MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 22942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020933	ATT	2	6	181981	181986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_020933	AATT	2	8	182000	182007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_020933	TGT	2	6	182024	182029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_020933	T	6	6	182128	182133	0 %	100 %	0 %	0 %	478466816
4006	NC_020933	TTGAA	2	10	182154	182163	40 %	40 %	20 %	0 %	478466816
4007	NC_020933	TTTG	2	8	182168	182175	0 %	75 %	25 %	0 %	478466816
4008	NC_020933	ATC	2	6	182265	182270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478466816
4009	NC_020933	TGCA	2	8	182286	182293	25 %	25 %	25 %	25 %	478466816
4010	NC_020933	TGT	2	6	182304	182309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478466816
4011	NC_020933	AGT	2	6	182323	182328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478466816
4012	NC_020933	CT	3	6	182368	182373	0 %	50 %	0 %	50 %	478466816
4013	NC_020933	T	6	6	182373	182378	0 %	100 %	0 %	0 %	478466816
4014	NC_020933	CTC	2	6	182402	182407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478466816
4015	NC_020933	GA	3	6	182447	182452	50 %	0 %	50 %	0 %	478466816
4016	NC_020933	GAT	2	6	182502	182507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478466816
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4018	NC_020933	CGA	2	6	182836	182841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478466816
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4020	NC_020933	ATT	2	6	182902	182907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478466816
4021	NC_020933	GTTT	2	8	182958	182965	0 %	75 %	25 %	0 %	478466816
4022	NC_020933	TGAGT	2	10	182968	182977	20 %	40 %	40 %	0 %	478466816
4023	NC_020933	CTT	2	6	183046	183051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478466816
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4026	NC_020933	AGGGG	2	10	183165	183174	20 %	0 %	80 %	0 %	478466816
4027	NC_020933	GA	3	6	183206	183211	50 %	0 %	50 %	0 %	478466816
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4030	NC_020933	AGAAA	2	10	183333	183342	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020933	AAGA	2	8	183354	183361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_020933	T	8	8	183378	183385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_020933	AGAAAA	2	12	183396	183407	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_020933	A	6	6	183404	183409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_020933	TCG	2	6	183444	183449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478466817
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4039	NC_020933	AAG	2	6	183534	183539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478466817
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4041	NC_020933	TCT	2	6	183582	183587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478466817
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4043	NC_020933	GGA	2	6	183670	183675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478466817
4044	NC_020933	TTGAG	2	10	183715	183724	20 %	40 %	40 %	0 %	478466817
4045	NC_020933	ATAGA	2	10	183737	183746	60 %	20 %	20 %	0 %	478466817
4046	NC_020933	CT	3	6	183790	183795	0 %	50 %	0 %	50 %	478466817
4047	NC_020933	TGA	2	6	183804	183809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478466817
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4063	NC_020933	AGA	2	6	184227	184232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020933	GCA	2	6	184236	184241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_020933	TA	3	6	184271	184276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4092	NC_020933	GA	3	6	185160	185165	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4106	NC_020933	GCA	2	6	185916	185921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478466820
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4110	NC_020933	TCTA	2	8	186383	186390	25 %	50 %	0 %	25 %	478466820
4111	NC_020933	GTT	2	6	186443	186448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4114	NC_020933	AC	3	6	186615	186620	50 %	0 %	0 %	50 %	478466821
4115	NC_020933	AGA	2	6	186714	186719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478466821
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4119	NC_020933	T	6	6	186877	186882	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020933	T	8	8	186927	186934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_020933	A	6	6	186950	186955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_020933	T	6	6	186972	186977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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