MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 2852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020930	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	478446833
2	NC_020930	GGGA	2	8	394	401	25 %	0 %	75 %	0 %	478446833
3	NC_020930	AGTG	2	8	544	551	25 %	25 %	50 %	0 %	478446833
4	NC_020930	TGGC	2	8	578	585	0 %	25 %	50 %	25 %	478446833
5	NC_020930	AATG	2	8	1063	1070	50 %	25 %	25 %	0 %	478446833
6	NC_020930	CTAT	2	8	1397	1404	25 %	50 %	0 %	25 %	478446833
7	NC_020930	AAGG	2	8	1906	1913	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020930	AGTA	2	8	2086	2093	50 %	25 %	25 %	0 %	478446834
9	NC_020930	ATGA	2	8	2490	2497	50 %	25 %	25 %	0 %	478446835
10	NC_020930	GATA	2	8	2528	2535	50 %	25 %	25 %	0 %	478446835
11	NC_020930	CATG	2	8	3706	3713	25 %	25 %	25 %	25 %	478446836
12	NC_020930	TTCC	2	8	4011	4018	0 %	50 %	0 %	50 %	478446836
13	NC_020930	TTTA	2	8	4409	4416	25 %	75 %	0 %	0 %	478446837
14	NC_020930	ATCC	2	8	4709	4716	25 %	25 %	0 %	50 %	478446837
15	NC_020930	GACG	2	8	5456	5463	25 %	0 %	50 %	25 %	478446837
16	NC_020930	TTGG	2	8	5559	5566	0 %	50 %	50 %	0 %	478446837
17	NC_020930	TGGA	2	8	5920	5927	25 %	25 %	50 %	0 %	478446838
18	NC_020930	CTTT	2	8	6297	6304	0 %	75 %	0 %	25 %	478446838
19	NC_020930	GGGA	2	8	6812	6819	25 %	0 %	75 %	0 %	478446838
20	NC_020930	GGAG	2	8	6903	6910	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020930	GGTG	2	8	7115	7122	0 %	25 %	75 %	0 %	478446839
22	NC_020930	AAAT	2	8	7181	7188	75 %	25 %	0 %	0 %	478446839
23	NC_020930	TATG	2	8	7552	7559	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020930	ATTT	2	8	7693	7700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020930	TTTG	2	8	7785	7792	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020930	AAGC	2	8	8419	8426	50 %	0 %	25 %	25 %	478446840
27	NC_020930	ATTG	2	8	8817	8824	25 %	50 %	25 %	0 %	478446841
28	NC_020930	AGCG	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	478446841
29	NC_020930	AAAG	2	8	9305	9312	75 %	0 %	25 %	0 %	478446841
30	NC_020930	CTTT	2	8	9645	9652	0 %	75 %	0 %	25 %	478446841
31	NC_020930	TATT	2	8	9908	9915	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020930	TTCG	2	8	10019	10026	0 %	50 %	25 %	25 %	478446842
33	NC_020930	AATT	2	8	10124	10131	50 %	50 %	0 %	0 %	478446842
34	NC_020930	ATGG	2	8	10183	10190	25 %	25 %	50 %	0 %	478446842
35	NC_020930	CTTT	2	8	10808	10815	0 %	75 %	0 %	25 %	478446843
36	NC_020930	GCAA	2	8	11025	11032	50 %	0 %	25 %	25 %	478446843
37	NC_020930	AGCC	2	8	11255	11262	25 %	0 %	25 %	50 %	478446843
38	NC_020930	GAAA	2	8	11398	11405	75 %	0 %	25 %	0 %	478446843
39	NC_020930	AGAA	2	8	11802	11809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020930	AATG	2	8	12141	12148	50 %	25 %	25 %	0 %	478446844
41	NC_020930	GTTT	2	8	13173	13180	0 %	75 %	25 %	0 %	478446845
42	NC_020930	ATGC	2	8	13603	13610	25 %	25 %	25 %	25 %	478446845
43	NC_020930	AAGG	2	8	14038	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020930	TTGT	2	8	14639	14646	0 %	75 %	25 %	0 %	478446846
45	NC_020930	TTCT	2	8	14810	14817	0 %	75 %	0 %	25 %	478446846
46	NC_020930	ATTT	2	8	15016	15023	25 %	75 %	0 %	0 %	478446846
47	NC_020930	TTTC	2	8	15678	15685	0 %	75 %	0 %	25 %	478446847
