	50 %	0 %	50 %	0 %	478450998
14105	NC_020936	TCC	2	6	635609	635614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450998
14106	NC_020936	A	7	7	635620	635626	100 %	0 %	0 %	0 %	478450998
14107	NC_020936	ATGC	2	8	635636	635643	25 %	25 %	25 %	25 %	478450998
14108	NC_020936	ACGA	2	8	635676	635683	50 %	0 %	25 %	25 %	478450998
14109	NC_020936	GA	4	8	635735	635742	50 %	0 %	50 %	0 %	478450998
14110	NC_020936	AAG	2	6	635743	635748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450998
14111	NC_020936	CTA	2	6	635754	635759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450998
14112	NC_020936	A	6	6	635762	635767	100 %	0 %	0 %	0 %	478450998
14113	NC_020936	ACA	2	6	635838	635843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450999
14114	NC_020936	TCAT	2	8	635859	635866	25 %	50 %	0 %	25 %	478450999
14115	NC_020936	AAG	2	6	635873	635878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450999
14116	NC_020936	TCT	2	6	635880	635885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450999
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14122	NC_020936	CCA	2	6	636093	636098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450999
14123	NC_020936	ATA	2	6	636099	636104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450999
14124	NC_020936	CAT	2	6	636125	636130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450999
14125	NC_020936	T	8	8	636157	636164	0 %	100 %	0 %	0 %	478450999
14126	NC_020936	TTC	2	6	636168	636173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450999
14127	NC_020936	CCT	2	6	636182	636187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14128	NC_020936	GAA	2	6	636221	636226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451000
14129	NC_020936	AATC	2	8	636240	636247	50 %	25 %	0 %	25 %	478451000
14130	NC_020936	ACC	2	6	636355	636360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451000
14131	NC_020936	TTC	2	6	636375	636380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451000
14132	NC_020936	TCC	2	6	636450	636455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451000
14133	NC_020936	AAC	2	6	636459	636464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451000
14134	NC_020936	CTT	2	6	636476	636481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451000
14135	NC_020936	CCT	2	6	636553	636558	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451000
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14137	NC_020936	TCT	2	6	636632	636637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451000
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14139	NC_020936	TCC	2	6	636711	636716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451000
14140	NC_020936	TTTC	2	8	636806	636813	0 %	75 %	0 %	25 %	478451000
14141	NC_020936	AGAA	2	8	636835	636842	75 %	0 %	25 %	0 %	478451000
14142	NC_020936	CAC	2	6	636843	636848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451000
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14146	NC_020936	AAG	2	6	637079	637084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451000
14147	NC_020936	CAGC	2	8	637094	637101	25 %	0 %	25 %	50 %	478451000
14148	NC_020936	TAA	3	9	637164	637172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451000
14149	NC_020936	TC	4	8	637224	637231	0 %	50 %	0 %	50 %	478451000
14150	NC_020936	AGC	2	6	637266	637271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451000
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14152	NC_020936	CT	3	6	637278	637283	0 %	50 %	0 %	50 %	478451000
14153	NC_020936	CGT	2	6	637318	637323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451000
14154	NC_020936	T	6	6	637323	637328	0 %	100 %	0 %	0 %	478451000
14155	NC_020936	CCT	2	6	637372	637377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14156	NC_020936	CGGAA	2	10	637588	637597	40 %	0 %	40 %	20 %	478451001
14157	NC_020936	TAA	2	6	637658	637663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451001
14158	NC_020936	CA	3	6	637685	637690	50 %	0 %	0 %	50 %	478451001
14159	NC_020936	TTG	2	6	637750	637755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451001
14160	NC_020936	ATA	2	6	637759	637764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451001
14161	NC_020936	CAT	2	6	637813	637818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451001
14162	NC_020936	GGA	2	6	638016	638021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451001
14163	NC_020936	TCT	2	6	638022	638027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451001
14164	NC_020936	TA	3	6	638074	638079	50 %	50 %	0 %	0 %	478451001
14165	NC_020936	GTC	2	6	638085	638090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451001
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14167	NC_020936	AGG	2	6	638171	638176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451001
14168	NC_020936	ACC	2	6	638232	638237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451001
14169	NC_020936	ATGA	2	8	638246	638253	50 %	25 %	25 %	0 %	478451001
14170	NC_020936	TCC	2	6	638288	638293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451001
14171	NC_020936	TAA	2	6	638371	638376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451001
14172	NC_020936	GCTC	2	8	638484	638491	0 %	25 %	25 %	50 %	478451001
14173	NC_020936	AAG	2	6	638558	638563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451001
14174	NC_020936	TA	3	6	638647	638652	50 %	50 %	0 %	0 %	478451001
