MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/Canada2 high quality draft genome sequence

Total Repeats: 22914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_020932	TTC	2	6	204227	204232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453318
4503	NC_020932	ATT	2	6	204257	204262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453318
4504	NC_020932	TTAC	2	8	204296	204303	25 %	50 %	0 %	25 %	478453318
4505	NC_020932	AAC	2	6	204329	204334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453318
4506	NC_020932	A	6	6	204354	204359	100 %	0 %	0 %	0 %	478453318
4507	NC_020932	TTA	2	6	204421	204426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453318
4508	NC_020932	GAA	2	6	204615	204620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453318
4509	NC_020932	AAG	2	6	204718	204723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453318
4510	NC_020932	TGA	2	6	204725	204730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453318
4511	NC_020932	TAT	2	6	204733	204738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453318
4512	NC_020932	GGC	2	6	204757	204762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478453318
4513	NC_020932	TA	3	6	204788	204793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_020932	TTA	2	6	204805	204810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453319
4515	NC_020932	ATG	2	6	204817	204822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453319
4516	NC_020932	AAG	2	6	204850	204855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453319
4517	NC_020932	GGA	2	6	204942	204947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453319
4518	NC_020932	GAA	2	6	204980	204985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453319
4519	NC_020932	GC	3	6	204986	204991	0 %	0 %	50 %	50 %	478453319
4520	NC_020932	GC	3	6	205037	205042	0 %	0 %	50 %	50 %	478453319
4521	NC_020932	AGA	2	6	205112	205117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453319
4522	NC_020932	TC	3	6	205248	205253	0 %	50 %	0 %	50 %	478453319
4523	NC_020932	GAA	2	6	205275	205280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453319
4524	NC_020932	CCG	2	6	205325	205330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478453319
4525	NC_020932	TAGG	2	8	205432	205439	25 %	25 %	50 %	0 %	478453319
4526	NC_020932	CTC	2	6	205468	205473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453319
4527	NC_020932	TCT	2	6	205497	205502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453319
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4529	NC_020932	TGT	2	6	205593	205598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453320
4530	NC_020932	AGA	2	6	205652	205657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453320
4531	NC_020932	TGA	2	6	205687	205692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453320
4532	NC_020932	CTT	2	6	205702	205707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453320
4533	NC_020932	T	6	6	205779	205784	0 %	100 %	0 %	0 %	478453320
4534	NC_020932	GCA	2	6	205849	205854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453320
4535	NC_020932	TCA	2	6	205866	205871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453320
4536	NC_020932	ACTA	2	8	205955	205962	50 %	25 %	0 %	25 %	478453320
4537	NC_020932	TCC	2	6	205971	205976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453320
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4539	NC_020932	TAG	2	6	206011	206016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453320
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4541	NC_020932	A	6	6	206088	206093	100 %	0 %	0 %	0 %	478453320
4542	NC_020932	ATAA	2	8	206129	206136	75 %	25 %	0 %	0 %	478453320
4543	NC_020932	GAG	2	6	206230	206235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453320
4544	NC_020932	TTA	2	6	206262	206267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453320
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4547	NC_020932	CT	3	6	206398	206403	0 %	50 %	0 %	50 %	478453320
4548	NC_020932	AGC	2	6	206420	206425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453320
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4550	NC_020932	TGG	2	6	206575	206580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478453321
4551	NC_020932	GTA	2	6	206633	206638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453321
4552	NC_020932	ATG	2	6	206671	206676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453321
4553	NC_020932	TAG	2	6	206768	206773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453321
4554	NC_020932	TGT	2	6	206842	206847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453321
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4557	NC_020932	T	6	6	206891	206896	0 %	100 %	0 %	0 %	478453321
4558	NC_020932	AGA	2	6	206908	206913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478453321
4559	NC_020932	AG	3	6	206935	206940	50 %	0 %	50 %	0 %	478453321
4560	NC_020932	CT	3	6	206952	206957	0 %	50 %	0 %	50 %	478453321
4561	NC_020932	CTT	2	6	206978	206983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453321
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4565	NC_020932	CAA	2	6	207156	207161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453322
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4567	NC_020932	GAAC	2	8	207341	207348	50 %	0 %	25 %	25 %	478453322
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4602	NC_020932	AAT	2	6	208903	208908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4603	NC_020932	CCT	2	6	208910	208915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478453322
4604	NC_020932	AATT	2	8	208999	209006	50 %	50 %	0 %	0 %	478453322
4605	NC_020932	TTG	2	6	209031	209036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478453322
4606	NC_020932	GAG	2	6	209057	209062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478453322
4607	NC_020932	GCA	2	6	209216	209221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453322
4608	NC_020932	CAA	2	6	209262	209267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453322
4609	NC_020932	AAT	2	6	209482	209487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478453322
4610	NC_020932	GAT	2	6	209548	209553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453322
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4612	NC_020932	TTTA	2	8	209560	209567	25 %	75 %	0 %	0 %	478453322
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4619	NC_020932	TCT	2	6	209884	209889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
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4621	NC_020932	TTC	2	6	209970	209975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
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4623	NC_020932	TTC	2	6	210018	210023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478453323
4624	NC_020932	GCA	2	6	210028	210033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478453323
4625	NC_020932	GCT	2	6	210037	210042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478453323
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4627	NC_020932	T	6	6	210162	210167	0 %	100 %	0 %	0 %	478453323
4628	NC_020932	AACG	2	8	210210	210217	50 %	0 %	25 %	25 %	478453323
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4631	NC_020932	CCAT	2	8	210301	210308	25 %	25 %	0 %	50 %	478453323
4632	NC_020932	GA	3	6	210319	210324	50 %	0 %	50 %	0 %	478453323
4633	NC_020932	T	6	6	210339	210344	0 %	100 %	0 %	0 %	478453323
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4643	NC_020932	CT	3	6	210792	210797	0 %	50 %	0 %	50 %	478453323
4644	NC_020932	CT	3	6	210800	210805	0 %	50 %	0 %	50 %	478453323
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4652	NC_020932	CTTGT	2	10	211130	211139	0 %	60 %	20 %	20 %	478453323
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4874	NC_020932	TTTC	2	8	220379	220386	0 %	75 %	0 %	25 %	478453331
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4883	NC_020932	CAATA	2	10	220778	220787	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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4990	NC_020932	TAT	2	6	225890	225895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478453337
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4995	NC_020932	CAA	2	6	226168	226173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478453337
4996	NC_020932	TTCT	2	8	226237	226244	0 %	75 %	0 %	25 %	478453337
4997	NC_020932	ACT	2	6	226248	226253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478453337
4998	NC_020932	ATG	2	6	226290	226295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478453337
4999	NC_020932	CTTC	2	8	226297	226304	0 %	50 %	0 %	50 %	478453337
5000	NC_020932	TTAT	2	8	226399	226406	25 %	75 %	0 %	0 %	478453337

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