MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020932	AG	4	8	135606	135613	50 %	0 %	50 %	0 %	478453252
3002	NC_020932	GGATA	2	10	135618	135627	40 %	20 %	40 %	0 %	478453252
3003	NC_020932	AG	3	6	135636	135641	50 %	0 %	50 %	0 %	478453252
3004	NC_020932	GGC	2	6	135684	135689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478453252
3005	NC_020932	GTT	2	6	135727	135732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453252
3006	NC_020932	TTG	2	6	135739	135744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453252
3007	NC_020932	TGT	2	6	135774	135779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453252
3008	NC_020932	TTC	2	6	135793	135798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453252
3009	NC_020932	AGG	2	6	135819	135824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453252
3010	NC_020932	GGA	2	6	135835	135840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453252
3011	NC_020932	AG	3	6	135865	135870	50 %	0 %	50 %	0 %	478453252
3012	NC_020932	AAC	2	6	135901	135906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453252
3013	NC_020932	CAG	2	6	135920	135925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453252
3014	NC_020932	A	6	6	135997	136002	100 %	0 %	0 %	0 %	478453252
3015	NC_020932	AGG	2	6	136071	136076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_020932	AAC	2	6	136164	136169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453253
3017	NC_020932	AGC	2	6	136188	136193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453253
3018	NC_020932	GTT	2	6	136207	136212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453253
3019	NC_020932	ATT	2	6	136219	136224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453253
3020	NC_020932	GTG	2	6	136268	136273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453253
3021	NC_020932	TAT	2	6	136293	136298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453253
3022	NC_020932	ATTGT	2	10	136315	136324	20 %	60 %	20 %	0 %	478453253
3023	NC_020932	TGG	2	6	136364	136369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453253
3024	NC_020932	CTG	2	6	136415	136420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453253
3025	NC_020932	TGA	2	6	136494	136499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453254
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3028	NC_020932	GCTA	2	8	136579	136586	25 %	25 %	25 %	25 %	478453254
3029	NC_020932	CGC	2	6	136612	136617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453254
3030	NC_020932	TG	3	6	136638	136643	0 %	50 %	50 %	0 %	478453254
3031	NC_020932	TG	3	6	136664	136669	0 %	50 %	50 %	0 %	478453254
3032	NC_020932	TAG	2	6	136701	136706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453254
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3035	NC_020932	GT	3	6	136729	136734	0 %	50 %	50 %	0 %	478453254
3036	NC_020932	GCT	2	6	136754	136759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453254
3037	NC_020932	GGAT	2	8	136769	136776	25 %	25 %	50 %	0 %	478453254
3038	NC_020932	T	6	6	136838	136843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_020932	TGT	2	6	136891	136896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453255
3040	NC_020932	CAAT	2	8	136918	136925	50 %	25 %	0 %	25 %	478453255
3041	NC_020932	GTT	2	6	136981	136986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453255
3042	NC_020932	TTTG	2	8	136998	137005	0 %	75 %	25 %	0 %	478453255
3043	NC_020932	GCG	2	6	137041	137046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478453255
3044	NC_020932	CTG	3	9	137063	137071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453255
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3046	NC_020932	CTG	2	6	137083	137088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453255
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3052	NC_020932	CAG	2	6	137218	137223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453255
3053	NC_020932	AGG	2	6	137229	137234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453255
3054	NC_020932	CAC	2	6	137258	137263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453255
3055	NC_020932	GAT	2	6	137341	137346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453255
3056	NC_020932	ATAA	2	8	137347	137354	75 %	25 %	0 %	0 %	478453255
3057	NC_020932	ACA	2	6	137357	137362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453255
3058	NC_020932	AGG	2	6	137418	137423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_020932	CCT	2	6	137428	137433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_020932	T	8	8	137435	137442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_020932	TG	3	6	137474	137479	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_020932	TTGCA	2	10	137530	137539	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3063	NC_020932	GAG	2	6	137594	137599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453256
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3065	NC_020932	CT	3	6	137633	137638	0 %	50 %	0 %	50 %	478453256
3066	NC_020932	TTC	2	6	137731	137736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453256
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3069	NC_020932	TCT	2	6	137882	137887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453256
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3074	NC_020932	AATT	2	8	138054	138061	50 %	50 %	0 %	0 %	478453256
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3087	NC_020932	AAGAG	2	10	138782	138791	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3091	NC_020932	ATGG	2	8	138912	138919	25 %	25 %	50 %	0 %	478453258
3092	NC_020932	GTT	2	6	138954	138959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453258
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3094	NC_020932	TC	3	6	139147	139152	0 %	50 %	0 %	50 %	478453258
