MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_020932	TTGAA	2	10	182010	182019	40 %	40 %	20 %	0 %	478453295
4003	NC_020932	TTTG	2	8	182024	182031	0 %	75 %	25 %	0 %	478453295
4004	NC_020932	ATC	2	6	182121	182126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453295
4005	NC_020932	TGCA	2	8	182142	182149	25 %	25 %	25 %	25 %	478453295
4006	NC_020932	TGT	2	6	182160	182165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453295
4007	NC_020932	AGT	2	6	182179	182184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453295
4008	NC_020932	CT	3	6	182224	182229	0 %	50 %	0 %	50 %	478453295
4009	NC_020932	T	6	6	182229	182234	0 %	100 %	0 %	0 %	478453295
4010	NC_020932	CTC	2	6	182258	182263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453295
4011	NC_020932	GA	3	6	182303	182308	50 %	0 %	50 %	0 %	478453295
4012	NC_020932	GAT	2	6	182358	182363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453295
4013	NC_020932	AAAG	2	8	182511	182518	75 %	0 %	25 %	0 %	478453295
4014	NC_020932	CGA	2	6	182692	182697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453295
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4016	NC_020932	ATT	2	6	182758	182763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453295
4017	NC_020932	GTTT	2	8	182814	182821	0 %	75 %	25 %	0 %	478453295
4018	NC_020932	TGAGT	2	10	182824	182833	20 %	40 %	40 %	0 %	478453295
4019	NC_020932	CTT	2	6	182902	182907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453295
4020	NC_020932	AGA	2	6	182982	182987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453295
4021	NC_020932	TG	3	6	183015	183020	0 %	50 %	50 %	0 %	478453295
4022	NC_020932	AGGGG	2	10	183021	183030	20 %	0 %	80 %	0 %	478453295
4023	NC_020932	GA	3	6	183062	183067	50 %	0 %	50 %	0 %	478453295
4024	NC_020932	GAA	2	6	183103	183108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453295
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4027	NC_020932	AAGA	2	8	183210	183217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_020932	T	8	8	183234	183241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_020932	AGAAAA	2	12	183252	183263	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_020932	A	6	6	183260	183265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_020932	TCG	2	6	183300	183305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453296
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4034	NC_020932	T	7	7	183337	183343	0 %	100 %	0 %	0 %	478453296
4035	NC_020932	AAG	2	6	183390	183395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453296
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4041	NC_020932	ATAGA	2	10	183593	183602	60 %	20 %	20 %	0 %	478453296
4042	NC_020932	CT	3	6	183646	183651	0 %	50 %	0 %	50 %	478453296
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4054	NC_020932	GCG	2	6	183900	183905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478453296
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4057	NC_020932	GCA	2	6	184029	184034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4060	NC_020932	GCA	2	6	184092	184097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4062	NC_020932	GAA	2	6	184162	184167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_020932	AGA	2	6	184201	184206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_020932	GA	3	6	184240	184245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_020932	GTT	2	6	184257	184262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_020932	A	8	8	184865	184872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4107	NC_020932	GTT	2	6	186299	186304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_020932	TGC	2	6	186432	186437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453300
4109	NC_020932	CA	3	6	186453	186458	50 %	0 %	0 %	50 %	478453300
4110	NC_020932	AC	3	6	186471	186476	50 %	0 %	0 %	50 %	478453300
4111	NC_020932	AGA	2	6	186570	186575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453300
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4113	NC_020932	T	6	6	186713	186718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_020932	T	7	7	186721	186727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_020932	T	6	6	186733	186738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_020932	T	8	8	186783	186790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_020932	A	6	6	186806	186811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_020932	T	6	6	186828	186833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_020932	T	7	7	186923	186929	0 %	100 %	0 %	0 %	478453301
4120	NC_020932	TCT	2	6	186947	186952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453301
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4122	NC_020932	GTC	2	6	187048	187053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453301
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4125	NC_020932	CTT	2	6	187153	187158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453301
4126	NC_020932	AAGC	2	8	187191	187198	50 %	0 %	25 %	25 %	478453301
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4256	NC_020932	TCT	2	6	193062	193067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453307
4257	NC_020932	T	7	7	193074	193080	0 %	100 %	0 %	0 %	478453307
4258	NC_020932	AGA	2	6	193241	193246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_020932	A	7	7	193298	193304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_020932	A	7	7	193328	193334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4261	NC_020932	AG	3	6	193350	193355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_020932	AAT	2	6	193360	193365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_020932	T	9	9	193380	193388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_020932	T	6	6	193427	193432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4265	NC_020932	TAC	2	6	193471	193476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_020932	ATT	2	6	193480	193485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_020932	ATC	2	6	193576	193581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453308
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4270	NC_020932	CT	3	6	193687	193692	0 %	50 %	0 %	50 %	478453308
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4273	NC_020932	ATC	2	6	193750	193755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453308
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4277	NC_020932	TGT	2	6	193817	193822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453308
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4281	NC_020932	T	6	6	194041	194046	0 %	100 %	0 %	0 %	478453308
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4332	NC_020932	A	8	8	196324	196331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4334	NC_020932	CTT	2	6	196351	196356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4372	NC_020932	GAAA	2	8	198037	198044	75 %	0 %	25 %	0 %	478453312
4373	NC_020932	ACC	2	6	198072	198077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453312
4374	NC_020932	A	6	6	198091	198096	100 %	0 %	0 %	0 %	478453312
4375	NC_020932	A	6	6	198120	198125	100 %	0 %	0 %	0 %	478453312
4376	NC_020932	AG	3	6	198174	198179	50 %	0 %	50 %	0 %	478453312
4377	NC_020932	CT	3	6	198186	198191	0 %	50 %	0 %	50 %	478453312
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4498	NC_020932	A	6	6	204097	204102	100 %	0 %	0 %	0 %	478453318
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