MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020931	GA	3	6	158274	158279	50 %	0 %	50 %	0 %	478454170
3502	NC_020931	A	7	7	158301	158307	100 %	0 %	0 %	0 %	478454170
3503	NC_020931	GCA	2	6	158327	158332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454170
3504	NC_020931	CTTT	2	8	158335	158342	0 %	75 %	0 %	25 %	478454170
3505	NC_020931	CTCCAT	2	12	158359	158370	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478454170
3506	NC_020931	ATT	2	6	158437	158442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454170
3507	NC_020931	GAT	2	6	158463	158468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454170
3508	NC_020931	TTG	2	6	158477	158482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454170
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3511	NC_020931	ATG	2	6	158635	158640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454170
3512	NC_020931	TGT	2	6	158648	158653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454170
3513	NC_020931	TG	3	6	158686	158691	0 %	50 %	50 %	0 %	478454170
3514	NC_020931	T	6	6	158705	158710	0 %	100 %	0 %	0 %	478454170
3515	NC_020931	AGA	2	6	158727	158732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454170
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3517	NC_020931	TTTA	2	8	158773	158780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_020931	CTC	2	6	158825	158830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_020931	CTA	2	6	158834	158839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_020931	AAG	2	6	158876	158881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_020931	TAAT	2	8	158890	158897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_020931	TCCTTG	2	12	158955	158966	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478454171
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3527	NC_020931	AGA	2	6	159222	159227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454171
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3531	NC_020931	T	6	6	159395	159400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_020931	T	6	6	159519	159524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_020931	G	7	7	159525	159531	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_020931	GTT	2	6	159639	159644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_020931	T	7	7	159669	159675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_020931	A	6	6	159703	159708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_020931	TAAT	2	8	159726	159733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3539	NC_020931	AAAG	2	8	159917	159924	75 %	0 %	25 %	0 %	478454172
3540	NC_020931	CAT	2	6	159945	159950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454172
3541	NC_020931	TCAA	2	8	160006	160013	50 %	25 %	0 %	25 %	478454172
3542	NC_020931	GAA	2	6	160231	160236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454172
3543	NC_020931	TC	3	6	160266	160271	0 %	50 %	0 %	50 %	478454172
3544	NC_020931	GT	3	6	160304	160309	0 %	50 %	50 %	0 %	478454172
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3552	NC_020931	TCT	2	6	160504	160509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454172
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3560	NC_020931	GA	3	6	160957	160962	50 %	0 %	50 %	0 %	478454173
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3564	NC_020931	A	8	8	161142	161149	100 %	0 %	0 %	0 %	478454173
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3589	NC_020931	TGT	2	6	162423	162428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_020931	GAG	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3598	NC_020931	ATCT	2	8	162984	162991	25 %	50 %	0 %	25 %	478454175
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3601	NC_020931	TTG	2	6	163089	163094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454175
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3608	NC_020931	TG	3	6	163450	163455	0 %	50 %	50 %	0 %	478454175
3609	NC_020931	AGC	2	6	163468	163473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454175
3610	NC_020931	TAG	2	6	163486	163491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454175
3611	NC_020931	TCGA	2	8	163500	163507	25 %	25 %	25 %	25 %	478454175
3612	NC_020931	AGAGA	2	10	163629	163638	60 %	0 %	40 %	0 %	478454175
3613	NC_020931	ATT	2	6	163652	163657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454175
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3615	NC_020931	TC	3	6	163690	163695	0 %	50 %	0 %	50 %	478454175
3616	NC_020931	TGT	2	6	163922	163927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454175
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3622	NC_020931	AGCAA	2	10	164064	164073	60 %	0 %	20 %	20 %	478454175
3623	NC_020931	TAC	2	6	164090	164095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454175
3624	NC_020931	TGGC	2	8	164140	164147	0 %	25 %	50 %	25 %	478454175
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3999	NC_020931	ACA	2	6	181825	181830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4000	NC_020931	TCTA	2	8	181866	181873	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding

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