MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3003	NC_020930	GAA	2	6	135551	135556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_020930	A	6	6	135576	135581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_020930	GTTT	2	8	135582	135589	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_020930	T	7	7	135597	135603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3014	NC_020930	TGT	2	6	135911	135916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446946
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3019	NC_020930	AAC	2	6	136038	136043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446946
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3022	NC_020930	AGG	2	6	136208	136213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_020930	AAC	2	6	136301	136306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446947
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3035	NC_020930	GCTA	2	8	136716	136723	25 %	25 %	25 %	25 %	478446948
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3039	NC_020930	TAG	2	6	136838	136843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446948
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3046	NC_020930	T	6	6	136975	136980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3072	NC_020930	TTGCA	2	10	137668	137677	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3109	NC_020930	T	7	7	139544	139550	0 %	100 %	0 %	0 %	478446952
3110	NC_020930	GAAA	2	8	139571	139578	75 %	0 %	25 %	0 %	478446952
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3115	NC_020930	T	6	6	139964	139969	0 %	100 %	0 %	0 %	478446953
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3121	NC_020930	AAGA	2	8	140342	140349	75 %	0 %	25 %	0 %	478446954
3122	NC_020930	AG	3	6	140391	140396	50 %	0 %	50 %	0 %	478446954
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3124	NC_020930	TTA	2	6	140498	140503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446954
3125	NC_020930	GTT	2	6	140533	140538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446954
3126	NC_020930	AGA	2	6	140598	140603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446954
3127	NC_020930	TCCAG	2	10	140625	140634	20 %	20 %	20 %	40 %	478446954
3128	NC_020930	GAA	2	6	140676	140681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446955
3129	NC_020930	ATTG	2	8	140685	140692	25 %	50 %	25 %	0 %	478446955
3130	NC_020930	ATT	2	6	140719	140724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446955
3131	NC_020930	AAG	2	6	140780	140785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446955
3132	NC_020930	CTT	2	6	140797	140802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446955
3133	NC_020930	GCA	2	6	140836	140841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446955
3134	NC_020930	CCTA	2	8	140846	140853	25 %	25 %	0 %	50 %	478446955
3135	NC_020930	GCT	2	6	140872	140877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446955
3136	NC_020930	GTG	2	6	141079	141084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446955
3137	NC_020930	TCA	2	6	141137	141142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446955
3138	NC_020930	TAA	2	6	141246	141251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446955
3139	NC_020930	GTACA	2	10	141356	141365	40 %	20 %	20 %	20 %	478446955
3140	NC_020930	AGA	2	6	141387	141392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446955
3141	NC_020930	GAA	2	6	141571	141576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446955
3142	NC_020930	TAA	2	6	141705	141710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446955
3143	NC_020930	TAGAT	2	10	141729	141738	40 %	40 %	20 %	0 %	478446955
3144	NC_020930	TAT	2	6	141739	141744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446955
3145	NC_020930	CTCC	2	8	141745	141752	0 %	25 %	0 %	75 %	478446955
3146	NC_020930	CTG	2	6	141761	141766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446955
3147	NC_020930	CCT	2	6	141805	141810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446955
3148	NC_020930	TAT	2	6	141811	141816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446955
3149	NC_020930	TGG	2	6	141906	141911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446955
3150	NC_020930	TCA	2	6	141933	141938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446955
3151	NC_020930	TCT	2	6	141963	141968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446955
3152	NC_020930	ATTA	2	8	141982	141989	50 %	50 %	0 %	0 %	478446955
3153	NC_020930	T	8	8	142051	142058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_020930	T	6	6	142096	142101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_020930	AAG	2	6	142105	142110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_020930	AAAAG	2	10	142141	142150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_020930	T	6	6	142165	142170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_020930	GCT	2	6	142201	142206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3159	NC_020930	A	6	6	142217	142222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_020930	ATC	2	6	142225	142230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3161	NC_020930	A	6	6	142274	142279	100 %	0 %	0 %	0 %	478446956
3162	NC_020930	CTC	2	6	142424	142429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446956
3163	NC_020930	AAAAC	2	10	142621	142630	80 %	0 %	0 %	20 %	478446956
3164	NC_020930	AGA	2	6	142775	142780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446957
3165	NC_020930	TGGAAA	2	12	142813	142824	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	478446957
3166	NC_020930	GGA	2	6	142949	142954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478446957
3167	NC_020930	AGAA	2	8	143013	143020	75 %	0 %	25 %	0 %	478446957
3168	NC_020930	CTT	2	6	143050	143055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446957
3169	NC_020930	AAGA	2	8	143072	143079	75 %	0 %	25 %	0 %	478446957
3170	NC_020930	A	6	6	143084	143089	100 %	0 %	0 %	0 %	478446957
3171	NC_020930	AT	3	6	143152	143157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3172	NC_020930	CTT	2	6	143179	143184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3173	NC_020930	AAG	2	6	143189	143194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446958
3174	NC_020930	AAAG	2	8	143269	143276	75 %	0 %	25 %	0 %	478446958