3095	NC_020932	AGAA	2	8	139262	139269	75 %	0 %	25 %	0 %	478453258
3096	NC_020932	GAAG	2	8	139308	139315	50 %	0 %	50 %	0 %	478453258
3097	NC_020932	TTGA	2	8	139320	139327	25 %	50 %	25 %	0 %	478453258
3098	NC_020932	GGT	2	6	139335	139340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453258
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3101	NC_020932	GAAA	2	8	139433	139440	75 %	0 %	25 %	0 %	478453258
3102	NC_020932	GAA	2	6	139461	139466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453258
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3105	NC_020932	GA	3	6	139618	139623	50 %	0 %	50 %	0 %	478453259
3106	NC_020932	AAG	2	6	139649	139654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453259
3107	NC_020932	T	6	6	139826	139831	0 %	100 %	0 %	0 %	478453259
3108	NC_020932	AGG	2	6	139905	139910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453259
3109	NC_020932	A	6	6	139915	139920	100 %	0 %	0 %	0 %	478453259
3110	NC_020932	TTA	2	6	139979	139984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453259
3111	NC_020932	TAA	2	6	140082	140087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453260
3112	NC_020932	GAGTTA	2	12	140122	140133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453260
3113	NC_020932	AAGA	2	8	140204	140211	75 %	0 %	25 %	0 %	478453260
3114	NC_020932	AG	3	6	140253	140258	50 %	0 %	50 %	0 %	478453260
3115	NC_020932	GAA	2	6	140265	140270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453260
3116	NC_020932	TTA	2	6	140360	140365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453260
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3119	NC_020932	TCCAG	2	10	140487	140496	20 %	20 %	20 %	40 %	478453260
3120	NC_020932	GAA	2	6	140538	140543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453261
3121	NC_020932	ATTG	2	8	140547	140554	25 %	50 %	25 %	0 %	478453261
3122	NC_020932	ATT	2	6	140581	140586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453261
3123	NC_020932	AAG	2	6	140642	140647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453261
3124	NC_020932	CTT	2	6	140659	140664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453261
3125	NC_020932	GCA	2	6	140698	140703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453261
3126	NC_020932	CCTA	2	8	140708	140715	25 %	25 %	0 %	50 %	478453261
3127	NC_020932	GCT	2	6	140734	140739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453261
3128	NC_020932	GTG	2	6	140941	140946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453261
3129	NC_020932	TCA	2	6	140999	141004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453261
3130	NC_020932	TAA	2	6	141108	141113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453261
3131	NC_020932	GTACA	2	10	141218	141227	40 %	20 %	20 %	20 %	478453261
3132	NC_020932	AGA	2	6	141249	141254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453261
3133	NC_020932	GAA	2	6	141433	141438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453261
3134	NC_020932	TAA	2	6	141567	141572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453261
3135	NC_020932	TAGAT	2	10	141591	141600	40 %	40 %	20 %	0 %	478453261
3136	NC_020932	TAT	2	6	141601	141606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453261
3137	NC_020932	CTCC	2	8	141607	141614	0 %	25 %	0 %	75 %	478453261
3138	NC_020932	CTG	2	6	141623	141628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453261
3139	NC_020932	CCT	2	6	141667	141672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453261
3140	NC_020932	TAT	2	6	141673	141678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453261
3141	NC_020932	TGG	2	6	141768	141773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453261
3142	NC_020932	TCA	2	6	141795	141800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453261
3143	NC_020932	TCT	2	6	141825	141830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453261
3144	NC_020932	ATTA	2	8	141844	141851	50 %	50 %	0 %	0 %	478453261
3145	NC_020932	T	8	8	141913	141920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_020932	T	6	6	141958	141963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3147	NC_020932	AAG	2	6	141967	141972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_020932	AAAAG	2	10	142003	142012	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3149	NC_020932	T	6	6	142027	142032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3150	NC_020932	GCT	2	6	142063	142068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3151	NC_020932	A	6	6	142079	142084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3152	NC_020932	ATC	2	6	142087	142092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3153	NC_020932	A	6	6	142136	142141	100 %	0 %	0 %	0 %	478453262
3154	NC_020932	CTC	2	6	142286	142291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453262
3155	NC_020932	AAAAC	2	10	142483	142492	80 %	0 %	0 %	20 %	478453262
3156	NC_020932	AGA	2	6	142637	142642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453263
3157	NC_020932	TGGAAA	2	12	142675	142686	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478453263
3158	NC_020932	GGA	2	6	142811	142816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453263
3159	NC_020932	AGAA	2	8	142875	142882	75 %	0 %	25 %	0 %	478453263
3160	NC_020932	CTT	2	6	142912	142917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453263
3161	NC_020932	AAGA	2	8	142934	142941	75 %	0 %	25 %	0 %	478453263
3162	NC_020932	A	6	6	142946	142951	100 %	0 %	0 %	0 %	478453263
3163	NC_020932	AT	3	6	143014	143019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3164	NC_020932	CTT	2	6	143041	143046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3165	NC_020932	AAG	2	6	143051	143056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453264
