MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020932	CTCCAT	2	12	158215	158226	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478453277
3502	NC_020932	ATT	2	6	158293	158298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453277
3503	NC_020932	GAT	2	6	158319	158324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453277
3504	NC_020932	TTG	2	6	158333	158338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453277
3505	NC_020932	A	6	6	158362	158367	100 %	0 %	0 %	0 %	478453277
3506	NC_020932	T	6	6	158441	158446	0 %	100 %	0 %	0 %	478453277
3507	NC_020932	ATG	2	6	158491	158496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453277
3508	NC_020932	TGT	2	6	158504	158509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453277
3509	NC_020932	TG	3	6	158542	158547	0 %	50 %	50 %	0 %	478453277
3510	NC_020932	T	6	6	158561	158566	0 %	100 %	0 %	0 %	478453277
3511	NC_020932	AGA	2	6	158583	158588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453277
3512	NC_020932	AAAG	2	8	158620	158627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_020932	TTTA	2	8	158629	158636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_020932	CTC	2	6	158681	158686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_020932	CTA	2	6	158690	158695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_020932	AAG	2	6	158732	158737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_020932	TAAT	2	8	158746	158753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020932	TCCTTG	2	12	158811	158822	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478453278
3519	NC_020932	GAA	2	6	158832	158837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453278
3520	NC_020932	GTT	2	6	158849	158854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453278
3521	NC_020932	TTA	2	6	159020	159025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453278
3522	NC_020932	CG	3	6	159052	159057	0 %	0 %	50 %	50 %	478453278
3523	NC_020932	AGA	2	6	159078	159083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453278
3524	NC_020932	CAT	2	6	159087	159092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453278
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3527	NC_020932	T	6	6	159251	159256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_020932	T	6	6	159375	159380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_020932	G	7	7	159381	159387	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_020932	GTT	2	6	159495	159500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_020932	T	7	7	159525	159531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020932	A	6	6	159559	159564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020932	TAAT	2	8	159582	159589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020932	ATT	2	6	159649	159654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453279
3535	NC_020932	AAAG	2	8	159773	159780	75 %	0 %	25 %	0 %	478453279
3536	NC_020932	CAT	2	6	159801	159806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453279
3537	NC_020932	TCAA	2	8	159862	159869	50 %	25 %	0 %	25 %	478453279
3538	NC_020932	GAA	2	6	160087	160092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453279
3539	NC_020932	TC	3	6	160122	160127	0 %	50 %	0 %	50 %	478453279
3540	NC_020932	GT	3	6	160160	160165	0 %	50 %	50 %	0 %	478453279
3541	NC_020932	AAT	2	6	160204	160209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453279
3542	NC_020932	GGA	2	6	160216	160221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453279
3543	NC_020932	AGGAA	2	10	160245	160254	60 %	0 %	40 %	0 %	478453279
3544	NC_020932	TAG	2	6	160275	160280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453279
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3546	NC_020932	CTG	2	6	160301	160306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453279
3547	NC_020932	AG	3	6	160332	160337	50 %	0 %	50 %	0 %	478453279
3548	NC_020932	TCT	2	6	160360	160365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453279
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3556	NC_020932	GA	3	6	160813	160818	50 %	0 %	50 %	0 %	478453280
3557	NC_020932	ATT	2	6	160833	160838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453280
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3560	NC_020932	A	8	8	160998	161005	100 %	0 %	0 %	0 %	478453280
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3573	NC_020932	A	6	6	161931	161936	100 %	0 %	0 %	0 %	478453281
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3592	NC_020932	GAA	3	9	162711	162719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453282
3593	NC_020932	TTTC	2	8	162814	162821	0 %	75 %	0 %	25 %	478453282
3594	NC_020932	ATCT	2	8	162840	162847	25 %	50 %	0 %	25 %	478453282
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3608	NC_020932	AGAGA	2	10	163485	163494	60 %	0 %	40 %	0 %	478453282
3609	NC_020932	ATT	2	6	163508	163513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453282
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3612	NC_020932	TGT	2	6	163778	163783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453282
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3619	NC_020932	TAC	2	6	163946	163951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453282
3620	NC_020932	TGGC	2	8	163996	164003	0 %	25 %	50 %	25 %	478453282
3621	NC_020932	CCT	2	6	164085	164090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453282
3622	NC_020932	GT	3	6	164104	164109	0 %	50 %	50 %	0 %	478453282
3623	NC_020932	GAG	2	6	164113	164118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453282
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3626	NC_020932	GAT	2	6	164257	164262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453283
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