MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020932	CTG	2	6	69411	69416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453197
1502	NC_020932	ATG	2	6	69419	69424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453197
1503	NC_020932	AAAAG	2	10	69451	69460	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_020932	A	6	6	69552	69557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_020932	TA	3	6	69587	69592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_020932	TTC	2	6	69627	69632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453198
1507	NC_020932	CTT	3	9	69636	69644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453198
1508	NC_020932	AT	3	6	69649	69654	50 %	50 %	0 %	0 %	478453198
1509	NC_020932	TTCG	2	8	69669	69676	0 %	50 %	25 %	25 %	478453198
1510	NC_020932	TGT	2	6	69694	69699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453198
1511	NC_020932	TGAT	2	8	69786	69793	25 %	50 %	25 %	0 %	478453198
1512	NC_020932	T	6	6	69834	69839	0 %	100 %	0 %	0 %	478453198
1513	NC_020932	TCT	2	6	69950	69955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453198
1514	NC_020932	GGAGC	2	10	70073	70082	20 %	0 %	60 %	20 %	478453198
1515	NC_020932	TGC	2	6	70156	70161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453198
1516	NC_020932	A	7	7	70193	70199	100 %	0 %	0 %	0 %	478453198
1517	NC_020932	CT	3	6	70201	70206	0 %	50 %	0 %	50 %	478453198
1518	NC_020932	AGA	2	6	70210	70215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453198
1519	NC_020932	ATT	2	6	70221	70226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453198
1520	NC_020932	GCGAT	2	10	70263	70272	20 %	20 %	40 %	20 %	478453198
1521	NC_020932	GTT	2	6	70285	70290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453198
1522	NC_020932	GCT	2	6	70307	70312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453198
1523	NC_020932	GCA	3	9	70409	70417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453198
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1525	NC_020932	GCA	2	6	70456	70461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453198
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1527	NC_020932	TAT	2	6	70578	70583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453198
1528	NC_020932	CTT	2	6	70602	70607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453198
1529	NC_020932	GA	3	6	70611	70616	50 %	0 %	50 %	0 %	478453198
1530	NC_020932	CTCTT	2	10	70617	70626	0 %	60 %	0 %	40 %	478453198
1531	NC_020932	AGAA	2	8	70629	70636	75 %	0 %	25 %	0 %	478453198
1532	NC_020932	TGA	2	6	70657	70662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453198
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1534	NC_020932	TCT	2	6	70769	70774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453198
1535	NC_020932	GA	3	6	70810	70815	50 %	0 %	50 %	0 %	478453198
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1537	NC_020932	TGA	2	6	70897	70902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453198
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1541	NC_020932	GT	3	6	71086	71091	0 %	50 %	50 %	0 %	478453198
1542	NC_020932	CT	3	6	71167	71172	0 %	50 %	0 %	50 %	478453198
1543	NC_020932	GA	3	6	71188	71193	50 %	0 %	50 %	0 %	478453198
1544	NC_020932	AGT	2	6	71230	71235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453198
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1546	NC_020932	AAGAA	2	10	71305	71314	80 %	0 %	20 %	0 %	478453198
1547	NC_020932	AGA	2	6	71377	71382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453198
1548	NC_020932	TGA	2	6	71413	71418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453198
1549	NC_020932	TAT	2	6	71424	71429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453198
1550	NC_020932	T	6	6	71513	71518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_020932	T	8	8	71534	71541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_020932	CAT	2	6	71599	71604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453199
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1554	NC_020932	GCTT	2	8	71658	71665	0 %	50 %	25 %	25 %	478453199
1555	NC_020932	A	6	6	71753	71758	100 %	0 %	0 %	0 %	478453199
1556	NC_020932	ATT	2	6	71803	71808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453199
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1559	NC_020932	TTCT	2	8	71996	72003	0 %	75 %	0 %	25 %	478453199
1560	NC_020932	ATG	2	6	72008	72013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453199
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1562	NC_020932	AGA	2	6	72051	72056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453199
1563	NC_020932	GAGC	2	8	72070	72077	25 %	0 %	50 %	25 %	478453199
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1565	NC_020932	A	7	7	72102	72108	100 %	0 %	0 %	0 %	478453199
1566	NC_020932	CTATTT	2	12	72113	72124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478453199
1567	NC_020932	TGA	2	6	72147	72152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453199
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1570	NC_020932	CT	3	6	72323	72328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_020932	CGT	2	6	72363	72368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_020932	T	7	7	72368	72374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_020932	CTTGC	2	10	72394	72403	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1574	NC_020932	GATA	2	8	72418	72425	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1612	NC_020932	GA	3	6	73852	73857	50 %	0 %	50 %	0 %	478453201
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