MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams5 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020936	GCT	2	6	249513	249518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450644
5502	NC_020936	ACA	2	6	249578	249583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450644
5503	NC_020936	CCA	2	6	249610	249615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450644
5504	NC_020936	CAA	2	6	249658	249663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450644
5505	NC_020936	CCCA	2	8	249783	249790	25 %	0 %	0 %	75 %	478450645
5506	NC_020936	CTT	2	6	249912	249917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450645
5507	NC_020936	AAT	2	6	249991	249996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450645
5508	NC_020936	CTC	2	6	250002	250007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450645
5509	NC_020936	ACT	2	6	250010	250015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450645
5510	NC_020936	GAA	2	6	250028	250033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450645
5511	NC_020936	CTC	2	6	250059	250064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450645
5512	NC_020936	GCAA	2	8	250073	250080	50 %	0 %	25 %	25 %	478450645
5513	NC_020936	AAC	2	6	250090	250095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450645
5514	NC_020936	GTT	2	6	250135	250140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450645
5515	NC_020936	AAC	2	6	250174	250179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_020936	A	6	6	250188	250193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_020936	TAA	2	6	250239	250244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_020936	TTC	2	6	250257	250262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450646
5519	NC_020936	GCT	2	6	250289	250294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450646
5520	NC_020936	T	7	7	250298	250304	0 %	100 %	0 %	0 %	478450646
5521	NC_020936	AGCA	2	8	250335	250342	50 %	0 %	25 %	25 %	478450646
5522	NC_020936	CTT	2	6	250352	250357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450646
5523	NC_020936	TCT	3	9	250363	250371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450646
5524	NC_020936	GATAA	2	10	250391	250400	60 %	20 %	20 %	0 %	478450646
5525	NC_020936	TCG	2	6	250457	250462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450646
5526	NC_020936	CATA	2	8	250478	250485	50 %	25 %	0 %	25 %	478450646
5527	NC_020936	TCC	2	6	250497	250502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450646
5528	NC_020936	TAA	2	6	250530	250535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450646
5529	NC_020936	AG	4	8	250555	250562	50 %	0 %	50 %	0 %	478450646
5530	NC_020936	A	6	6	250574	250579	100 %	0 %	0 %	0 %	478450646
5531	NC_020936	AGA	2	6	250585	250590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450646
5532	NC_020936	CAC	2	6	250592	250597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450646
5533	NC_020936	CAA	2	6	250638	250643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450646
5534	NC_020936	GTA	2	6	250660	250665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450646
5535	NC_020936	ACA	2	6	250719	250724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450646
5536	NC_020936	A	6	6	250759	250764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_020936	TA	3	6	250806	250811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_020936	CCAA	2	8	250841	250848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5539	NC_020936	A	7	7	250865	250871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_020936	TAT	2	6	250884	250889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450647
5541	NC_020936	TTCA	2	8	250916	250923	25 %	50 %	0 %	25 %	478450647
5542	NC_020936	AGA	3	9	250952	250960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450647
5543	NC_020936	TGTT	2	8	250990	250997	0 %	75 %	25 %	0 %	478450647
5544	NC_020936	CGA	2	6	251111	251116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450647
5545	NC_020936	GCAAA	2	10	251123	251132	60 %	0 %	20 %	20 %	478450647
5546	NC_020936	AATA	2	8	251209	251216	75 %	25 %	0 %	0 %	478450647
5547	NC_020936	A	6	6	251275	251280	100 %	0 %	0 %	0 %	478450647
5548	NC_020936	A	7	7	251306	251312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_020936	ATA	2	6	251320	251325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_020936	CCT	2	6	251375	251380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_020936	AAAC	2	8	251449	251456	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5552	NC_020936	AAG	2	6	251573	251578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450648
5553	NC_020936	AGC	2	6	251607	251612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450648
5554	NC_020936	CAAT	2	8	251713	251720	50 %	25 %	0 %	25 %	478450648
5555	NC_020936	TTA	2	6	251785	251790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450648
5556	NC_020936	CTTCT	2	10	251817	251826	0 %	60 %	0 %	40 %	478450648
5557	NC_020936	T	6	6	251860	251865	0 %	100 %	0 %	0 %	478450648
5558	NC_020936	CA	3	6	251919	251924	50 %	0 %	0 %	50 %	478450648
5559	NC_020936	AAT	2	6	251934	251939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450648
