MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_020931	CTGA	2	8	113562	113569	25 %	25 %	25 %	25 %	478454126
2503	NC_020931	AAT	2	6	113628	113633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454126
2504	NC_020931	GTC	2	6	113646	113651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454126
2505	NC_020931	AAT	2	6	113723	113728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454126
2506	NC_020931	CT	3	6	113865	113870	0 %	50 %	0 %	50 %	478454126
2507	NC_020931	CTT	2	6	113897	113902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454126
2508	NC_020931	CTG	2	6	113956	113961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454126
2509	NC_020931	CCA	2	6	113977	113982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454126
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2511	NC_020931	CACC	2	8	114026	114033	25 %	0 %	0 %	75 %	478454126
2512	NC_020931	AGT	2	6	114070	114075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454126
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2514	NC_020931	T	6	6	114151	114156	0 %	100 %	0 %	0 %	478454126
2515	NC_020931	TTC	2	6	114168	114173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454126
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2517	NC_020931	GCA	2	6	114226	114231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454126
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2521	NC_020931	GCA	2	6	114451	114456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454126
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2524	NC_020931	CTC	2	6	114560	114565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_020931	A	7	7	114579	114585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_020931	A	8	8	114588	114595	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_020931	GCTCT	2	10	114622	114631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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2538	NC_020931	AACG	2	8	115155	115162	50 %	0 %	25 %	25 %	478454127
2539	NC_020931	CTG	2	6	115190	115195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454127
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2542	NC_020931	GA	4	8	115266	115273	50 %	0 %	50 %	0 %	478454127
2543	NC_020931	AGAA	2	8	115296	115303	75 %	0 %	25 %	0 %	478454127
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2559	NC_020931	ACC	2	6	115938	115943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454127
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2568	NC_020931	TATCG	2	10	116328	116337	20 %	40 %	20 %	20 %	478454127
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2574	NC_020931	A	7	7	116493	116499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_020931	TTTTAG	2	12	116521	116532	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2617	NC_020931	TAA	2	6	118576	118581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2619	NC_020931	T	6	6	118673	118678	0 %	100 %	0 %	0 %	478454131
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2625	NC_020931	GA	3	6	118959	118964	50 %	0 %	50 %	0 %	478454131
2626	NC_020931	TTA	2	6	118980	118985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454131
2627	NC_020931	TCC	2	6	118994	118999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454131
2628	NC_020931	A	8	8	119035	119042	100 %	0 %	0 %	0 %	478454131
2629	NC_020931	AAAGA	2	10	119091	119100	80 %	0 %	20 %	0 %	478454131
2630	NC_020931	AAT	2	6	119101	119106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454131
2631	NC_020931	AG	4	8	119125	119132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_020931	CTT	2	6	119133	119138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2633	NC_020931	TTA	2	6	119155	119160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454132
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2645	NC_020931	GTT	2	6	119809	119814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454132
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2658	NC_020931	GCTA	2	8	120239	120246	25 %	25 %	25 %	25 %	478454133
2659	NC_020931	CGGC	2	8	120288	120295	0 %	0 %	50 %	50 %	478454133
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2663	NC_020931	AG	3	6	120396	120401	50 %	0 %	50 %	0 %	478454133
2664	NC_020931	GA	4	8	120439	120446	50 %	0 %	50 %	0 %	478454133
2665	NC_020931	GGC	2	6	120479	120484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478454133
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2671	NC_020931	GA	3	6	120947	120952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2672	NC_020931	TAT	2	6	120971	120976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2673	NC_020931	ATA	2	6	120992	120997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2674	NC_020931	CTGG	2	8	121015	121022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2675	NC_020931	AAT	2	6	121114	121119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2677	NC_020931	TAAAAA	2	12	121193	121204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2715	NC_020931	GCTTC	2	10	123155	123164	0 %	40 %	20 %	40 %	478454134
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2718	NC_020931	TA	3	6	123255	123260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2719	NC_020931	T	6	6	123301	123306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2720	NC_020931	ACT	2	6	123356	123361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2721	NC_020931	AAGGGT	2	12	123427	123438	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	478454135
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2724	NC_020931	AGCT	2	8	123502	123509	25 %	25 %	25 %	25 %	478454135
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2729	NC_020931	TAA	2	6	123856	123861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454135
2730	NC_020931	TGA	2	6	123945	123950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454135
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2732	NC_020931	GAT	2	6	124037	124042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454135
2733	NC_020931	T	7	7	124144	124150	0 %	100 %	0 %	0 %	478454135
2734	NC_020931	AGA	2	6	124181	124186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454135
2735	NC_020931	GT	3	6	124245	124250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2736	NC_020931	T	6	6	124289	124294	0 %	100 %	0 %	0 %	478454136
2737	NC_020931	GA	3	6	124367	124372	50 %	0 %	50 %	0 %	478454136
2738	NC_020931	GGGTTT	2	12	124390	124401	0 %	50 %	50 %	0 %	478454136
2739	NC_020931	CAA	2	6	124416	124421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454136
2740	NC_020931	GTG	2	6	124434	124439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454136
2741	NC_020931	T	6	6	124448	124453	0 %	100 %	0 %	0 %	478454136
2742	NC_020931	TGGA	2	8	124458	124465	25 %	25 %	50 %	0 %	478454136
2743	NC_020931	GCAA	2	8	124493	124500	50 %	0 %	25 %	25 %	478454136
2744	NC_020931	TTA	2	6	124538	124543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454136
2745	NC_020931	TTA	2	6	124579	124584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454136
2746	NC_020931	GGA	2	6	124596	124601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454136
2747	NC_020931	CTT	2	6	124623	124628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454136
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2749	NC_020931	A	7	7	124690	124696	100 %	0 %	0 %	0 %	478454136
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2873	NC_020931	GAA	2	6	129944	129949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454142
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2877	NC_020931	CAT	2	6	130163	130168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454142
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2885	NC_020931	T	6	6	130647	130652	0 %	100 %	0 %	0 %	478454142
2886	NC_020931	GAGG	2	8	130712	130719	25 %	0 %	75 %	0 %	478454142
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2997	NC_020931	CT	3	6	135441	135446	0 %	50 %	0 %	50 %	478454144
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