MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020932	AAC	2	6	249320	249325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453357
5502	NC_020932	AATA	2	8	249374	249381	75 %	25 %	0 %	0 %	478453357
5503	NC_020932	GCT	2	6	249384	249389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453357
5504	NC_020932	ACA	2	6	249449	249454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453357
5505	NC_020932	CCA	2	6	249481	249486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453357
5506	NC_020932	CAA	2	6	249529	249534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453357
5507	NC_020932	CCCA	2	8	249654	249661	25 %	0 %	0 %	75 %	478453358
5508	NC_020932	CTT	2	6	249783	249788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453358
5509	NC_020932	AAT	2	6	249862	249867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453358
5510	NC_020932	CTC	2	6	249873	249878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453358
5511	NC_020932	ACT	2	6	249881	249886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453358
5512	NC_020932	GAA	2	6	249899	249904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453358
5513	NC_020932	CTC	2	6	249930	249935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453358
5514	NC_020932	GCAA	2	8	249944	249951	50 %	0 %	25 %	25 %	478453358
5515	NC_020932	AAC	2	6	249961	249966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453358
5516	NC_020932	GTT	2	6	250006	250011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453358
5517	NC_020932	AAC	2	6	250045	250050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_020932	A	6	6	250059	250064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_020932	TAA	2	6	250110	250115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_020932	TTC	2	6	250128	250133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453359
5521	NC_020932	GCT	2	6	250160	250165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453359
5522	NC_020932	T	7	7	250169	250175	0 %	100 %	0 %	0 %	478453359
5523	NC_020932	AGCA	2	8	250206	250213	50 %	0 %	25 %	25 %	478453359
5524	NC_020932	CTT	2	6	250223	250228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453359
5525	NC_020932	TCT	3	9	250234	250242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453359
5526	NC_020932	GATAA	2	10	250262	250271	60 %	20 %	20 %	0 %	478453359
5527	NC_020932	TCG	2	6	250328	250333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453359
5528	NC_020932	CATA	2	8	250349	250356	50 %	25 %	0 %	25 %	478453359
5529	NC_020932	TCC	2	6	250368	250373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453359
5530	NC_020932	TAA	2	6	250401	250406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453359
5531	NC_020932	AG	4	8	250426	250433	50 %	0 %	50 %	0 %	478453359
5532	NC_020932	A	6	6	250445	250450	100 %	0 %	0 %	0 %	478453359
5533	NC_020932	AGA	2	6	250456	250461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453359
5534	NC_020932	CAC	2	6	250463	250468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478453359
5535	NC_020932	CAA	2	6	250509	250514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453359
5536	NC_020932	GTA	2	6	250531	250536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453359
5537	NC_020932	ACA	2	6	250590	250595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453359
5538	NC_020932	A	6	6	250630	250635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_020932	TA	3	6	250677	250682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_020932	CCAA	2	8	250712	250719	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5541	NC_020932	A	7	7	250736	250742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_020932	TAT	2	6	250755	250760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453360
5543	NC_020932	TTCA	2	8	250787	250794	25 %	50 %	0 %	25 %	478453360
5544	NC_020932	AGA	3	9	250823	250831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453360
5545	NC_020932	TGTT	2	8	250861	250868	0 %	75 %	25 %	0 %	478453360
5546	NC_020932	CGA	2	6	250982	250987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453360
5547	NC_020932	GCAAA	2	10	250994	251003	60 %	0 %	20 %	20 %	478453360
5548	NC_020932	AATA	2	8	251080	251087	75 %	25 %	0 %	0 %	478453360
5549	NC_020932	A	6	6	251146	251151	100 %	0 %	0 %	0 %	478453360
5550	NC_020932	A	7	7	251177	251183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_020932	ATA	2	6	251191	251196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_020932	CCT	2	6	251246	251251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_020932	AAAC	2	8	251320	251327	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_020932	AAG	2	6	251444	251449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453361
5555	NC_020932	AGC	2	6	251478	251483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453361
5556	NC_020932	CAAT	2	8	251584	251591	50 %	25 %	0 %	25 %	478453361
5557	NC_020932	TTA	2	6	251656	251661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453361