5560	NC_020936	ACA	2	6	252010	252015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478450648
5561	NC_020936	TTG	2	6	252074	252079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450648
5562	NC_020936	AGA	2	6	252129	252134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450648
5563	NC_020936	TAG	2	6	252149	252154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478450648
5564	NC_020936	TTTTTA	2	12	252171	252182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_020936	GAG	2	6	252298	252303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_020936	ATT	2	6	252310	252315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450649
5567	NC_020936	T	6	6	252314	252319	0 %	100 %	0 %	0 %	478450649
5568	NC_020936	ACG	2	6	252320	252325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450649
5569	NC_020936	CCTGCA	2	12	252331	252342	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478450649
5570	NC_020936	CTG	2	6	252388	252393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450649
5571	NC_020936	TTG	2	6	252419	252424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450649
5572	NC_020936	TCTG	2	8	252444	252451	0 %	50 %	25 %	25 %	478450649
5573	NC_020936	TCC	2	6	252474	252479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450649
5574	NC_020936	TTG	2	6	252493	252498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478450649
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5576	NC_020936	TACT	2	8	252549	252556	25 %	50 %	0 %	25 %	478450649
5577	NC_020936	CGA	2	6	252564	252569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450649
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5579	NC_020936	CTC	2	6	252623	252628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450649
5580	NC_020936	ACG	2	6	252671	252676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450649
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5582	NC_020936	CAG	2	6	252739	252744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478450649
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5584	NC_020936	CTG	2	6	252772	252777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450649
5585	NC_020936	TAA	2	6	252814	252819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478450649
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5588	NC_020936	ATA	2	6	253011	253016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_020936	AAT	2	6	253035	253040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_020936	AG	3	6	253097	253102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_020936	A	8	8	253115	253122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020936	TC	3	6	253123	253128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5593	NC_020936	TC	3	6	253209	253214	0 %	50 %	0 %	50 %	478450650
5594	NC_020936	A	6	6	253218	253223	100 %	0 %	0 %	0 %	478450650
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5597	NC_020936	T	7	7	253320	253326	0 %	100 %	0 %	0 %	478450650
5598	NC_020936	GCT	2	6	253330	253335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450650
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5601	NC_020936	CT	4	8	253429	253436	0 %	50 %	0 %	50 %	478450650
5602	NC_020936	TTA	2	6	253494	253499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450650
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5605	NC_020936	TTCG	2	8	253691	253698	0 %	50 %	25 %	25 %	478450650
5606	NC_020936	CTT	2	6	253727	253732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450650
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5608	NC_020936	TTC	2	6	253890	253895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450650
5609	NC_020936	CTT	2	6	253898	253903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450650
5610	NC_020936	TC	3	6	253920	253925	0 %	50 %	0 %	50 %	478450650
5611	NC_020936	TCT	2	6	253982	253987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450650
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5613	NC_020936	GTTTT	2	10	254055	254064	0 %	80 %	20 %	0 %	478450650
5614	NC_020936	TTA	2	6	254079	254084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478450650
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5616	NC_020936	CAC	2	6	254113	254118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478450650
5617	NC_020936	TCA	2	6	254246	254251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478450650
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5620	NC_020936	TGC	2	6	254354	254359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478450650
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5622	NC_020936	A	6	6	254378	254383	100 %	0 %	0 %	0 %	478450650
5623	NC_020936	AGA	2	6	254395	254400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478450650
5624	NC_020936	TTG	2	6	254500	254505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5751	NC_020936	TCT	2	6	260641	260646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478450656
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6000	NC_020936	CTC	2	6	272119	272124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478450666

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