3166	NC_020932	AAAG	2	8	143131	143138	75 %	0 %	25 %	0 %	478453264
3167	NC_020932	T	6	6	143175	143180	0 %	100 %	0 %	0 %	478453264
3168	NC_020932	GCA	2	6	143183	143188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453264
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3170	NC_020932	TCA	2	6	143214	143219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453264
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3172	NC_020932	TCC	2	6	143266	143271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453264
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3176	NC_020932	GAAA	2	8	143464	143471	75 %	0 %	25 %	0 %	478453264
3177	NC_020932	AG	3	6	143483	143488	50 %	0 %	50 %	0 %	478453264
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3183	NC_020932	GGAGC	2	10	143616	143625	20 %	0 %	60 %	20 %	478453264
3184	NC_020932	A	6	6	143657	143662	100 %	0 %	0 %	0 %	478453264
3185	NC_020932	CTT	2	6	143664	143669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453264
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3189	NC_020932	AGA	2	6	143758	143763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453264
3190	NC_020932	ATGGTT	2	12	143794	143805	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478453264
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3192	NC_020932	TTG	2	6	143953	143958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3193	NC_020932	TCA	2	6	144001	144006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453265
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3199	NC_020932	GAA	2	6	144247	144252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453265
3200	NC_020932	TTG	2	6	144258	144263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453265
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3202	NC_020932	GAAA	2	8	144459	144466	75 %	0 %	25 %	0 %	478453265
3203	NC_020932	GTC	2	6	144467	144472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453265
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3209	NC_020932	TAA	2	6	144739	144744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3210	NC_020932	T	7	7	144803	144809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3211	NC_020932	T	7	7	144832	144838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3212	NC_020932	T	7	7	144865	144871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_020932	CTT	2	6	144968	144973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453266
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3221	NC_020932	TGCG	2	8	145254	145261	0 %	25 %	50 %	25 %	478453266
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3227	NC_020932	AG	3	6	145408	145413	50 %	0 %	50 %	0 %	478453266
3228	NC_020932	GTA	2	6	145427	145432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453266
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3230	NC_020932	GTA	2	6	145748	145753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453267
3231	NC_020932	TCC	2	6	145770	145775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453267
3232	NC_020932	GTTTT	2	10	145778	145787	0 %	80 %	20 %	0 %	478453267
3233	NC_020932	CAA	2	6	145789	145794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453267
3234	NC_020932	GAT	2	6	145845	145850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453267
3235	NC_020932	A	6	6	145855	145860	100 %	0 %	0 %	0 %	478453267
3236	NC_020932	GA	4	8	145867	145874	50 %	0 %	50 %	0 %	478453267
3237	NC_020932	TCT	2	6	145896	145901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453267
3238	NC_020932	TCA	2	6	145941	145946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453267
3239	NC_020932	TGCTCT	2	12	145986	145997	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478453267
3240	NC_020932	TGA	2	6	146019	146024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453267
3241	NC_020932	TTC	2	6	146063	146068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453267
3242	NC_020932	ACG	2	6	146204	146209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453267
3243	NC_020932	AAG	2	6	146252	146257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453267
3244	NC_020932	ATT	2	6	146282	146287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453268
3245	NC_020932	GA	3	6	146315	146320	50 %	0 %	50 %	0 %	478453268
3246	NC_020932	ATG	2	6	146348	146353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453268
3247	NC_020932	AAT	2	6	146356	146361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453268
3248	NC_020932	AGA	2	6	146430	146435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453268
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3250	NC_020932	T	6	6	146488	146493	0 %	100 %	0 %	0 %	478453268
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3367	NC_020932	AAG	2	6	151987	151992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3368	NC_020932	GTT	2	6	151995	152000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3369	NC_020932	T	9	9	152084	152092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3370	NC_020932	TTC	2	6	152104	152109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3371	NC_020932	ATCT	2	8	152164	152171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3372	NC_020932	GCTG	2	8	152203	152210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3373	NC_020932	GA	3	6	152254	152259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3374	NC_020932	GCG	2	6	152291	152296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3375	NC_020932	GGA	2	6	152297	152302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_020932	GCA	2	6	158183	158188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453277
3500	NC_020932	CTTT	2	8	158191	158198	0 %	75 %	0 %	25 %	478453277

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