48	NC_020930	AAAT	2	8	16160	16167	75 %	25 %	0 %	0 %	478446847
49	NC_020930	CAAA	2	8	16672	16679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020930	CTAT	2	8	16859	16866	25 %	50 %	0 %	25 %	478446848
51	NC_020930	GTAA	2	8	17002	17009	50 %	25 %	25 %	0 %	478446848
52	NC_020930	CTAA	2	8	17195	17202	50 %	25 %	0 %	25 %	478446848
53	NC_020930	AGAA	2	8	17458	17465	75 %	0 %	25 %	0 %	478446848
54	NC_020930	ATTT	2	8	17604	17611	25 %	75 %	0 %	0 %	478446848
55	NC_020930	TGCG	2	8	19126	19133	0 %	25 %	50 %	25 %	478446850
56	NC_020930	GAAG	2	8	20110	20117	50 %	0 %	50 %	0 %	478446850
57	NC_020930	GCCA	2	8	21620	21627	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020930	CGCT	2	8	21868	21875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020930	TTAA	2	8	21889	21896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020930	GTTA	2	8	21926	21933	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020930	GATC	2	8	21981	21988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020930	GATG	2	8	22244	22251	25 %	25 %	50 %	0 %	478446852
63	NC_020930	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478446852
64	NC_020930	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478446852
65	NC_020930	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478446852
66	NC_020930	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478446852
67	NC_020930	TAAC	2	8	24166	24173	50 %	25 %	0 %	25 %	478446852
68	NC_020930	CATT	2	8	24289	24296	25 %	50 %	0 %	25 %	478446852
69	NC_020930	GGTA	2	8	24659	24666	25 %	25 %	50 %	0 %	478446852
70	NC_020930	TTGA	2	8	25653	25660	25 %	50 %	25 %	0 %	478446853
71	NC_020930	TAGG	2	8	25877	25884	25 %	25 %	50 %	0 %	478446853
72	NC_020930	TTCC	2	8	26001	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	478446853
73	NC_020930	TAGG	2	8	26115	26122	25 %	25 %	50 %	0 %	478446853
74	NC_020930	GCTT	2	8	26887	26894	0 %	50 %	25 %	25 %	478446853
75	NC_020930	GGAA	2	8	27470	27477	50 %	0 %	50 %	0 %	478446854
76	NC_020930	TTAA	2	8	27543	27550	50 %	50 %	0 %	0 %	478446854
77	NC_020930	AAAG	2	8	27593	27600	75 %	0 %	25 %	0 %	478446854
78	NC_020930	GGGC	2	8	27873	27880	0 %	0 %	75 %	25 %	478446854
79	NC_020930	GTTT	2	8	28156	28163	0 %	75 %	25 %	0 %	478446855
80	NC_020930	CAGA	2	8	28178	28185	50 %	0 %	25 %	25 %	478446855
81	NC_020930	ATTG	2	8	28537	28544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020930	CTTT	2	8	30150	30157	0 %	75 %	0 %	25 %	478446857
83	NC_020930	TTTG	2	8	30165	30172	0 %	75 %	25 %	0 %	478446857
84	NC_020930	TTGT	2	8	30200	30207	0 %	75 %	25 %	0 %	478446857
85	NC_020930	TGGC	2	8	30363	30370	0 %	25 %	50 %	25 %	478446857
86	NC_020930	AAAG	2	8	30923	30930	75 %	0 %	25 %	0 %	478446858
87	NC_020930	AAAC	2	8	30993	31000	75 %	0 %	0 %	25 %	478446858
88	NC_020930	GATG	2	8	31136	31143	25 %	25 %	50 %	0 %	478446858
89	NC_020930	GATA	2	8	32245	32252	50 %	25 %	25 %	0 %	478446860
90	NC_020930	TGAT	2	8	34740	34747	25 %	50 %	25 %	0 %	478446863
91	NC_020930	AAGA	3	12	34868	34879	75 %	0 %	25 %	0 %	478446863
92	NC_020930	AAGC	2	8	35088	35095	50 %	0 %	25 %	25 %	478446864
93	NC_020930	GTTC	2	8	35121	35128	0 %	50 %	25 %	25 %	478446864
