MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020930	AGAGT	2	10	181458	181467	40 %	20 %	40 %	0 %	478446987
4002	NC_020930	GAA	2	6	181513	181518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446987
4003	NC_020930	AGG	2	6	181535	181540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446987
4004	NC_020930	AAG	3	9	181541	181549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446987
4005	NC_020930	TGA	2	6	181662	181667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_020930	TTCC	2	8	181792	181799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_020930	ACA	2	6	181819	181824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_020930	TCTA	2	8	181860	181867	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4009	NC_020930	GAA	2	6	181939	181944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_020930	ATT	2	6	181975	181980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020930	AATT	2	8	181994	182001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020930	TGT	2	6	182018	182023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020930	T	6	6	182122	182127	0 %	100 %	0 %	0 %	478446988
4014	NC_020930	TTGAA	2	10	182148	182157	40 %	40 %	20 %	0 %	478446988
4015	NC_020930	TTTG	2	8	182162	182169	0 %	75 %	25 %	0 %	478446988
4016	NC_020930	ATC	2	6	182259	182264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446988
4017	NC_020930	TGCA	2	8	182280	182287	25 %	25 %	25 %	25 %	478446988
4018	NC_020930	TGT	2	6	182298	182303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446988
4019	NC_020930	AGT	2	6	182317	182322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446988
4020	NC_020930	CT	3	6	182362	182367	0 %	50 %	0 %	50 %	478446988
4021	NC_020930	T	6	6	182367	182372	0 %	100 %	0 %	0 %	478446988
4022	NC_020930	CTC	2	6	182396	182401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446988
4023	NC_020930	GA	3	6	182441	182446	50 %	0 %	50 %	0 %	478446988
4024	NC_020930	GAT	2	6	182496	182501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446988
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4026	NC_020930	CGA	2	6	182830	182835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446988
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4028	NC_020930	ATT	2	6	182896	182901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446988
4029	NC_020930	GTTT	2	8	182952	182959	0 %	75 %	25 %	0 %	478446988
4030	NC_020930	TGAGT	2	10	182962	182971	20 %	40 %	40 %	0 %	478446988
4031	NC_020930	CTT	2	6	183040	183045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446988
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4033	NC_020930	TG	3	6	183153	183158	0 %	50 %	50 %	0 %	478446988
4034	NC_020930	G	13	13	183160	183172	0 %	0 %	100 %	0 %	478446988
4035	NC_020930	GA	3	6	183203	183208	50 %	0 %	50 %	0 %	478446988
4036	NC_020930	GAA	2	6	183244	183249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446988
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4038	NC_020930	AGAAA	2	10	183330	183339	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_020930	AAGA	2	8	183351	183358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_020930	T	8	8	183375	183382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020930	AGAAAA	2	12	183393	183404	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020930	A	6	6	183401	183406	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020930	TCG	2	6	183441	183446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446989
4044	NC_020930	TGT	2	6	183453	183458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446989
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4046	NC_020930	T	7	7	183478	183484	0 %	100 %	0 %	0 %	478446989
4047	NC_020930	AAG	2	6	183531	183536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446989
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4049	NC_020930	TCT	2	6	183579	183584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446989
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4052	NC_020930	TTGAG	2	10	183712	183721	20 %	40 %	40 %	0 %	478446989
4053	NC_020930	ATAGA	2	10	183734	183743	60 %	20 %	20 %	0 %	478446989
4054	NC_020930	CT	3	6	183787	183792	0 %	50 %	0 %	50 %	478446989
4055	NC_020930	TGA	2	6	183801	183806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446989
4056	NC_020930	GA	4	8	183829	183836	50 %	0 %	50 %	0 %	478446989
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4059	NC_020930	TGA	2	6	183903	183908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446989
4060	NC_020930	TGC	2	6	183939	183944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446989
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4062	NC_020930	TTG	2	6	183968	183973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446989
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4070	NC_020930	TCGC	2	8	184213	184220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_020930	AGA	2	6	184224	184229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_020930	GCA	2	6	184233	184238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_020930	TA	3	6	184268	184273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_020930	GAA	2	6	184303	184308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_020930	AGA	2	6	184342	184347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_020930	GTT	2	6	184398	184403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_020930	GAG	2	6	184516	184521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_020930	GAA	2	6	184536	184541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_020930	TTG	2	6	184547	184552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4095	NC_020930	T	8	8	184951	184958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_020930	ATA	2	6	185001	185006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_020930	A	7	7	185006	185012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_020930	TAT	2	6	185083	185088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_020930	GA	3	6	185123	185128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_020930	GA	3	6	185155	185160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_020930	AGA	2	6	185165	185170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020930	TGT	2	6	185224	185229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446991
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4109	NC_020930	AGT	2	6	185595	185600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446991
4110	NC_020930	ATCG	2	8	185622	185629	25 %	25 %	25 %	25 %	478446991
4111	NC_020930	TCA	2	6	185707	185712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446992
4112	NC_020930	GGA	2	6	185722	185727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446992
4113	NC_020930	AGAGA	2	10	185815	185824	60 %	0 %	40 %	0 %	478446992
4114	NC_020930	GCA	2	6	185911	185916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446992
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4117	NC_020930	ATA	2	6	186337	186342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446992
4118	NC_020930	TCTA	2	8	186378	186385	25 %	50 %	0 %	25 %	478446992
4119	NC_020930	GTT	2	6	186438	186443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_020930	TGC	2	6	186571	186576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446993
4121	NC_020930	CA	3	6	186592	186597	50 %	0 %	0 %	50 %	478446993
4122	NC_020930	AC	3	6	186610	186615	50 %	0 %	0 %	50 %	478446993
4123	NC_020930	AGA	2	6	186709	186714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446993
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4125	NC_020930	T	6	6	186852	186857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020930	T	7	7	186860	186866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_020930	T	8	8	186922	186929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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