5558	NC_020932	CTTCT	2	10	251688	251697	0 %	60 %	0 %	40 %	478453361
5559	NC_020932	T	6	6	251731	251736	0 %	100 %	0 %	0 %	478453361
5560	NC_020932	CA	3	6	251790	251795	50 %	0 %	0 %	50 %	478453361
5561	NC_020932	AAT	2	6	251805	251810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453361
5562	NC_020932	ACA	2	6	251881	251886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453361
5563	NC_020932	TTG	2	6	251945	251950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453361
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5565	NC_020932	TAG	2	6	252020	252025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453361
5566	NC_020932	TTTTTA	2	12	252042	252053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_020932	GAG	2	6	252169	252174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_020932	ATT	2	6	252181	252186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453362
5569	NC_020932	T	6	6	252185	252190	0 %	100 %	0 %	0 %	478453362
5570	NC_020932	ACG	2	6	252191	252196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453362
5571	NC_020932	CCTGCA	2	12	252202	252213	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	478453362
5572	NC_020932	CTG	2	6	252259	252264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453362
5573	NC_020932	TTG	2	6	252290	252295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453362
5574	NC_020932	TCTG	2	8	252315	252322	0 %	50 %	25 %	25 %	478453362
5575	NC_020932	TCC	2	6	252345	252350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453362
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5578	NC_020932	TACT	2	8	252420	252427	25 %	50 %	0 %	25 %	478453362
5579	NC_020932	CGA	2	6	252435	252440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453362
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5582	NC_020932	ACG	2	6	252542	252547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453362
5583	NC_020932	AACC	2	8	252586	252593	50 %	0 %	0 %	50 %	478453362
5584	NC_020932	CAG	2	6	252610	252615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453362
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5588	NC_020932	GCT	2	6	252771	252776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453362
5589	NC_020932	ATTT	2	8	252828	252835	25 %	75 %	0 %	0 %	478453362
5590	NC_020932	ATA	2	6	252882	252887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_020932	AAT	2	6	252906	252911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_020932	AG	3	6	252968	252973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5593	NC_020932	A	8	8	252986	252993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_020932	TC	3	6	252994	252999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_020932	TC	3	6	253080	253085	0 %	50 %	0 %	50 %	478453363
5596	NC_020932	A	6	6	253089	253094	100 %	0 %	0 %	0 %	478453363
5597	NC_020932	ATG	2	6	253100	253105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453363
5598	NC_020932	ATCT	2	8	253149	253156	25 %	50 %	0 %	25 %	478453363
5599	NC_020932	T	7	7	253191	253197	0 %	100 %	0 %	0 %	478453363
5600	NC_020932	GCT	2	6	253201	253206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453363
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5602	NC_020932	T	6	6	253232	253237	0 %	100 %	0 %	0 %	478453363
5603	NC_020932	CT	4	8	253300	253307	0 %	50 %	0 %	50 %	478453363
5604	NC_020932	TTA	2	6	253365	253370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453363
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5606	NC_020932	AAC	2	6	253522	253527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453363
5607	NC_020932	TTCG	2	8	253562	253569	0 %	50 %	25 %	25 %	478453363
5608	NC_020932	CTT	2	6	253598	253603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453363
5609	NC_020932	TC	3	6	253653	253658	0 %	50 %	0 %	50 %	478453363
5610	NC_020932	TTC	2	6	253761	253766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453363
5611	NC_020932	CTT	2	6	253769	253774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453363
5612	NC_020932	TC	3	6	253791	253796	0 %	50 %	0 %	50 %	478453363
5613	NC_020932	TCT	2	6	253853	253858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453363
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5615	NC_020932	GTTTT	2	10	253926	253935	0 %	80 %	20 %	0 %	478453363
5616	NC_020932	TTA	2	6	253950	253955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453363
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5624	NC_020932	A	6	6	254249	254254	100 %	0 %	0 %	0 %	478453363
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5753	NC_020932	TCT	2	6	260512	260517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453369
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5758	NC_020932	TAAA	2	8	260728	260735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5759	NC_020932	CTA	2	6	260818	260823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6000	NC_020932	CT	3	6	271936	271941	0 %	50 %	0 %	50 %	478453379

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