MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020932	TTG	2	6	22873	22878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453158
502	NC_020932	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453158
503	NC_020932	T	6	6	23019	23024	0 %	100 %	0 %	0 %	478453158
504	NC_020932	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478453158
505	NC_020932	CTG	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453158
506	NC_020932	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453158
507	NC_020932	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453158
508	NC_020932	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453158
509	NC_020932	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478453158
510	NC_020932	AGA	2	6	23482	23487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453158
511	NC_020932	TGA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453158
512	NC_020932	GAA	2	6	23551	23556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453158
513	NC_020932	TTG	2	6	23573	23578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453158
514	NC_020932	AGA	2	6	23633	23638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453158
515	NC_020932	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478453158
516	NC_020932	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478453158
517	NC_020932	TGC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453158
518	NC_020932	ATT	2	6	23772	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453158
519	NC_020932	AAT	2	6	23814	23819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453158
520	NC_020932	TTG	2	6	23877	23882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453158
521	NC_020932	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478453158
522	NC_020932	TGC	2	6	24128	24133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453158
523	NC_020932	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478453158
524	NC_020932	GCA	2	6	24234	24239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453158
525	NC_020932	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478453158
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527	NC_020932	GAG	2	6	24331	24336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453158
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529	NC_020932	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478453158
530	NC_020932	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478453158
531	NC_020932	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478453158
532	NC_020932	GAA	2	6	24653	24658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453158
533	NC_020932	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478453158
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539	NC_020932	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453158
540	NC_020932	A	7	7	25160	25166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_020932	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020932	T	9	9	25188	25196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020932	T	6	6	25220	25225	0 %	100 %	0 %	0 %	478453159
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545	NC_020932	TAA	2	6	25479	25484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453159
546	NC_020932	GGA	3	9	25511	25519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453159
547	NC_020932	GAT	2	6	25556	25561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453159
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549	NC_020932	TAGG	2	8	25878	25885	25 %	25 %	50 %	0 %	478453159
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551	NC_020932	TTA	2	6	25979	25984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453159
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553	NC_020932	TAG	2	6	26040	26045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453159
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555	NC_020932	TAGG	2	8	26116	26123	25 %	25 %	50 %	0 %	478453159
556	NC_020932	AGAGG	2	10	26132	26141	40 %	0 %	60 %	0 %	478453159
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559	NC_020932	T	6	6	26198	26203	0 %	100 %	0 %	0 %	478453159
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561	NC_020932	GA	3	6	26320	26325	50 %	0 %	50 %	0 %	478453159
562	NC_020932	GT	3	6	26340	26345	0 %	50 %	50 %	0 %	478453159
563	NC_020932	TA	3	6	26542	26547	50 %	50 %	0 %	0 %	478453159
564	NC_020932	T	6	6	26551	26556	0 %	100 %	0 %	0 %	478453159
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579	NC_020932	ACT	2	6	27127	27132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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581	NC_020932	T	7	7	27155	27161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_020932	TGA	2	6	27903	27908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453160
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600	NC_020932	A	7	7	27961	27967	100 %	0 %	0 %	0 %	478453160
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612	NC_020932	A	6	6	28410	28415	100 %	0 %	0 %	0 %	478453161
613	NC_020932	T	7	7	28469	28475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020932	TAA	2	6	28480	28485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_020932	TC	3	6	28487	28492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_020932	ATTG	2	8	28538	28545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_020932	AG	3	6	28570	28575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_020932	AGA	2	6	28592	28597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_020932	GAA	2	6	28642	28647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453162
620	NC_020932	ATCCG	2	10	28662	28671	20 %	20 %	20 %	40 %	478453162
621	NC_020932	TTC	2	6	28775	28780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453162
622	NC_020932	TAG	2	6	28823	28828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453162
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624	NC_020932	GAT	3	9	28918	28926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453162
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627	NC_020932	GCA	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453162
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629	NC_020932	AGGGT	2	10	29180	29189	20 %	20 %	60 %	0 %	478453162
630	NC_020932	TTC	2	6	29216	29221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453162
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632	NC_020932	GAA	2	6	29242	29247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453162
633	NC_020932	TGA	2	6	29256	29261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453162
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750	NC_020932	AGA	2	6	35266	35271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453170
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759	NC_020932	AGA	2	6	35903	35908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453171
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