MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020935	TGTGA	2	10	3878	3887	20 %	40 %	40 %	0 %	478452228
2	NC_020935	TTGAA	2	10	4234	4243	40 %	40 %	20 %	0 %	478452229
3	NC_020935	GAGAA	2	10	4528	4537	60 %	0 %	40 %	0 %	478452229
4	NC_020935	GAAAA	2	10	4965	4974	80 %	0 %	20 %	0 %	478452229
5	NC_020935	TTACA	2	10	5120	5129	40 %	40 %	0 %	20 %	478452229
6	NC_020935	GTCTT	2	10	5816	5825	0 %	60 %	20 %	20 %	478452230
7	NC_020935	TATTT	2	10	7631	7640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020935	TGGTA	2	10	8289	8298	20 %	40 %	40 %	0 %	478452232
9	NC_020935	CGAAA	2	10	9697	9706	60 %	0 %	20 %	20 %	478452233
10	NC_020935	GGCTG	2	10	10333	10342	0 %	20 %	60 %	20 %	478452234
11	NC_020935	CCTCT	2	10	11125	11134	0 %	40 %	0 %	60 %	478452235
12	NC_020935	AAAGG	2	10	11284	11293	60 %	0 %	40 %	0 %	478452235
13	NC_020935	AAGAA	2	10	12404	12413	80 %	0 %	20 %	0 %	478452236
14	NC_020935	AAAGA	2	10	13802	13811	80 %	0 %	20 %	0 %	478452237
15	NC_020935	GGTGT	2	10	13906	13915	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020935	GATTT	2	10	15649	15658	20 %	60 %	20 %	0 %	478452239
17	NC_020935	CGTTC	2	10	16760	16769	0 %	40 %	20 %	40 %	478452240
18	NC_020935	GCTTC	2	10	17133	17142	0 %	40 %	20 %	40 %	478452240
19	NC_020935	GAAGG	2	10	17504	17513	40 %	0 %	60 %	0 %	478452240
20	NC_020935	GTTGT	2	10	20930	20939	0 %	60 %	40 %	0 %	478452243
21	NC_020935	AAGAT	2	10	22042	22051	60 %	20 %	20 %	0 %	478452244
22	NC_020935	TTTGC	2	10	22653	22662	0 %	60 %	20 %	20 %	478452244
23	NC_020935	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478452244
24	NC_020935	AGAGG	2	10	26133	26142	40 %	0 %	60 %	0 %	478452245
25	NC_020935	GGAGA	2	10	27912	27921	40 %	0 %	60 %	0 %	478452246
26	NC_020935	GGATA	2	10	27938	27947	40 %	20 %	40 %	0 %	478452246
27	NC_020935	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	478452248
28	NC_020935	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478452248
29	NC_020935	CCTAT	2	10	30221	30230	20 %	40 %	0 %	40 %	478452249
30	NC_020935	GAAGG	2	10	31020	31029	40 %	0 %	60 %	0 %	478452250
31	NC_020935	GAGCT	2	10	32060	32069	20 %	20 %	40 %	20 %	478452251
32	NC_020935	AAAGA	2	10	33693	33702	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020935	CTATT	2	10	36734	36743	20 %	60 %	0 %	20 %	478452257
34	NC_020935	TCCTA	2	10	36781	36790	20 %	40 %	0 %	40 %	478452257
35	NC_020935	ACGAT	2	10	38696	38705	40 %	20 %	20 %	20 %	478452258
36	NC_020935	AATTT	2	10	39587	39596	40 %	60 %	0 %	0 %	478452259
37	NC_020935	AGCAA	2	10	42711	42720	60 %	0 %	20 %	20 %	478452261
38	NC_020935	CGATG	2	10	42768	42777	20 %	20 %	40 %	20 %	478452261
39	NC_020935	TGCAA	2	10	42926	42935	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020935	TTTAT	2	10	44771	44780	20 %	80 %	0 %	0 %	478452264
41	NC_020935	CTTTC	2	10	46867	46876	0 %	60 %	0 %	40 %	478452266
42	NC_020935	AGTTT	2	10	47406	47415	20 %	60 %	20 %	0 %	478452266
43	NC_020935	GAAGA	2	10	48539	48548	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020935	CTATT	2	10	50120	50129	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020935	CTTTT	2	10	50571	50580	0 %	80 %	0 %	20 %	478452269
46	NC_020935	CCGTA	2	10	54406	54415	20 %	20 %	20 %	40 %	478452272
47	NC_020935	AATTT	2	10	54646	54655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020935	TTATC	2	10	55809	55818	20 %	60 %	0 %	20 %	478452273
