MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Ams1 complete genome

Total Repeats: 22942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_020933	GCA	2	6	631241	631246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467226
14003	NC_020933	CTT	2	6	631257	631262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467226
14004	NC_020933	CTC	2	6	631281	631286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467226
14005	NC_020933	A	6	6	631311	631316	100 %	0 %	0 %	0 %	478467226
14006	NC_020933	CCT	2	6	631376	631381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467226
14007	NC_020933	AAG	2	6	631383	631388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467226
14008	NC_020933	TCC	2	6	631394	631399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467226
14009	NC_020933	CCT	2	6	631491	631496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467226
14010	NC_020933	ATT	2	6	631508	631513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467226
14011	NC_020933	TTC	2	6	631521	631526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467226
14012	NC_020933	ACA	2	6	631546	631551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467226
14013	NC_020933	CCT	2	6	631556	631561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467226
14014	NC_020933	A	6	6	631643	631648	100 %	0 %	0 %	0 %	478467226
14015	NC_020933	TCGAG	2	10	631653	631662	20 %	20 %	40 %	20 %	478467226
14016	NC_020933	T	6	6	631680	631685	0 %	100 %	0 %	0 %	478467226
14017	NC_020933	TTG	2	6	631710	631715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467226
14018	NC_020933	TCCT	2	8	631745	631752	0 %	50 %	0 %	50 %	478467226
14019	NC_020933	CAA	2	6	631829	631834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467226
14020	NC_020933	ATC	2	6	631856	631861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467226
14021	NC_020933	TCA	2	6	631872	631877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467226
14022	NC_020933	CTTT	2	8	631926	631933	0 %	75 %	0 %	25 %	478467226
14023	NC_020933	ATG	3	9	631976	631984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467226
14024	NC_020933	TC	4	8	632001	632008	0 %	50 %	0 %	50 %	478467226
14025	NC_020933	CTA	2	6	632054	632059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467226
14026	NC_020933	TGA	2	6	632067	632072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467226
14027	NC_020933	CAA	2	6	632111	632116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467227
14028	NC_020933	TTTG	2	8	632130	632137	0 %	75 %	25 %	0 %	478467227
14029	NC_020933	TTA	2	6	632158	632163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467227
14030	NC_020933	CTC	2	6	632180	632185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467227
14031	NC_020933	TAT	2	6	632187	632192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467227
14032	NC_020933	TGG	2	6	632216	632221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478467227
14033	NC_020933	AGC	2	6	632232	632237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467227
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14035	NC_020933	TGC	2	6	632343	632348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467227
14036	NC_020933	GGCTC	2	10	632417	632426	0 %	20 %	40 %	40 %	478467228
14037	NC_020933	TA	3	6	632440	632445	50 %	50 %	0 %	0 %	478467228
14038	NC_020933	AGCC	2	8	632453	632460	25 %	0 %	25 %	50 %	478467228
14039	NC_020933	TCTT	2	8	632477	632484	0 %	75 %	0 %	25 %	478467228
14040	NC_020933	ATC	2	6	632518	632523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467228
14041	NC_020933	CT	3	6	632575	632580	0 %	50 %	0 %	50 %	478467228
14042	NC_020933	TGC	2	6	632591	632596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467228
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14044	NC_020933	TGC	2	6	632721	632726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467228
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14046	NC_020933	CT	3	6	632787	632792	0 %	50 %	0 %	50 %	478467228
14047	NC_020933	ATT	2	6	632834	632839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467228
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14050	NC_020933	ATG	2	6	632944	632949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467228
14051	NC_020933	CAG	2	6	633029	633034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467228
14052	NC_020933	ATC	2	6	633070	633075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467228
14053	NC_020933	CTC	2	6	633086	633091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467228
14054	NC_020933	CTAC	2	8	633105	633112	25 %	25 %	0 %	50 %	478467228
14055	NC_020933	TGG	2	6	633160	633165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478467228
14056	NC_020933	ATT	2	6	633185	633190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478467228
14057	NC_020933	CTA	2	6	633218	633223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467228
14058	NC_020933	TCC	2	6	633240	633245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467228
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14060	NC_020933	CTCC	2	8	633274	633281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14061	NC_020933	A	6	6	633282	633287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_020933	TTC	2	6	633295	633300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_020933	TTG	2	6	633321	633326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_020933	TGC	2	6	633365	633370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467229
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14069	NC_020933	TG	3	6	633688	633693	0 %	50 %	50 %	0 %	478467229
14070	NC_020933	GAG	2	6	633749	633754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478467229
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14072	NC_020933	T	6	6	633794	633799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_020933	A	6	6	633860	633865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_020933	TCT	2	6	633882	633887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467230
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14093	NC_020933	TCGTT	2	10	634686	634695	0 %	60 %	20 %	20 %	478467230
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14100	NC_020933	CCTT	2	8	634921	634928	0 %	50 %	0 %	50 %	478467231
14101	NC_020933	TCCAT	2	10	634987	634996	20 %	40 %	0 %	40 %	478467231
14102	NC_020933	AGAA	2	8	634997	635004	75 %	0 %	25 %	0 %	478467231
14103	NC_020933	CCT	2	6	635038	635043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467231
14104	NC_020933	CT	3	6	635042	635047	0 %	50 %	0 %	50 %	478467231
14105	NC_020933	CTA	2	6	635056	635061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467231
14106	NC_020933	GAAA	2	8	635150	635157	75 %	0 %	25 %	0 %	478467231
14107	NC_020933	A	6	6	635155	635160	100 %	0 %	0 %	0 %	478467231
14108	NC_020933	CTCTTT	2	12	635258	635269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467231
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14112	NC_020933	TAAACA	2	12	635386	635397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478467231
