MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22945

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020934	ATG	2	6	226434	226439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449723
5003	NC_020934	CTTC	2	8	226441	226448	0 %	50 %	0 %	50 %	478449723
5004	NC_020934	TTAT	2	8	226543	226550	25 %	75 %	0 %	0 %	478449723
5005	NC_020934	CTAT	2	8	226562	226569	25 %	50 %	0 %	25 %	478449723
5006	NC_020934	TCTT	2	8	226609	226616	0 %	75 %	0 %	25 %	478449723
5007	NC_020934	TGC	2	6	226652	226657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449723
5008	NC_020934	CTTAGC	2	12	226658	226669	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	478449723
5009	NC_020934	GGA	2	6	226689	226694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449723
5010	NC_020934	CA	3	6	226697	226702	50 %	0 %	0 %	50 %	478449723
5011	NC_020934	TGG	2	6	226761	226766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449723
5012	NC_020934	TTGG	2	8	226805	226812	0 %	50 %	50 %	0 %	478449723
5013	NC_020934	TGG	3	9	226824	226832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449723
5014	NC_020934	GTC	2	6	226878	226883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449724
5015	NC_020934	CTT	2	6	226916	226921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449724
5016	NC_020934	AGA	2	6	226962	226967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449724
5017	NC_020934	CTT	2	6	226984	226989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449724
5018	NC_020934	CTA	2	6	227043	227048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478449724
5019	NC_020934	ATTT	2	8	227052	227059	25 %	75 %	0 %	0 %	478449724
5020	NC_020934	TGG	2	6	227130	227135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478449724
5021	NC_020934	AAT	3	9	227230	227238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449724
5022	NC_020934	GAA	2	6	227329	227334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449724
5023	NC_020934	GC	3	6	227341	227346	0 %	0 %	50 %	50 %	478449724
5024	NC_020934	ATT	2	6	227389	227394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449724
5025	NC_020934	GCA	2	6	227502	227507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449724
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5027	NC_020934	CATC	2	8	227558	227565	25 %	25 %	0 %	50 %	478449724
5028	NC_020934	TTA	2	6	227615	227620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449724
5029	NC_020934	TCT	3	9	227635	227643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449724
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5031	NC_020934	ATA	2	6	227755	227760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449724
5032	NC_020934	GCT	2	6	227770	227775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449724
5033	NC_020934	TCT	2	6	227905	227910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478449724
5034	NC_020934	T	6	6	228084	228089	0 %	100 %	0 %	0 %	478449724
5035	NC_020934	GC	3	6	228243	228248	0 %	0 %	50 %	50 %	478449724
5036	NC_020934	GAC	2	6	228270	228275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449724
5037	NC_020934	A	8	8	228312	228319	100 %	0 %	0 %	0 %	478449724
5038	NC_020934	TAA	2	6	228348	228353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449724
5039	NC_020934	AGA	2	6	228384	228389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449724
5040	NC_020934	GGA	2	6	228429	228434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478449724
5041	NC_020934	TGA	2	6	228444	228449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449724
5042	NC_020934	TCC	2	6	228453	228458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449724
5043	NC_020934	AATG	2	8	228481	228488	50 %	25 %	25 %	0 %	478449724
5044	NC_020934	ATT	2	6	228530	228535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478449724
5045	NC_020934	ATG	2	6	228576	228581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478449725
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5048	NC_020934	A	6	6	228682	228687	100 %	0 %	0 %	0 %	478449725
5049	NC_020934	AAG	2	6	228778	228783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449725
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5052	NC_020934	TGC	2	6	228998	229003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449725
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5055	NC_020934	C	6	6	229079	229084	0 %	0 %	0 %	100 %	478449725
5056	NC_020934	A	6	6	229119	229124	100 %	0 %	0 %	0 %	478449725
5057	NC_020934	AAG	2	6	229180	229185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478449725
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5064	NC_020934	GCTA	2	8	229513	229520	25 %	25 %	25 %	25 %	478449726
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5094	NC_020934	TTG	2	6	230949	230954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449726
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5096	NC_020934	AGA	2	6	231053	231058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_020934	GAG	2	6	231070	231075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_020934	GCT	2	6	231122	231127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_020934	ACC	2	6	231131	231136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5101	NC_020934	ACT	2	6	231226	231231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5103	NC_020934	A	6	6	231341	231346	100 %	0 %	0 %	0 %	478449727
5104	NC_020934	T	7	7	231377	231383	0 %	100 %	0 %	0 %	478449727
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5107	NC_020934	AATA	2	8	231483	231490	75 %	25 %	0 %	0 %	478449727
5108	NC_020934	TAA	2	6	231532	231537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449727
5109	NC_020934	CCT	2	6	231545	231550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449727
5110	NC_020934	TCC	2	6	231568	231573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478449727
5111	NC_020934	CTG	2	6	231588	231593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478449727
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5115	NC_020934	AG	3	6	231896	231901	50 %	0 %	50 %	0 %	478449727
5116	NC_020934	GTT	2	6	231972	231977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478449727
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5118	NC_020934	TTCC	2	8	232025	232032	0 %	50 %	0 %	50 %	478449727
5119	NC_020934	A	6	6	232043	232048	100 %	0 %	0 %	0 %	478449727
5120	NC_020934	A	6	6	232127	232132	100 %	0 %	0 %	0 %	478449727
5121	NC_020934	TAA	2	6	232197	232202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478449727
5122	NC_020934	ACG	2	6	232258	232263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478449727
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5124	NC_020934	TC	3	6	232325	232330	0 %	50 %	0 %	50 %	478449727
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