3175	NC_020930	T	6	6	143313	143318	0 %	100 %	0 %	0 %	478446958
3176	NC_020930	GCA	2	6	143321	143326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446958
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3178	NC_020930	TCA	2	6	143352	143357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446958
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3180	NC_020930	TCC	2	6	143404	143409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446958
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3184	NC_020930	GAAA	2	8	143602	143609	75 %	0 %	25 %	0 %	478446958
3185	NC_020930	AG	3	6	143621	143626	50 %	0 %	50 %	0 %	478446958
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3191	NC_020930	GGAGC	2	10	143754	143763	20 %	0 %	60 %	20 %	478446958
3192	NC_020930	A	6	6	143795	143800	100 %	0 %	0 %	0 %	478446958
3193	NC_020930	CTT	2	6	143802	143807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446958
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3197	NC_020930	AGA	2	6	143896	143901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446958
3198	NC_020930	ATGGTT	2	12	143932	143943	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478446958
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3200	NC_020930	TTG	2	6	144091	144096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3201	NC_020930	TCA	2	6	144139	144144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446959
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3203	NC_020930	TTG	2	6	144222	144227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446959
3204	NC_020930	TGA	2	6	144251	144256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446959
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3211	NC_020930	GTC	2	6	144605	144610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446959
3212	NC_020930	TAA	2	6	144612	144617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446959
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3214	NC_020930	ATA	3	9	144838	144846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478446959
3215	NC_020930	GATC	2	8	144859	144866	25 %	25 %	25 %	25 %	478446959
3216	NC_020930	ATC	2	6	144870	144875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3217	NC_020930	TAA	2	6	144877	144882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3218	NC_020930	T	7	7	144941	144947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3219	NC_020930	T	7	7	144970	144976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3220	NC_020930	T	7	7	145003	145009	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_020930	CTT	2	6	145106	145111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446960
3222	NC_020930	GT	3	6	145154	145159	0 %	50 %	50 %	0 %	478446960
3223	NC_020930	CTGGG	2	10	145169	145178	0 %	20 %	60 %	20 %	478446960
3224	NC_020930	TTCA	2	8	145271	145278	25 %	50 %	0 %	25 %	478446960
3225	NC_020930	CTT	2	6	145305	145310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446960
3226	NC_020930	TGG	2	6	145335	145340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478446960
3227	NC_020930	CTG	2	6	145368	145373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446960
3228	NC_020930	CTTA	2	8	145374	145381	25 %	50 %	0 %	25 %	478446960
3229	NC_020930	TGCG	2	8	145392	145399	0 %	25 %	50 %	25 %	478446960
3230	NC_020930	CAA	2	6	145421	145426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446960
3231	NC_020930	GCA	2	6	145433	145438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446960
3232	NC_020930	TCT	2	6	145467	145472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446960
3233	NC_020930	TTC	2	6	145506	145511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446960
3234	NC_020930	GTTT	2	8	145528	145535	0 %	75 %	25 %	0 %	478446960
3235	NC_020930	AG	3	6	145546	145551	50 %	0 %	50 %	0 %	478446960
3236	NC_020930	GTA	2	6	145565	145570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446960
3237	NC_020930	ACA	2	6	145840	145845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446961
3238	NC_020930	GTA	2	6	145886	145891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446961
3239	NC_020930	TCC	2	6	145908	145913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446961
3240	NC_020930	GTTTT	2	10	145916	145925	0 %	80 %	20 %	0 %	478446961
3241	NC_020930	CAA	2	6	145927	145932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446961
3242	NC_020930	GAT	2	6	145983	145988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446961
3243	NC_020930	A	6	6	145993	145998	100 %	0 %	0 %	0 %	478446961
3244	NC_020930	GA	4	8	146005	146012	50 %	0 %	50 %	0 %	478446961
3245	NC_020930	TCT	2	6	146034	146039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446961
3246	NC_020930	TCA	2	6	146079	146084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446961
3247	NC_020930	TGCTCT	2	12	146124	146135	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	478446961
3248	NC_020930	TGA	2	6	146157	146162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446961
3249	NC_020930	TTC	2	6	146201	146206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446961
3250	NC_020930	ACG	2	6	146342	146347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446961
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3375	NC_020930	TAT	2	6	151906	151911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446964
3376	NC_020930	GAA	2	6	152058	152063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3377	NC_020930	AAG	2	6	152126	152131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3378	NC_020930	GTT	2	6	152134	152139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3379	NC_020930	T	8	8	152223	152230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3380	NC_020930	TTC	2	6	152242	152247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3382	NC_020930	GCTG	2	8	152341	152348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3383	NC_020930	GCG	2	6	152429	152434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3384	NC_020930	GGA	2	6	152435	152440	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3499	NC_020930	ACAT	2	8	157870	157877	50 %	25 %	0 %	25 %	478446970
3500	NC_020930	TGTT	2	8	157916	157923	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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