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14115	NC_020933	GA	3	6	635588	635593	50 %	0 %	50 %	0 %	478467232
14116	NC_020933	TCC	2	6	635624	635629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467232
14117	NC_020933	A	7	7	635635	635641	100 %	0 %	0 %	0 %	478467232
14118	NC_020933	ATGC	2	8	635651	635658	25 %	25 %	25 %	25 %	478467232
14119	NC_020933	ACGA	2	8	635691	635698	50 %	0 %	25 %	25 %	478467232
14120	NC_020933	GA	4	8	635750	635757	50 %	0 %	50 %	0 %	478467232
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14122	NC_020933	CTA	2	6	635769	635774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467232
14123	NC_020933	A	6	6	635777	635782	100 %	0 %	0 %	0 %	478467232
14124	NC_020933	ACA	2	6	635853	635858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467233
14125	NC_020933	TCAT	2	8	635874	635881	25 %	50 %	0 %	25 %	478467233
14126	NC_020933	AAG	2	6	635888	635893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467233
14127	NC_020933	TCT	2	6	635895	635900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467233
14128	NC_020933	AAG	2	6	635915	635920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467233
14129	NC_020933	TTTC	2	8	635921	635928	0 %	75 %	0 %	25 %	478467233
14130	NC_020933	CAC	2	6	635937	635942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478467233
14131	NC_020933	TCT	2	6	635949	635954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467233
14132	NC_020933	CAT	2	6	636014	636019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467233
14133	NC_020933	CCA	2	6	636108	636113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478467233
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14135	NC_020933	CAT	2	6	636140	636145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467233
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14137	NC_020933	TTC	2	6	636183	636188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467233
14138	NC_020933	CCT	2	6	636197	636202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14139	NC_020933	GAA	2	6	636236	636241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467234
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14150	NC_020933	TCC	2	6	636726	636731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467234
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14152	NC_020933	AGAA	2	8	636850	636857	75 %	0 %	25 %	0 %	478467234
14153	NC_020933	CAC	2	6	636858	636863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478467234
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14161	NC_020933	AGC	2	6	637281	637286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478467234
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14163	NC_020933	CT	3	6	637293	637298	0 %	50 %	0 %	50 %	478467234
14164	NC_020933	CGT	2	6	637333	637338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467234
14165	NC_020933	T	6	6	637338	637343	0 %	100 %	0 %	0 %	478467234
14166	NC_020933	CCT	2	6	637387	637392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14167	NC_020933	CGGAA	2	10	637603	637612	40 %	0 %	40 %	20 %	478467235
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14169	NC_020933	CA	3	6	637700	637705	50 %	0 %	0 %	50 %	478467235
14170	NC_020933	TTG	2	6	637765	637770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467235
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14172	NC_020933	CAT	2	6	637828	637833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467235
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14175	NC_020933	TA	3	6	638089	638094	50 %	50 %	0 %	0 %	478467235
14176	NC_020933	GTC	2	6	638100	638105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467235
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14179	NC_020933	ACC	2	6	638247	638252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478467235
14180	NC_020933	ATGA	2	8	638261	638268	50 %	25 %	25 %	0 %	478467235
14181	NC_020933	TCC	2	6	638303	638308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467235
14182	NC_020933	TAA	2	6	638386	638391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467235
14183	NC_020933	GCTC	2	8	638499	638506	0 %	25 %	25 %	50 %	478467235
14184	NC_020933	AAG	2	6	638573	638578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467235
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14186	NC_020933	AAT	2	6	638684	638689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478467235
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14222	NC_020933	AGCG	2	8	640171	640178	25 %	0 %	50 %	25 %	478467236
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14229	NC_020933	AGA	2	6	640491	640496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478467236
14230	NC_020933	CTT	2	6	640676	640681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467236
14231	NC_020933	GAT	2	6	640799	640804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478467236
14232	NC_020933	C	9	9	640829	640837	0 %	0 %	0 %	100 %	478467236
14233	NC_020933	GTT	2	6	640883	640888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478467236
14234	NC_020933	TC	3	6	640937	640942	0 %	50 %	0 %	50 %	478467236
14235	NC_020933	GA	3	6	640953	640958	50 %	0 %	50 %	0 %	478467236
14236	NC_020933	CTT	2	6	640964	640969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467236
14237	NC_020933	CAT	2	6	640988	640993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478467236
14238	NC_020933	CAAA	2	8	641121	641128	75 %	0 %	0 %	25 %	478467236
14239	NC_020933	TCC	2	6	641172	641177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478467237
14240	NC_020933	CAA	2	6	641270	641275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478467237
14241	NC_020933	TCT	2	6	641383	641388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478467237
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14244	NC_020933	CTG	2	6	641474	641479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467237
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14247	NC_020933	CTG	2	6	641580	641585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478467237
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14363	NC_020933	A	6	6	646336	646341	100 %	0 %	0 %	0 %	478467241
14364	NC_020933	CAAG	2	8	646350	646357	50 %	0 %	25 %	25 %	478467241
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14489	NC_020933	GT	3	6	652727	652732	0 %	50 %	50 %	0 %	478467245
14490	NC_020933	TC	3	6	652757	652762	0 %	50 %	0 %	50 %	478467245
14491	NC_020933	TCCT	2	8	652800	652807	0 %	50 %	0 %	50 %	478467245
14492	NC_020933	ATT	2	6	652850	652855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14493	NC_020933	CA	3	6	652862	652867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14494	NC_020933	A	6	6	652940	652945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14498	NC_020933	TCC	2	6	653229	653234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14499	NC_020933	GGC	2	6	653294	653299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478467246
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