MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020936	TTC	2	6	22927	22932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450445
503	NC_020936	T	6	6	23004	23009	0 %	100 %	0 %	0 %	478450445
504	NC_020936	AT	3	6	23096	23101	50 %	50 %	0 %	0 %	478450445
505	NC_020936	CTG	2	6	23107	23112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450445
506	NC_020936	TCG	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450445
507	NC_020936	GAA	2	6	23135	23140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450445
508	NC_020936	TTG	2	6	23189	23194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450445
509	NC_020936	CATT	2	8	23288	23295	25 %	50 %	0 %	25 %	478450445
510	NC_020936	AGA	2	6	23467	23472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450445
511	NC_020936	TGA	2	6	23498	23503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450445
512	NC_020936	GAA	2	6	23536	23541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450445
513	NC_020936	TTG	2	6	23558	23563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450445
514	NC_020936	AGA	2	6	23618	23623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450445
515	NC_020936	GCTT	2	8	23631	23638	0 %	50 %	25 %	25 %	478450445
516	NC_020936	GGTT	2	8	23679	23686	0 %	50 %	50 %	0 %	478450445
517	NC_020936	TGC	2	6	23705	23710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450445
518	NC_020936	ATT	2	6	23757	23762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450445
519	NC_020936	AAT	2	6	23799	23804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450445
520	NC_020936	TTG	2	6	23862	23867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450445
521	NC_020936	TTCT	2	8	24049	24056	0 %	75 %	0 %	25 %	478450445
522	NC_020936	TGC	2	6	24113	24118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450445
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524	NC_020936	GCA	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450445
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527	NC_020936	GAG	2	6	24316	24321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450445
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530	NC_020936	GA	3	6	24415	24420	50 %	0 %	50 %	0 %	478450445
531	NC_020936	GA	3	6	24507	24512	50 %	0 %	50 %	0 %	478450445
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539	NC_020936	AAG	2	6	25060	25065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450445
540	NC_020936	A	7	7	25145	25151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020936	TTA	2	6	25158	25163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020936	T	9	9	25173	25181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020936	T	6	6	25205	25210	0 %	100 %	0 %	0 %	478450446
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546	NC_020936	GGA	3	9	25496	25504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478450446
547	NC_020936	GAT	2	6	25541	25546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450446
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551	NC_020936	TTA	2	6	25964	25969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450446
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555	NC_020936	TAGG	2	8	26101	26108	25 %	25 %	50 %	0 %	478450446
556	NC_020936	AGAGG	2	10	26117	26126	40 %	0 %	60 %	0 %	478450446
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559	NC_020936	T	6	6	26183	26188	0 %	100 %	0 %	0 %	478450446
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563	NC_020936	TA	3	6	26527	26532	50 %	50 %	0 %	0 %	478450446
564	NC_020936	T	6	6	26536	26541	0 %	100 %	0 %	0 %	478450446
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600	NC_020936	A	7	7	27946	27952	100 %	0 %	0 %	0 %	478450447
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614	NC_020936	TAA	2	6	28465	28470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020936	TC	3	6	28472	28477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_020936	ATTG	2	8	28523	28530	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020936	AG	3	6	28555	28560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020936	AGA	2	6	28577	28582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020936	GAA	2	6	28627	28632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450449
620	NC_020936	ATCCG	2	10	28647	28656	20 %	20 %	20 %	40 %	478450449
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629	NC_020936	AGGGT	2	10	29165	29174	20 %	20 %	60 %	0 %	478450449
630	NC_020936	TTC	2	6	29201	29206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450449
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