MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_020934	GA	3	6	91184	91189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2005	NC_020934	TCA	2	6	91297	91302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449601
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2259	NC_020934	TGA	2	6	101550	101555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449610
2260	NC_020934	GA	3	6	101675	101680	50 %	0 %	50 %	0 %	478449610
2261	NC_020934	GGT	2	6	101689	101694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449610
2262	NC_020934	AG	3	6	101745	101750	50 %	0 %	50 %	0 %	478449610
2263	NC_020934	GAT	2	6	101802	101807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449610
2264	NC_020934	T	6	6	101815	101820	0 %	100 %	0 %	0 %	478449610
2265	NC_020934	AC	3	6	101827	101832	50 %	0 %	0 %	50 %	478449610
2266	NC_020934	GTA	2	6	101836	101841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449610
2267	NC_020934	A	7	7	101848	101854	100 %	0 %	0 %	0 %	478449610
2268	NC_020934	TC	3	6	101855	101860	0 %	50 %	0 %	50 %	478449610
2269	NC_020934	GA	3	6	101901	101906	50 %	0 %	50 %	0 %	478449610
2270	NC_020934	TGC	2	6	101909	101914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449610
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2273	NC_020934	GAA	2	6	102051	102056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449610
2274	NC_020934	GA	3	6	102148	102153	50 %	0 %	50 %	0 %	478449610
2275	NC_020934	TATC	2	8	102189	102196	25 %	50 %	0 %	25 %	478449610
2276	NC_020934	GAT	2	6	102229	102234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449610
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2278	NC_020934	TGC	2	6	102341	102346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449611
2279	NC_020934	A	6	6	102348	102353	100 %	0 %	0 %	0 %	478449611
2280	NC_020934	AGC	2	6	102490	102495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449611
2281	NC_020934	T	6	6	102504	102509	0 %	100 %	0 %	0 %	478449611
2282	NC_020934	TTG	2	6	102599	102604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449611
2283	NC_020934	ATT	2	6	102628	102633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449611
2284	NC_020934	GTT	2	6	102684	102689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449611
2285	NC_020934	GC	3	6	102713	102718	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2286	NC_020934	TTA	2	6	102724	102729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2287	NC_020934	AGGT	2	8	102766	102773	25 %	25 %	50 %	0 %	478449612
2288	NC_020934	GAG	2	6	102808	102813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449612
2289	NC_020934	GAAG	2	8	102824	102831	50 %	0 %	50 %	0 %	478449612
2290	NC_020934	GCT	2	6	102913	102918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449612
2291	NC_020934	T	8	8	102920	102927	0 %	100 %	0 %	0 %	478449612
2292	NC_020934	GAA	2	6	102971	102976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449612
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2295	NC_020934	A	6	6	103175	103180	100 %	0 %	0 %	0 %	478449612
2296	NC_020934	AT	3	6	103224	103229	50 %	50 %	0 %	0 %	478449612
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2299	NC_020934	AGCGA	2	10	103399	103408	40 %	0 %	40 %	20 %	478449612
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2307	NC_020934	CGA	2	6	103788	103793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449612
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2309	NC_020934	T	9	9	103820	103828	0 %	100 %	0 %	0 %	478449612
2310	NC_020934	GCA	2	6	103935	103940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449612
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2313	NC_020934	TCT	2	6	104010	104015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2344	NC_020934	GGCAT	2	10	105671	105680	20 %	20 %	40 %	20 %	478449613
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2368	NC_020934	ATA	2	6	107010	107015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449614
2369	NC_020934	A	6	6	107091	107096	100 %	0 %	0 %	0 %	478449614
2370	NC_020934	T	6	6	107179	107184	0 %	100 %	0 %	0 %	478449614
2371	NC_020934	T	6	6	107222	107227	0 %	100 %	0 %	0 %	478449614
2372	NC_020934	TA	3	6	107283	107288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_020934	AAGA	2	8	107301	107308	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_020934	T	8	8	107371	107378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_020934	TAA	3	9	107436	107444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2376	NC_020934	CTT	2	6	107480	107485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2377	NC_020934	TAG	2	6	107519	107524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449615
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2380	NC_020934	AGC	2	6	107736	107741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449615
2381	NC_020934	T	6	6	107766	107771	0 %	100 %	0 %	0 %	478449615
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