94	NC_020930	GGCA	2	8	35500	35507	25 %	0 %	50 %	25 %	478446865
95	NC_020930	TGCT	2	8	35910	35917	0 %	50 %	25 %	25 %	478446865
96	NC_020930	TTGG	2	8	36142	36149	0 %	50 %	50 %	0 %	478446865
97	NC_020930	AGAT	2	8	36862	36869	50 %	25 %	25 %	0 %	478446865
98	NC_020930	CTTT	2	8	37234	37241	0 %	75 %	0 %	25 %	478446866
99	NC_020930	ATGA	2	8	37724	37731	50 %	25 %	25 %	0 %	478446866
100	NC_020930	TAGG	2	8	37883	37890	25 %	25 %	50 %	0 %	478446866
101	NC_020930	CAAT	2	8	38067	38074	50 %	25 %	0 %	25 %	478446866
102	NC_020930	AATG	2	8	38854	38861	50 %	25 %	25 %	0 %	478446866
103	NC_020930	AGAA	2	8	39691	39698	75 %	0 %	25 %	0 %	478446867
104	NC_020930	AAGA	2	8	39743	39750	75 %	0 %	25 %	0 %	478446867
105	NC_020930	ATCC	2	8	39751	39758	25 %	25 %	0 %	50 %	478446867
106	NC_020930	TAAT	2	8	39962	39969	50 %	50 %	0 %	0 %	478446867
107	NC_020930	GTGC	2	8	42050	42057	0 %	25 %	50 %	25 %	478446869
108	NC_020930	AGAA	2	8	42469	42476	75 %	0 %	25 %	0 %	478446869
109	NC_020930	GGAT	2	8	42621	42628	25 %	25 %	50 %	0 %	478446869
110	NC_020930	AAAC	2	8	43760	43767	75 %	0 %	0 %	25 %	478446871
111	NC_020930	CAAT	2	8	43964	43971	50 %	25 %	0 %	25 %	478446871
112	NC_020930	TGTT	2	8	44344	44351	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020930	AATA	2	8	44582	44589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020930	ATTT	2	8	44720	44727	25 %	75 %	0 %	0 %	478446872
115	NC_020930	GCTC	2	8	45028	45035	0 %	25 %	25 %	50 %	478446872
116	NC_020930	TTCT	2	8	45170	45177	0 %	75 %	0 %	25 %	478446872
117	NC_020930	TTGA	2	8	45770	45777	25 %	50 %	25 %	0 %	478446873
118	NC_020930	TGTT	2	8	45942	45949	0 %	75 %	25 %	0 %	478446873
119	NC_020930	CTAT	2	8	45972	45979	25 %	50 %	0 %	25 %	478446873
120	NC_020930	TGTT	2	8	46001	46008	0 %	75 %	25 %	0 %	478446873
121	NC_020930	CTAT	2	8	46297	46304	25 %	50 %	0 %	25 %	478446873
122	NC_020930	AAGA	2	8	46791	46798	75 %	0 %	25 %	0 %	478446874
123	NC_020930	AAGA	2	8	46848	46855	75 %	0 %	25 %	0 %	478446874
124	NC_020930	AAAG	2	8	46888	46895	75 %	0 %	25 %	0 %	478446874
125	NC_020930	AAGA	2	8	47003	47010	75 %	0 %	25 %	0 %	478446874
126	NC_020930	ACTT	2	8	47264	47271	25 %	50 %	0 %	25 %	478446874
127	NC_020930	ATGG	2	8	47890	47897	25 %	25 %	50 %	0 %	478446874
128	NC_020930	AGGA	2	8	47921	47928	50 %	0 %	50 %	0 %	478446874
129	NC_020930	GAAC	2	8	48468	48475	50 %	0 %	25 %	25 %	478446874
130	NC_020930	AAGT	2	8	48503	48510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020930	AACA	2	8	48715	48722	75 %	0 %	0 %	25 %	478446875
132	NC_020930	CTTT	2	8	48911	48918	0 %	75 %	0 %	25 %	478446875
133	NC_020930	CTTT	2	8	49796	49803	0 %	75 %	0 %	25 %	478446876
134	NC_020930	GTAG	2	8	49814	49821	25 %	25 %	50 %	0 %	478446876
135	NC_020930	GAAG	2	8	51244	51251	50 %	0 %	50 %	0 %	478446877
136	NC_020930	TTCA	2	8	51666	51673	25 %	50 %	0 %	25 %	478446877
137	NC_020930	TCTA	2	8	51883	51890	25 %	50 %	0 %	25 %	478446877
138	NC_020930	TATT	2	8	52769	52776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020930	GGAA	2	8	53000	53007	50 %	0 %	50 %	0 %	478446879
140	NC_020930	TTAA	2	8	53741	53748	50 %	50 %	0 %	0 %	478446879
141	NC_020930	CCTT	2	8	53948	53955	0 %	50 %	0 %	50 %	478446880
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