MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2b/UCH-2 complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_020931	GCT	2	6	272050	272055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454271
6003	NC_020931	AAC	2	6	272066	272071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478454271
6004	NC_020931	CT	3	6	272080	272085	0 %	50 %	0 %	50 %	478454271
6005	NC_020931	ACGA	2	8	272103	272110	50 %	0 %	25 %	25 %	478454271
6006	NC_020931	CTC	2	6	272134	272139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454271
6007	NC_020931	A	7	7	272149	272155	100 %	0 %	0 %	0 %	478454271
6008	NC_020931	TTGTC	2	10	272163	272172	0 %	60 %	20 %	20 %	478454271
6009	NC_020931	GAA	2	6	272176	272181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454271
6010	NC_020931	ATT	2	6	272186	272191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454271
6011	NC_020931	ACG	2	6	272218	272223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454271
6012	NC_020931	ATC	2	6	272252	272257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454271
6013	NC_020931	CTC	2	6	272258	272263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454271
6014	NC_020931	ATA	2	6	272297	272302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454271
6015	NC_020931	A	6	6	272357	272362	100 %	0 %	0 %	0 %	478454271
6016	NC_020931	A	6	6	272447	272452	100 %	0 %	0 %	0 %	478454272
6017	NC_020931	TGGT	2	8	272536	272543	0 %	50 %	50 %	0 %	478454272
6018	NC_020931	AAG	2	6	272562	272567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454272
6019	NC_020931	GAA	2	6	272654	272659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454272
6020	NC_020931	TGT	2	6	272662	272667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478454272
6021	NC_020931	ATG	2	6	272747	272752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454272
6022	NC_020931	TCCG	2	8	272757	272764	0 %	25 %	25 %	50 %	478454272
6023	NC_020931	ACC	2	6	272767	272772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478454272
6024	NC_020931	CTC	2	6	272781	272786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454272
6025	NC_020931	A	7	7	272833	272839	100 %	0 %	0 %	0 %	478454272
6026	NC_020931	CT	3	6	272864	272869	0 %	50 %	0 %	50 %	478454272
6027	NC_020931	GGA	2	6	272891	272896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454272
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6029	NC_020931	CTC	2	6	272925	272930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454272
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6031	NC_020931	GAA	2	6	272993	272998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454272
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6035	NC_020931	CT	3	6	273140	273145	0 %	50 %	0 %	50 %	478454272
6036	NC_020931	ATTGT	2	10	273153	273162	20 %	60 %	20 %	0 %	478454272
6037	NC_020931	AATT	2	8	273199	273206	50 %	50 %	0 %	0 %	478454272
6038	NC_020931	ATT	2	6	273233	273238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478454272
6039	NC_020931	A	6	6	273319	273324	100 %	0 %	0 %	0 %	478454272
6040	NC_020931	CAG	2	6	273374	273379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478454272
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6042	NC_020931	AGG	2	6	273403	273408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478454272
6043	NC_020931	TTCT	2	8	273409	273416	0 %	75 %	0 %	25 %	478454272
6044	NC_020931	TCC	2	6	273469	273474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454272
6045	NC_020931	GCT	2	6	273479	273484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454272
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6047	NC_020931	AGCT	2	8	273534	273541	25 %	25 %	25 %	25 %	478454272
6048	NC_020931	TGAT	2	8	273585	273592	25 %	50 %	25 %	0 %	478454272
6049	NC_020931	CTC	2	6	273632	273637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478454272
6050	NC_020931	AAG	2	6	273667	273672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454272
6051	NC_020931	CTT	2	6	273684	273689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_020931	TCT	2	6	273690	273695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454273
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6054	NC_020931	C	6	6	273772	273777	0 %	0 %	0 %	100 %	478454273
6055	NC_020931	CTT	2	6	273793	273798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454273
6056	NC_020931	TA	3	6	273850	273855	50 %	50 %	0 %	0 %	478454273
6057	NC_020931	TCT	2	6	273935	273940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454273
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6063	NC_020931	GCT	2	6	274310	274315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478454273
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6097	NC_020931	GTTT	2	8	276159	276166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_020931	ATATTA	2	12	276182	276193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_020931	AAAG	2	8	276194	276201	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6111	NC_020931	TGCC	2	8	276682	276689	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_020931	TCT	2	6	276702	276707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454275
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6114	NC_020931	CT	3	6	276779	276784	0 %	50 %	0 %	50 %	478454275
6115	NC_020931	ATC	2	6	276785	276790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478454275
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6118	NC_020931	GA	3	6	276847	276852	50 %	0 %	50 %	0 %	478454275
6119	NC_020931	AAAG	2	8	276879	276886	75 %	0 %	25 %	0 %	478454275
6120	NC_020931	ATA	2	6	276977	276982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454275
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6122	NC_020931	TAA	2	6	277052	277057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478454275
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6124	NC_020931	GAT	2	6	277158	277163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478454275
6125	NC_020931	TTC	2	6	277222	277227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478454275
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6127	NC_020931	TAAT	2	8	277300	277307	50 %	50 %	0 %	0 %	478454275
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6231	NC_020931	CTCCTA	2	12	282188	282199	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478454278
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6244	NC_020931	T	7	7	282761	282767	0 %	100 %	0 %	0 %	478454279
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6496	NC_020931	T	6	6	294040	294045	0 %	100 %	0 %	0 %	478454290
6497	NC_020931	ATCT	2	8	294052	294059	25 %	50 %	0 %	25 %	478454290
6498	NC_020931	GAA	3	9	294087	294095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478454290
6499	NC_020931	T	7	7	294114	294120	0 %	100 %	0 %	0 %	478454290
6500	NC_020931	T	6	6	294139	294144	0 %	100 %	0 %	0 %	478454290

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