MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada1 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22916

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020935	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452244
503	NC_020935	T	6	6	23019	23024	0 %	100 %	0 %	0 %	478452244
504	NC_020935	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478452244
505	NC_020935	CTG	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452244
506	NC_020935	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452244
507	NC_020935	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452244
508	NC_020935	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452244
509	NC_020935	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478452244
510	NC_020935	AGA	2	6	23482	23487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452244
511	NC_020935	TGA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452244
512	NC_020935	GAA	2	6	23551	23556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452244
513	NC_020935	TTG	2	6	23573	23578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452244
514	NC_020935	AGA	2	6	23633	23638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452244
515	NC_020935	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478452244
516	NC_020935	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478452244
517	NC_020935	TGC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452244
518	NC_020935	ATT	2	6	23772	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452244
519	NC_020935	AAT	2	6	23814	23819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452244
520	NC_020935	TTG	2	6	23877	23882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478452244
521	NC_020935	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478452244
522	NC_020935	TGC	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478452244
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524	NC_020935	GCA	2	6	24234	24239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478452244
525	NC_020935	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478452244
526	NC_020935	AGA	2	6	24308	24313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452244
527	NC_020935	GAG	2	6	24331	24336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452244
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530	NC_020935	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478452244
531	NC_020935	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478452244
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539	NC_020935	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452244
540	NC_020935	A	7	7	25160	25166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020935	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020935	T	9	9	25188	25196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020935	T	6	6	25221	25226	0 %	100 %	0 %	0 %	478452245
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545	NC_020935	TAA	2	6	25480	25485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478452245
546	NC_020935	GGA	3	9	25512	25520	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478452245
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549	NC_020935	TAGG	2	8	25879	25886	25 %	25 %	50 %	0 %	478452245
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551	NC_020935	TTA	2	6	25980	25985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478452245
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553	NC_020935	TAG	2	6	26041	26046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452245
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555	NC_020935	TAGG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	50 %	0 %	478452245
556	NC_020935	AGAGG	2	10	26133	26142	40 %	0 %	60 %	0 %	478452245
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559	NC_020935	T	6	6	26199	26204	0 %	100 %	0 %	0 %	478452245
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562	NC_020935	GT	3	6	26341	26346	0 %	50 %	50 %	0 %	478452245
563	NC_020935	TA	3	6	26543	26548	50 %	50 %	0 %	0 %	478452245
564	NC_020935	T	6	6	26552	26557	0 %	100 %	0 %	0 %	478452245
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579	NC_020935	ACT	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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600	NC_020935	A	7	7	27962	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	478452246
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614	NC_020935	TAA	2	6	28481	28486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020935	TC	3	6	28488	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_020935	ATTG	2	8	28539	28546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020935	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020935	AGA	2	6	28593	28598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020935	GAA	2	6	28643	28648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452248
620	NC_020935	ATCCG	2	10	28663	28672	20 %	20 %	20 %	40 %	478452248
621	NC_020935	TTC	2	6	28776	28781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452248
622	NC_020935	TAG	2	6	28824	28829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452248
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629	NC_020935	AGGGT	2	10	29181	29190	20 %	20 %	60 %	0 %	478452248
630	NC_020935	TTC	2	6	29217	29222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478452248
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632	NC_020935	GAA	2	6	29243	29248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478452248
633	NC_020935	TGA	2	6	29257	29262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478452248
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