MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_020935	CTGA	2	8	113563	113570	25 %	25 %	25 %	25 %	478452321
2502	NC_020935	AAT	2	6	113629	113634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452321
2503	NC_020935	GTC	2	6	113647	113652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452321
2504	NC_020935	AAT	2	6	113724	113729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452321
2505	NC_020935	CT	3	6	113866	113871	0 %	50 %	0 %	50 %	478452321
2506	NC_020935	CTT	2	6	113898	113903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452321
2507	NC_020935	CTG	2	6	113957	113962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452321
2508	NC_020935	CCA	2	6	113978	113983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452321
2509	NC_020935	AAG	2	6	114007	114012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452321
2510	NC_020935	CACC	2	8	114027	114034	25 %	0 %	0 %	75 %	478452321
2511	NC_020935	AGT	2	6	114071	114076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452321
2512	NC_020935	CAA	2	6	114096	114101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452321
2513	NC_020935	T	6	6	114152	114157	0 %	100 %	0 %	0 %	478452321
2514	NC_020935	TTC	2	6	114169	114174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452321
2515	NC_020935	TC	4	8	114185	114192	0 %	50 %	0 %	50 %	478452321
2516	NC_020935	GCA	2	6	114227	114232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452321
2517	NC_020935	GCA	2	6	114236	114241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452321
2518	NC_020935	CGA	2	6	114360	114365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452321
2519	NC_020935	A	6	6	114378	114383	100 %	0 %	0 %	0 %	478452321
2520	NC_020935	GCA	2	6	114452	114457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452321
2521	NC_020935	CTA	2	6	114483	114488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452321
2522	NC_020935	TC	3	6	114510	114515	0 %	50 %	0 %	50 %	478452321
2523	NC_020935	CTC	2	6	114561	114566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2524	NC_020935	A	7	7	114580	114586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_020935	A	8	8	114589	114596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020935	GCTCT	2	10	114623	114632	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2527	NC_020935	ATT	2	6	114657	114662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_020935	AGA	2	6	114685	114690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452322
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2530	NC_020935	AG	3	6	114811	114816	50 %	0 %	50 %	0 %	478452322
2531	NC_020935	TAC	2	6	114925	114930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452322
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2533	NC_020935	CTTT	2	8	115022	115029	0 %	75 %	0 %	25 %	478452322
2534	NC_020935	ACAG	2	8	115034	115041	50 %	0 %	25 %	25 %	478452322
2535	NC_020935	T	6	6	115066	115071	0 %	100 %	0 %	0 %	478452322
2536	NC_020935	T	6	6	115096	115101	0 %	100 %	0 %	0 %	478452322
2537	NC_020935	AACG	2	8	115156	115163	50 %	0 %	25 %	25 %	478452322
2538	NC_020935	CTG	2	6	115191	115196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452322
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2540	NC_020935	TGTTT	2	10	115247	115256	0 %	80 %	20 %	0 %	478452322
2541	NC_020935	GA	4	8	115267	115274	50 %	0 %	50 %	0 %	478452322
2542	NC_020935	AGAA	2	8	115297	115304	75 %	0 %	25 %	0 %	478452322
2543	NC_020935	ACT	2	6	115307	115312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478452322
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2547	NC_020935	GGA	2	6	115472	115477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452322
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2549	NC_020935	TTTG	2	8	115515	115522	0 %	75 %	25 %	0 %	478452322
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2552	NC_020935	TCT	2	6	115786	115791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452322
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2558	NC_020935	ACC	2	6	115939	115944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478452322
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2565	NC_020935	TCT	2	6	116312	116317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452322
2566	NC_020935	AAGC	2	8	116321	116328	50 %	0 %	25 %	25 %	478452322
2567	NC_020935	TATCG	2	10	116329	116338	20 %	40 %	20 %	20 %	478452322
2568	NC_020935	T	6	6	116345	116350	0 %	100 %	0 %	0 %	478452322
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2572	NC_020935	TAA	2	6	116472	116477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_020935	A	7	7	116494	116500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_020935	TTTTAG	2	12	116522	116533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020935	TG	3	6	116538	116543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2577	NC_020935	T	7	7	116669	116675	0 %	100 %	0 %	0 %	478452323
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2584	NC_020935	TTTG	2	8	117199	117206	0 %	75 %	25 %	0 %	478452323
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2608	NC_020935	TTG	2	6	118167	118172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452325
2609	NC_020935	CAA	2	6	118183	118188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478452325
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2612	NC_020935	TAA	2	6	118248	118253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452325
2613	NC_020935	CA	3	6	118457	118462	50 %	0 %	0 %	50 %	478452325
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2616	NC_020935	TAA	2	6	118577	118582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_020935	AT	3	6	118664	118669	50 %	50 %	0 %	0 %	478452326
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2621	NC_020935	G	6	6	118810	118815	0 %	0 %	100 %	0 %	478452326
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2623	NC_020935	GTT	2	6	118951	118956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452326
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2625	NC_020935	TTA	2	6	118981	118986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452326
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2747	NC_020935	TTGCAT	2	12	124673	124684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	478452331
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