14175	NC_020936	AAT	2	6	638669	638674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451001
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14177	NC_020936	T	7	7	638752	638758	0 %	100 %	0 %	0 %	478451001
14178	NC_020936	GCA	2	6	638803	638808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451001
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14180	NC_020936	A	6	6	638823	638828	100 %	0 %	0 %	0 %	478451001
14181	NC_020936	CAT	2	6	638879	638884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451001
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14183	NC_020936	TTC	2	6	638913	638918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451002
14184	NC_020936	TTTC	2	8	638938	638945	0 %	75 %	0 %	25 %	478451002
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14193	NC_020936	C	6	6	639207	639212	0 %	0 %	0 %	100 %	478451002
14194	NC_020936	AAT	2	6	639213	639218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451002
14195	NC_020936	TAA	2	6	639332	639337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451002
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14200	NC_020936	ACG	2	6	639496	639501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451002
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14202	NC_020936	T	7	7	639743	639749	0 %	100 %	0 %	0 %	478451002
14203	NC_020936	CAA	2	6	639768	639773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451002
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14205	NC_020936	CTT	2	6	639794	639799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451002
14206	NC_020936	CTT	2	6	639866	639871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451002
14207	NC_020936	CTC	2	6	639880	639885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451002
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14211	NC_020936	AGCG	2	8	640156	640163	25 %	0 %	50 %	25 %	478451002
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14218	NC_020936	AGA	2	6	640476	640481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451002
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14220	NC_020936	GAT	2	6	640784	640789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451002
14221	NC_020936	C	9	9	640814	640822	0 %	0 %	0 %	100 %	478451002
14222	NC_020936	GTT	2	6	640868	640873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451002
14223	NC_020936	TC	3	6	640922	640927	0 %	50 %	0 %	50 %	478451002
14224	NC_020936	GA	3	6	640938	640943	50 %	0 %	50 %	0 %	478451002
14225	NC_020936	CTT	2	6	640949	640954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451002
14226	NC_020936	CAT	2	6	640973	640978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451002
14227	NC_020936	CAAA	2	8	641106	641113	75 %	0 %	0 %	25 %	478451002
14228	NC_020936	TCC	2	6	641157	641162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451003
14229	NC_020936	CAA	2	6	641255	641260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451003
14230	NC_020936	TCT	2	6	641368	641373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451003
14231	NC_020936	ATC	2	6	641427	641432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451003
14232	NC_020936	AGAA	2	8	641436	641443	75 %	0 %	25 %	0 %	478451003
14233	NC_020936	CTG	2	6	641459	641464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451003
14234	NC_020936	TAA	2	6	641465	641470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451003
14235	NC_020936	GAA	2	6	641539	641544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451003
14236	NC_020936	CTG	2	6	641565	641570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451003
14237	NC_020936	TCA	2	6	641573	641578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451003
14238	NC_020936	CAT	2	6	641607	641612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451003
14239	NC_020936	ATC	2	6	641616	641621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451003
14240	NC_020936	AAG	2	6	641814	641819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451003
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14242	NC_020936	GCT	2	6	641849	641854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451003
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14261	NC_020936	A	7	7	642477	642483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14262	NC_020936	A	7	7	642485	642491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14282	NC_020936	CAAGC	2	10	643676	643685	40 %	0 %	20 %	40 %	478451005
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14328	NC_020936	TAG	2	6	645559	645564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14350	NC_020936	GCT	2	6	646269	646274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451006
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14352	NC_020936	A	6	6	646321	646326	100 %	0 %	0 %	0 %	478451007
14353	NC_020936	CAAG	2	8	646335	646342	50 %	0 %	25 %	25 %	478451007
14354	NC_020936	CA	3	6	646343	646348	50 %	0 %	0 %	50 %	478451007
14355	NC_020936	CTT	2	6	646349	646354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451007
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14360	NC_020936	CT	3	6	646530	646535	0 %	50 %	0 %	50 %	478451007
14361	NC_020936	TAAA	2	8	646646	646653	75 %	25 %	0 %	0 %	478451007
14362	NC_020936	TGA	2	6	646662	646667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451007
14363	NC_020936	TCGTC	2	10	646675	646684	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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