49	NC_020935	GTTGT	2	10	56874	56883	0 %	60 %	40 %	0 %	478452274
50	NC_020935	GAGCA	2	10	60380	60389	40 %	0 %	40 %	20 %	478452276
51	NC_020935	TGTGA	2	10	62829	62838	20 %	40 %	40 %	0 %	478452278
52	NC_020935	AGTGA	2	10	64350	64359	40 %	20 %	40 %	0 %	478452279
53	NC_020935	CCTTC	2	10	64624	64633	0 %	40 %	0 %	60 %	478452279
54	NC_020935	AGGAG	2	10	66852	66861	40 %	0 %	60 %	0 %	478452281
55	NC_020935	GTTAA	2	10	66982	66991	40 %	40 %	20 %	0 %	478452281
56	NC_020935	CAAGC	2	10	69348	69357	40 %	0 %	20 %	40 %	478452283
57	NC_020935	AAAAG	2	10	69596	69605	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020935	GGAGC	2	10	70218	70227	20 %	0 %	60 %	20 %	478452284
59	NC_020935	GCGAT	2	10	70408	70417	20 %	20 %	40 %	20 %	478452284
60	NC_020935	CTCTT	2	10	70762	70771	0 %	60 %	0 %	40 %	478452284
61	NC_020935	AGGGG	2	10	71408	71417	20 %	0 %	80 %	0 %	478452284
62	NC_020935	AAGAA	2	10	71450	71459	80 %	0 %	20 %	0 %	478452284
63	NC_020935	CTTGC	2	10	72539	72548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_020935	ATTGG	2	10	72740	72749	20 %	40 %	40 %	0 %	478452286
65	NC_020935	GAAAA	2	10	73812	73821	80 %	0 %	20 %	0 %	478452286
66	NC_020935	TGGGA	2	10	74229	74238	20 %	20 %	60 %	0 %	478452287
67	NC_020935	TATTT	2	10	76756	76765	20 %	80 %	0 %	0 %	478452288
68	NC_020935	AAAAG	2	10	77289	77298	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020935	ATCAA	2	10	78987	78996	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020935	TGTCT	2	10	80551	80560	0 %	60 %	20 %	20 %	478452291
71	NC_020935	TTACT	2	10	81058	81067	20 %	60 %	0 %	20 %	478452291
72	NC_020935	AGAAA	2	10	82448	82457	80 %	0 %	20 %	0 %	478452293
73	NC_020935	GGAAG	2	10	82961	82970	40 %	0 %	60 %	0 %	478452293
74	NC_020935	AGCGA	2	10	85432	85441	40 %	0 %	40 %	20 %	478452296
75	NC_020935	TTTGT	2	10	85731	85740	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020935	GATCC	2	10	86517	86526	20 %	20 %	20 %	40 %	478452297
77	NC_020935	AGAGC	2	10	87852	87861	40 %	0 %	40 %	20 %	478452298
78	NC_020935	AATAA	2	10	88730	88739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020935	TTTTC	2	10	91584	91593	0 %	80 %	0 %	20 %	478452301
80	NC_020935	GGATG	2	10	91844	91853	20 %	20 %	60 %	0 %	478452302
81	NC_020935	CAACA	2	10	93383	93392	60 %	0 %	0 %	40 %	478452303
82	NC_020935	ACAGC	2	10	94428	94437	40 %	0 %	20 %	40 %	478452304
83	NC_020935	CTTTT	2	10	94802	94811	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020935	GGAAC	2	10	95140	95149	40 %	0 %	40 %	20 %	478452305
85	NC_020935	GGATT	2	10	96040	96049	20 %	40 %	40 %	0 %	478452305
86	NC_020935	CAATC	2	10	97137	97146	40 %	20 %	0 %	40 %	478452308
87	NC_020935	TTTGC	2	10	97271	97280	0 %	60 %	20 %	20 %	478452308
88	NC_020935	ATTCA	2	10	97535	97544	40 %	40 %	0 %	20 %	478452308
89	NC_020935	GATCC	2	10	97794	97803	20 %	20 %	20 %	40 %	478452308
90	NC_020935	GTTTT	2	10	98215	98224	0 %	80 %	20 %	0 %	478452308
91	NC_020935	ACAAA	2	10	98343	98352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020935	AAGCT	2	10	99420	99429	40 %	20 %	20 %	20 %	478452309
93	NC_020935	AGGGG	2	10	99779	99788	20 %	0 %	80 %	0 %	478452309
94	NC_020935	ATAGC	2	10	100472	100481	40 %	20 %	20 %	20 %	478452310
95	NC_020935	TTCCC	2	10	101076	101085	0 %	40 %	0 %	60 %	478452311
96	NC_020935	AGCGA	2	10	103400	103409	40 %	0 %	40 %	20 %	478452313
