MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22501	NC_020932	CGA	2	6	1021424	1021429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454024
22502	NC_020932	TAGC	2	8	1021485	1021492	25 %	25 %	25 %	25 %	478454024
22503	NC_020932	GAG	2	6	1021558	1021563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454024
22504	NC_020932	GTT	2	6	1021565	1021570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454024
22505	NC_020932	GGC	2	6	1021581	1021586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478454024
22506	NC_020932	CAG	2	6	1021604	1021609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454024
22507	NC_020932	AG	3	6	1021616	1021621	50 %	0 %	50 %	0 %	478454024
22508	NC_020932	T	6	6	1021651	1021656	0 %	100 %	0 %	0 %	478454024
22509	NC_020932	TCT	2	6	1021658	1021663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454024
22510	NC_020932	GAT	2	6	1021672	1021677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454024
22511	NC_020932	G	6	6	1021706	1021711	0 %	0 %	100 %	0 %	478454024
22512	NC_020932	AAT	2	6	1021771	1021776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454024
22513	NC_020932	GAT	2	6	1021807	1021812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454024
22514	NC_020932	CGT	2	6	1021814	1021819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454024
22515	NC_020932	GAA	2	6	1021911	1021916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454024
22516	NC_020932	GAG	3	9	1021917	1021925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454024
22517	NC_020932	AGG	2	6	1022014	1022019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454024
22518	NC_020932	TAG	2	6	1022061	1022066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454024
22519	NC_020932	GT	3	6	1022071	1022076	0 %	50 %	50 %	0 %	478454024
22520	NC_020932	GCA	2	6	1022080	1022085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454024
22521	NC_020932	AATC	2	8	1022128	1022135	50 %	25 %	0 %	25 %	478454024
22522	NC_020932	AAC	3	9	1022143	1022151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454024
22523	NC_020932	AAG	2	6	1022152	1022157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454024
22524	NC_020932	TTC	2	6	1022206	1022211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454024
22525	NC_020932	CGA	2	6	1022230	1022235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454024
22526	NC_020932	GAG	2	6	1022241	1022246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454024
22527	NC_020932	AGTTG	2	10	1022266	1022275	20 %	40 %	40 %	0 %	478454024
22528	NC_020932	TTAA	2	8	1022302	1022309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22529	NC_020932	AAAG	2	8	1022316	1022323	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22530	NC_020932	ATT	2	6	1022325	1022330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22531	NC_020932	T	6	6	1022346	1022351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22532	NC_020932	ACCAA	2	10	1022622	1022631	60 %	0 %	0 %	40 %	478454025
22533	NC_020932	AATA	2	8	1022846	1022853	75 %	25 %	0 %	0 %	478454025
22534	NC_020932	A	8	8	1022919	1022926	100 %	0 %	0 %	0 %	478454025
22535	NC_020932	CTT	2	6	1023053	1023058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454025
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22537	NC_020932	GTT	2	6	1023108	1023113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454025
22538	NC_020932	CTGA	2	8	1023147	1023154	25 %	25 %	25 %	25 %	478454025
22539	NC_020932	ATC	2	6	1023187	1023192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454025
22540	NC_020932	GAT	2	6	1023230	1023235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454025
22541	NC_020932	CAT	2	6	1023258	1023263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454025
22542	NC_020932	TCC	3	9	1023270	1023278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454025
22543	NC_020932	GAT	2	6	1023296	1023301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454025
22544	NC_020932	T	6	6	1023325	1023330	0 %	100 %	0 %	0 %	478454025
22545	NC_020932	AGC	2	6	1023346	1023351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454025
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22548	NC_020932	T	6	6	1023459	1023464	0 %	100 %	0 %	0 %	478454025
22549	NC_020932	TTG	2	6	1023476	1023481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454025
22550	NC_020932	CCAT	2	8	1023540	1023547	25 %	25 %	0 %	50 %	478454025
22551	NC_020932	ATC	2	6	1023579	1023584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454025
22552	NC_020932	ATAG	2	8	1023616	1023623	50 %	25 %	25 %	0 %	478454025
22553	NC_020932	TGA	2	6	1023633	1023638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454025
22554	NC_020932	TCA	2	6	1023685	1023690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454025
22555	NC_020932	TGAG	2	8	1023692	1023699	25 %	25 %	50 %	0 %	478454025
22556	NC_020932	CTG	2	6	1023737	1023742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454025
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22559	NC_020932	ACA	2	6	1023916	1023921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454025
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22561	NC_020932	TTTG	2	8	1024012	1024019	0 %	75 %	25 %	0 %	478454025
22562	NC_020932	TGA	2	6	1024030	1024035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454025
22563	NC_020932	TAC	2	6	1024068	1024073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454025
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22570	NC_020932	TTA	2	6	1024357	1024362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454025
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22573	NC_020932	A	6	6	1024461	1024466	100 %	0 %	0 %	0 %	478454025
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22591	NC_020932	TAT	2	6	1024967	1024972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454025
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22600	NC_020932	A	8	8	1025341	1025348	100 %	0 %	0 %	0 %	478454025
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22603	NC_020932	GA	3	6	1025455	1025460	50 %	0 %	50 %	0 %	478454026
22604	NC_020932	GGGT	2	8	1025581	1025588	0 %	25 %	75 %	0 %	478454026
22605	NC_020932	AGA	2	6	1025633	1025638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454026
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22607	NC_020932	CTAG	2	8	1025703	1025710	25 %	25 %	25 %	25 %	478454026
22608	NC_020932	GA	3	6	1025746	1025751	50 %	0 %	50 %	0 %	478454026
22609	NC_020932	ATT	2	6	1025778	1025783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454026
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.