MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020931	GATT	2	8	631170	631177	25 %	50 %	25 %	0 %	478454597
14002	NC_020931	TCT	2	6	631188	631193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454597
14003	NC_020931	GCA	2	6	631241	631246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454597
14004	NC_020931	CTT	2	6	631257	631262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454597
14005	NC_020931	CTC	2	6	631281	631286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454597
14006	NC_020931	A	6	6	631311	631316	100 %	0 %	0 %	0 %	478454597
14007	NC_020931	CCT	2	6	631376	631381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454597
14008	NC_020931	AAG	2	6	631383	631388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454597
14009	NC_020931	TCC	2	6	631394	631399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454597
14010	NC_020931	CCT	2	6	631491	631496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454597
14011	NC_020931	ATT	2	6	631508	631513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454597
14012	NC_020931	TTC	2	6	631521	631526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454597
14013	NC_020931	ACA	2	6	631546	631551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454597
14014	NC_020931	CCT	2	6	631556	631561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454597
14015	NC_020931	A	6	6	631643	631648	100 %	0 %	0 %	0 %	478454597
14016	NC_020931	TCGAG	2	10	631653	631662	20 %	20 %	40 %	20 %	478454597
14017	NC_020931	T	6	6	631680	631685	0 %	100 %	0 %	0 %	478454597
14018	NC_020931	TTG	2	6	631710	631715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454597
14019	NC_020931	TCCT	2	8	631745	631752	0 %	50 %	0 %	50 %	478454597
14020	NC_020931	CAA	2	6	631829	631834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454597
14021	NC_020931	ATC	2	6	631856	631861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454597
14022	NC_020931	TCA	2	6	631872	631877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454597
14023	NC_020931	CTTT	2	8	631926	631933	0 %	75 %	0 %	25 %	478454597
14024	NC_020931	ATG	3	9	631976	631984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454597
14025	NC_020931	TC	4	8	632001	632008	0 %	50 %	0 %	50 %	478454597
14026	NC_020931	CTA	2	6	632054	632059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454597
14027	NC_020931	TGA	2	6	632067	632072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454597
14028	NC_020931	CAA	2	6	632111	632116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454598
14029	NC_020931	TTTG	2	8	632130	632137	0 %	75 %	25 %	0 %	478454598
14030	NC_020931	TTA	2	6	632158	632163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454598
14031	NC_020931	CTC	2	6	632180	632185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454598
14032	NC_020931	TAT	2	6	632187	632192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454598
14033	NC_020931	TGG	2	6	632216	632221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454598
14034	NC_020931	AGC	2	6	632232	632237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454598
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14036	NC_020931	TGC	2	6	632343	632348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454598
14037	NC_020931	GGCTC	2	10	632417	632426	0 %	20 %	40 %	40 %	478454599
14038	NC_020931	TA	3	6	632440	632445	50 %	50 %	0 %	0 %	478454599
14039	NC_020931	AGCC	2	8	632453	632460	25 %	0 %	25 %	50 %	478454599
14040	NC_020931	TCTT	2	8	632477	632484	0 %	75 %	0 %	25 %	478454599
14041	NC_020931	ATC	2	6	632518	632523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454599
14042	NC_020931	CT	3	6	632575	632580	0 %	50 %	0 %	50 %	478454599
14043	NC_020931	TGC	2	6	632591	632596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454599
14044	NC_020931	CTT	2	6	632659	632664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454599
14045	NC_020931	TGC	2	6	632721	632726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454599
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14047	NC_020931	CT	3	6	632787	632792	0 %	50 %	0 %	50 %	478454599
14048	NC_020931	ATT	2	6	632834	632839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454599
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14051	NC_020931	ATG	2	6	632944	632949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454599
14052	NC_020931	CAG	2	6	633029	633034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454599
14053	NC_020931	ATC	2	6	633070	633075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454599
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14055	NC_020931	CTAC	2	8	633105	633112	25 %	25 %	0 %	50 %	478454599
14056	NC_020931	TGG	2	6	633160	633165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478454599
14057	NC_020931	ATT	2	6	633185	633190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454599
14058	NC_020931	CTA	2	6	633218	633223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454599
14059	NC_020931	TCC	2	6	633240	633245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454599
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14061	NC_020931	CTCC	2	8	633274	633281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14062	NC_020931	A	6	6	633282	633287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_020931	TTC	2	6	633295	633300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14064	NC_020931	TTG	2	6	633321	633326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_020931	TGC	2	6	633365	633370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454600
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14070	NC_020931	TG	3	6	633688	633693	0 %	50 %	50 %	0 %	478454600
14071	NC_020931	GAG	2	6	633749	633754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454600
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14073	NC_020931	T	6	6	633794	633799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_020931	A	6	6	633860	633865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_020931	TCT	2	6	633882	633887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454601
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14089	NC_020931	GAA	2	6	634504	634509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454601
14090	NC_020931	ATT	2	6	634566	634571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454601
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14094	NC_020931	TCGTT	2	10	634686	634695	0 %	60 %	20 %	20 %	478454601
14095	NC_020931	TTG	2	6	634728	634733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454601
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14101	NC_020931	CCTT	2	8	634921	634928	0 %	50 %	0 %	50 %	478454602
14102	NC_020931	TCCAT	2	10	634987	634996	20 %	40 %	0 %	40 %	478454602
14103	NC_020931	AGAA	2	8	634997	635004	75 %	0 %	25 %	0 %	478454602
14104	NC_020931	CCT	2	6	635038	635043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454602
14105	NC_020931	CT	3	6	635042	635047	0 %	50 %	0 %	50 %	478454602
14106	NC_020931	CTA	2	6	635056	635061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454602
14107	NC_020931	GAAA	2	8	635150	635157	75 %	0 %	25 %	0 %	478454602
14108	NC_020931	A	6	6	635155	635160	100 %	0 %	0 %	0 %	478454602