97	NC_020935	TTTCT	2	10	103758	103767	0 %	80 %	0 %	20 %	478452313
98	NC_020935	CTTCT	2	10	103812	103821	0 %	60 %	0 %	40 %	478452313
99	NC_020935	ATCAT	2	10	104964	104973	40 %	40 %	0 %	20 %	478452314
100	NC_020935	GGCAT	2	10	105672	105681	20 %	20 %	40 %	20 %	478452314
101	NC_020935	AAAGC	2	10	109398	109407	60 %	0 %	20 %	20 %	478452317
102	NC_020935	GCATT	2	10	110558	110567	20 %	40 %	20 %	20 %	478452319
103	NC_020935	GCTCT	2	10	114623	114632	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020935	TGTTT	2	10	115247	115256	0 %	80 %	20 %	0 %	478452322
105	NC_020935	CATGT	2	10	115625	115634	20 %	40 %	20 %	20 %	478452322
106	NC_020935	TATCG	2	10	116329	116338	20 %	40 %	20 %	20 %	478452322
107	NC_020935	TTTCT	2	10	116845	116854	0 %	80 %	0 %	20 %	478452323
108	NC_020935	GGAGA	2	10	117041	117050	40 %	0 %	60 %	0 %	478452323
109	NC_020935	AAAGA	2	10	119092	119101	80 %	0 %	20 %	0 %	478452326
110	NC_020935	CCAAT	2	10	122055	122064	40 %	20 %	0 %	40 %	478452329
111	NC_020935	GCTTC	2	10	123156	123165	0 %	40 %	20 %	40 %	478452329
112	NC_020935	TACAA	2	10	126945	126954	60 %	20 %	0 %	20 %	478452333
113	NC_020935	ATCCA	2	10	129352	129361	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_020935	GAAGA	2	10	130903	130912	60 %	0 %	40 %	0 %	478452336
115	NC_020935	AAAAG	2	10	132815	132824	80 %	0 %	20 %	0 %	478452337
116	NC_020935	GATTC	2	10	133146	133155	20 %	40 %	20 %	20 %	478452337
117	NC_020935	GGATA	2	10	135764	135773	40 %	20 %	40 %	0 %	478452339
118	NC_020935	ATTGT	2	10	136461	136470	20 %	60 %	20 %	0 %	478452340
119	NC_020935	TTGCA	2	10	137676	137685	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020935	AAGAG	2	10	138928	138937	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020935	TCCAG	2	10	140633	140642	20 %	20 %	20 %	40 %	478452347
122	NC_020935	GTACA	2	10	141364	141373	40 %	20 %	20 %	20 %	478452348
123	NC_020935	TAGAT	2	10	141737	141746	40 %	40 %	20 %	0 %	478452348
124	NC_020935	AAAAG	2	10	142149	142158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020935	AAAAC	2	10	142629	142638	80 %	0 %	0 %	20 %	478452349
126	NC_020935	TGCTA	2	10	143715	143724	20 %	40 %	20 %	20 %	478452351
127	NC_020935	GGAGC	2	10	143762	143771	20 %	0 %	60 %	20 %	478452351
128	NC_020935	CTGGG	2	10	145131	145140	0 %	20 %	60 %	20 %	478452353
129	NC_020935	GTTTT	2	10	145878	145887	0 %	80 %	20 %	0 %	478452354
130	NC_020935	GAACC	2	10	149612	149621	40 %	0 %	20 %	40 %	478452355
131	NC_020935	ATTCT	2	10	153096	153105	20 %	60 %	0 %	20 %	478452359
132	NC_020935	CTGTG	2	10	153300	153309	0 %	40 %	40 %	20 %	478452359
133	NC_020935	TTCTT	2	10	155773	155782	0 %	80 %	0 %	20 %	478452362
134	NC_020935	AGGAA	2	10	160332	160341	60 %	0 %	40 %	0 %	478452366
135	NC_020935	CAAAA	2	10	162344	162353	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020935	AGAGA	2	10	163572	163581	60 %	0 %	40 %	0 %	478452369
137	NC_020935	AGCAA	2	10	164007	164016	60 %	0 %	20 %	20 %	478452369
138	NC_020935	TATGA	2	10	164431	164440	40 %	40 %	20 %	0 %	478452370
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266	NC_020935	AAGGC	2	10	358652	358661	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_020935	GCTTC	2	10	360761	360770	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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