MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020935	GTTT	2	8	135591	135598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_020935	T	7	7	135606	135612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_020935	AAT	2	6	135631	135636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_020935	AG	4	8	135752	135759	50 %	0 %	50 %	0 %	478452339
3005	NC_020935	GGATA	2	10	135764	135773	40 %	20 %	40 %	0 %	478452339
3006	NC_020935	AG	3	6	135782	135787	50 %	0 %	50 %	0 %	478452339
3007	NC_020935	GGC	2	6	135830	135835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478452339
3008	NC_020935	GTT	2	6	135873	135878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452339
3009	NC_020935	TTG	2	6	135885	135890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452339
3010	NC_020935	TGT	2	6	135920	135925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452339
3011	NC_020935	TTC	2	6	135939	135944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452339
3012	NC_020935	AGG	2	6	135965	135970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452339
3013	NC_020935	GGA	2	6	135981	135986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452339
3014	NC_020935	AG	3	6	136011	136016	50 %	0 %	50 %	0 %	478452339
3015	NC_020935	AAC	2	6	136047	136052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452339
3016	NC_020935	CAG	2	6	136066	136071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452339
3017	NC_020935	A	6	6	136143	136148	100 %	0 %	0 %	0 %	478452339
3018	NC_020935	AGG	2	6	136217	136222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_020935	AAC	2	6	136310	136315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452340
3020	NC_020935	AGC	2	6	136334	136339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452340
3021	NC_020935	GTT	2	6	136353	136358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452340
3022	NC_020935	ATT	2	6	136365	136370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452340
3023	NC_020935	GTG	2	6	136414	136419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478452340
3024	NC_020935	TAT	2	6	136439	136444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452340
3025	NC_020935	ATTGT	2	10	136461	136470	20 %	60 %	20 %	0 %	478452340
3026	NC_020935	TGG	2	6	136510	136515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478452340
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3028	NC_020935	TGA	2	6	136640	136645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452341
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3031	NC_020935	GCTA	2	8	136725	136732	25 %	25 %	25 %	25 %	478452341
3032	NC_020935	CGC	2	6	136758	136763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478452341
3033	NC_020935	TG	3	6	136784	136789	0 %	50 %	50 %	0 %	478452341
3034	NC_020935	TG	3	6	136810	136815	0 %	50 %	50 %	0 %	478452341
3035	NC_020935	TAG	2	6	136847	136852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452341
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3038	NC_020935	GT	3	6	136875	136880	0 %	50 %	50 %	0 %	478452341
3039	NC_020935	GCT	2	6	136900	136905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452341
3040	NC_020935	GGAT	2	8	136915	136922	25 %	25 %	50 %	0 %	478452341
3041	NC_020935	T	6	6	136984	136989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_020935	TGT	2	6	137037	137042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452342
3043	NC_020935	CAAT	2	8	137064	137071	50 %	25 %	0 %	25 %	478452342
3044	NC_020935	GTT	2	6	137127	137132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452342
3045	NC_020935	TTTG	2	8	137144	137151	0 %	75 %	25 %	0 %	478452342
3046	NC_020935	GCG	2	6	137187	137192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478452342
3047	NC_020935	CTG	3	9	137209	137217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452342
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3049	NC_020935	CTG	2	6	137229	137234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452342
3050	NC_020935	AAC	2	6	137240	137245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452342
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3054	NC_020935	GCT	2	6	137346	137351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452342
3055	NC_020935	CAG	2	6	137364	137369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452342
3056	NC_020935	AGG	2	6	137375	137380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452342
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3058	NC_020935	GAT	2	6	137487	137492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452342
3059	NC_020935	ATAA	2	8	137493	137500	75 %	25 %	0 %	0 %	478452342
3060	NC_020935	ACA	2	6	137503	137508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452342
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3062	NC_020935	CCT	2	6	137574	137579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_020935	T	8	8	137581	137588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_020935	TG	3	6	137620	137625	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_020935	TTGCA	2	10	137676	137685	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3066	NC_020935	GAG	2	6	137740	137745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452343
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3068	NC_020935	CT	3	6	137779	137784	0 %	50 %	0 %	50 %	478452343
3069	NC_020935	TTC	2	6	137877	137882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452343
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3072	NC_020935	TCT	2	6	138028	138033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452343
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3075	NC_020935	GAA	2	6	138167	138172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452343
3076	NC_020935	TTCT	2	8	138174	138181	0 %	75 %	0 %	25 %	478452343
3077	NC_020935	AATT	2	8	138200	138207	50 %	50 %	0 %	0 %	478452343
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3089	NC_020935	AG	3	6	138865	138870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_020935	AAGAG	2	10	138928	138937	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3092	NC_020935	TAT	2	6	138973	138978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452345
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3094	NC_020935	ATGG	2	8	139058	139065	25 %	25 %	50 %	0 %	478452345
3095	NC_020935	GTT	2	6	139100	139105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452345
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3098	NC_020935	AGAA	2	8	139408	139415	75 %	0 %	25 %	0 %	478452345
