MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020935	TTTG	2	8	182111	182118	0 %	75 %	25 %	0 %	478452381
4003	NC_020935	ATC	2	6	182208	182213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452381
4004	NC_020935	TGCA	2	8	182229	182236	25 %	25 %	25 %	25 %	478452381
4005	NC_020935	TGT	2	6	182247	182252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452381
4006	NC_020935	AGT	2	6	182266	182271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452381
4007	NC_020935	CT	3	6	182311	182316	0 %	50 %	0 %	50 %	478452381
4008	NC_020935	T	6	6	182316	182321	0 %	100 %	0 %	0 %	478452381
4009	NC_020935	CTC	2	6	182345	182350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452381
4010	NC_020935	GA	3	6	182390	182395	50 %	0 %	50 %	0 %	478452381
4011	NC_020935	GAT	2	6	182445	182450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452381
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4013	NC_020935	CGA	2	6	182779	182784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452381
4014	NC_020935	AAT	2	6	182805	182810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452381
4015	NC_020935	ATT	2	6	182845	182850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452381
4016	NC_020935	GTTT	2	8	182901	182908	0 %	75 %	25 %	0 %	478452381
4017	NC_020935	TGAGT	2	10	182911	182920	20 %	40 %	40 %	0 %	478452381
4018	NC_020935	CTT	2	6	182989	182994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452381
4019	NC_020935	AGA	2	6	183069	183074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452381
4020	NC_020935	TG	3	6	183102	183107	0 %	50 %	50 %	0 %	478452381
4021	NC_020935	AGGGG	2	10	183108	183117	20 %	0 %	80 %	0 %	478452381
4022	NC_020935	GA	3	6	183149	183154	50 %	0 %	50 %	0 %	478452381
4023	NC_020935	GAA	2	6	183190	183195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452381
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4026	NC_020935	AAGA	2	8	183297	183304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_020935	T	8	8	183321	183328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020935	AGAAAA	2	12	183339	183350	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020935	A	6	6	183347	183352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020935	TCG	2	6	183387	183392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452382
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4055	NC_020935	TAG	2	6	184069	184074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4058	NC_020935	AGA	2	6	184170	184175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_020935	GCA	2	6	184179	184184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4109	NC_020935	AC	3	6	186558	186563	50 %	0 %	0 %	50 %	478452386
4110	NC_020935	AGA	2	6	186657	186662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452386
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4112	NC_020935	T	6	6	186800	186805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_020935	T	7	7	186808	186814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020935	T	6	6	186820	186825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020935	T	8	8	186870	186877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020935	A	6	6	186893	186898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020935	T	6	6	186915	186920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020935	T	7	7	187010	187016	0 %	100 %	0 %	0 %	478452387
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4125	NC_020935	AAGC	2	8	187278	187285	50 %	0 %	25 %	25 %	478452387
4126	NC_020935	GAA	2	6	187308	187313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452387
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