14109	NC_020931	CTCTTT	2	12	635258	635269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454602
14110	NC_020931	ATATCC	2	12	635275	635286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454602
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14112	NC_020931	T	6	6	635373	635378	0 %	100 %	0 %	0 %	478454602
14113	NC_020931	TAAACA	2	12	635386	635397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478454602
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14117	NC_020931	TCC	2	6	635624	635629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454603
14118	NC_020931	A	7	7	635635	635641	100 %	0 %	0 %	0 %	478454603
14119	NC_020931	ATGC	2	8	635651	635658	25 %	25 %	25 %	25 %	478454603
14120	NC_020931	ACGA	2	8	635691	635698	50 %	0 %	25 %	25 %	478454603
14121	NC_020931	GA	4	8	635750	635757	50 %	0 %	50 %	0 %	478454603
14122	NC_020931	AAG	2	6	635758	635763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454603
14123	NC_020931	CTA	2	6	635769	635774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454603
14124	NC_020931	A	6	6	635777	635782	100 %	0 %	0 %	0 %	478454603
14125	NC_020931	ACA	2	6	635853	635858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454604
14126	NC_020931	TCAT	2	8	635874	635881	25 %	50 %	0 %	25 %	478454604
14127	NC_020931	AAG	2	6	635888	635893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454604
14128	NC_020931	TCT	2	6	635895	635900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454604
14129	NC_020931	AAG	2	6	635915	635920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454604
14130	NC_020931	TTTC	2	8	635921	635928	0 %	75 %	0 %	25 %	478454604
14131	NC_020931	CAC	2	6	635937	635942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454604
14132	NC_020931	TCT	2	6	635949	635954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454604
14133	NC_020931	CAT	2	6	636014	636019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454604
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14136	NC_020931	CAT	2	6	636140	636145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454604
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14138	NC_020931	TTC	2	6	636183	636188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454604
14139	NC_020931	CCT	2	6	636197	636202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14140	NC_020931	GAA	2	6	636236	636241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454605
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14151	NC_020931	TCC	2	6	636726	636731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454605
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14153	NC_020931	AGAA	2	8	636850	636857	75 %	0 %	25 %	0 %	478454605
14154	NC_020931	CAC	2	6	636858	636863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454605
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14161	NC_020931	TC	4	8	637239	637246	0 %	50 %	0 %	50 %	478454605
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14165	NC_020931	CGT	2	6	637333	637338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454605
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14167	NC_020931	CCT	2	6	637387	637392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14168	NC_020931	CGGAA	2	10	637603	637612	40 %	0 %	40 %	20 %	478454606
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14171	NC_020931	TTG	2	6	637765	637770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454606
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14177	NC_020931	GTC	2	6	638100	638105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454606
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14182	NC_020931	TCC	2	6	638303	638308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454606
14183	NC_020931	TAA	2	6	638386	638391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454606
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14223	NC_020931	AGCG	2	8	640171	640178	25 %	0 %	50 %	25 %	478454607
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14230	NC_020931	AGA	2	6	640491	640496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454607
14231	NC_020931	CTT	2	6	640676	640681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454607
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14233	NC_020931	C	9	9	640829	640837	0 %	0 %	0 %	100 %	478454607
14234	NC_020931	GTT	2	6	640883	640888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454607
14235	NC_020931	TC	3	6	640937	640942	0 %	50 %	0 %	50 %	478454607
14236	NC_020931	GA	3	6	640953	640958	50 %	0 %	50 %	0 %	478454607
14237	NC_020931	CTT	2	6	640964	640969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454607
14238	NC_020931	CAT	2	6	640988	640993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454607
14239	NC_020931	CAAA	2	8	641121	641128	75 %	0 %	0 %	25 %	478454607
14240	NC_020931	TCC	2	6	641172	641177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454608
14241	NC_020931	CAA	2	6	641270	641275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454608
14242	NC_020931	TCT	2	6	641383	641388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454608
14243	NC_020931	ATC	2	6	641442	641447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454608
14244	NC_020931	AGAA	2	8	641451	641458	75 %	0 %	25 %	0 %	478454608
14245	NC_020931	CTG	2	6	641474	641479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454608
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14248	NC_020931	CTG	2	6	641580	641585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454608
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14271	NC_020931	A	8	8	642442	642449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14273	NC_020931	A	7	7	642492	642498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14274	NC_020931	A	7	7	642500	642506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14335	NC_020931	AGG	2	6	645420	645425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14340	NC_020931	TAG	2	6	645574	645579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14364	NC_020931	A	6	6	646336	646341	100 %	0 %	0 %	0 %	478454612
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14489	NC_020931	ATT	2	6	652516	652521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454616
14490	NC_020931	GT	3	6	652727	652732	0 %	50 %	50 %	0 %	478454616
14491	NC_020931	TC	3	6	652757	652762	0 %	50 %	0 %	50 %	478454616
14492	NC_020931	TCCT	2	8	652800	652807	0 %	50 %	0 %	50 %	478454616
14493	NC_020931	ATT	2	6	652850	652855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14494	NC_020931	CA	3	6	652862	652867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14495	NC_020931	A	6	6	652940	652945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14496	NC_020931	CAGG	2	8	652964	652971	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14497	NC_020931	TTC	2	6	653012	653017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14498	NC_020931	AAT	2	6	653105	653110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_020931	TCC	2	6	653229	653234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14500	NC_020931	GGC	2	6	653294	653299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478454617

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