3099	NC_020935	GAAG	2	8	139454	139461	50 %	0 %	50 %	0 %	478452345
3100	NC_020935	TTGA	2	8	139466	139473	25 %	50 %	25 %	0 %	478452345
3101	NC_020935	GGT	2	6	139481	139486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478452345
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3104	NC_020935	GAAA	2	8	139579	139586	75 %	0 %	25 %	0 %	478452345
3105	NC_020935	GAA	2	6	139607	139612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452345
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3108	NC_020935	GA	3	6	139764	139769	50 %	0 %	50 %	0 %	478452346
3109	NC_020935	AAG	2	6	139795	139800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452346
3110	NC_020935	T	6	6	139972	139977	0 %	100 %	0 %	0 %	478452346
3111	NC_020935	AGG	2	6	140051	140056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452346
3112	NC_020935	A	6	6	140061	140066	100 %	0 %	0 %	0 %	478452346
3113	NC_020935	TTA	2	6	140125	140130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452346
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3117	NC_020935	AG	3	6	140399	140404	50 %	0 %	50 %	0 %	478452347
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3119	NC_020935	TTA	2	6	140506	140511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452347
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3122	NC_020935	TCCAG	2	10	140633	140642	20 %	20 %	20 %	40 %	478452347
3123	NC_020935	GAA	2	6	140684	140689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452348
3124	NC_020935	ATTG	2	8	140693	140700	25 %	50 %	25 %	0 %	478452348
3125	NC_020935	ATT	2	6	140727	140732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452348
3126	NC_020935	AAG	2	6	140788	140793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452348
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3128	NC_020935	GCA	2	6	140844	140849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452348
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3130	NC_020935	GCT	2	6	140880	140885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452348
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3138	NC_020935	TAGAT	2	10	141737	141746	40 %	40 %	20 %	0 %	478452348
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3141	NC_020935	CTG	2	6	141769	141774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452348
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3148	NC_020935	T	8	8	142059	142066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_020935	T	6	6	142104	142109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_020935	AAG	2	6	142113	142118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3151	NC_020935	AAAAG	2	10	142149	142158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_020935	T	6	6	142173	142178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3153	NC_020935	GCT	2	6	142209	142214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3155	NC_020935	ATC	2	6	142233	142238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3157	NC_020935	CTC	2	6	142432	142437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452349
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3165	NC_020935	A	6	6	143092	143097	100 %	0 %	0 %	0 %	478452350
3166	NC_020935	AT	3	6	143160	143165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3167	NC_020935	CTT	2	6	143187	143192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3168	NC_020935	AAG	2	6	143197	143202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452351
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3192	NC_020935	AGA	2	6	143904	143909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452351
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3212	NC_020935	TAA	2	6	144885	144890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_020935	T	7	7	144965	144971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3222	NC_020935	TGCG	2	8	145354	145361	0 %	25 %	50 %	25 %	478452353
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3231	NC_020935	GTA	2	6	145848	145853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452354
3232	NC_020935	TCC	2	6	145870	145875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478452354
3233	NC_020935	GTTTT	2	10	145878	145887	0 %	80 %	20 %	0 %	478452354
3234	NC_020935	CAA	2	6	145889	145894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452354
3235	NC_020935	GAT	2	6	145945	145950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452354
3236	NC_020935	A	6	6	145955	145960	100 %	0 %	0 %	0 %	478452354
3237	NC_020935	GA	4	8	145967	145974	50 %	0 %	50 %	0 %	478452354
3238	NC_020935	TCT	2	6	145996	146001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452354
3239	NC_020935	TCA	2	6	146041	146046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452354
3240	NC_020935	TGCTCT	2	12	146086	146097	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478452354
3241	NC_020935	TGA	2	6	146119	146124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452354
3242	NC_020935	TTC	2	6	146163	146168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452354
3243	NC_020935	ACG	2	6	146304	146309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452354
3244	NC_020935	AAG	2	6	146352	146357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452354
3245	NC_020935	ATT	2	6	146382	146387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452355
3246	NC_020935	GA	3	6	146415	146420	50 %	0 %	50 %	0 %	478452355
3247	NC_020935	ATG	2	6	146448	146453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452355
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3367	NC_020935	GTT	2	6	152082	152087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_020935	T	9	9	152171	152179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3369	NC_020935	TTC	2	6	152191	152196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3370	NC_020935	ATCT	2	8	152251	152258	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3371	NC_020935	GCTG	2	8	152290	152297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3372	NC_020935	GA	3	6	152341	152346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3374	NC_020935	GGA	2	6	152384	152389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3497	NC_020935	A	7	7	158244	158250	100 %	0 %	0 %	0 %	478452364
3498	NC_020935	GCA	2	6	158270	158275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452364
3499	NC_020935	CTTT	2	8	158278	158285	0 %	75 %	0 %	25 %	478452364
3500	NC_020935	CTCCAT	2	12	158302	158313	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478452364

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