MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L2/25667R complete genome

Total Repeats: 22944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_020930	AAG	2	6	69173	69178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446890
1502	NC_020930	ACA	2	6	69258	69263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_020930	GCA	2	6	69331	69336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446891
1504	NC_020930	CAAGC	2	10	69341	69350	40 %	0 %	20 %	40 %	478446891
1505	NC_020930	A	6	6	69377	69382	100 %	0 %	0 %	0 %	478446891
1506	NC_020930	TCT	2	6	69518	69523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446891
1507	NC_020930	CTG	2	6	69549	69554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446891
1508	NC_020930	ATG	2	6	69557	69562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446891
1509	NC_020930	AAAAG	2	10	69589	69598	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_020930	A	6	6	69690	69695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_020930	TA	3	6	69725	69730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_020930	TTC	2	6	69765	69770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446892
1513	NC_020930	CTT	3	9	69774	69782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446892
1514	NC_020930	AT	3	6	69787	69792	50 %	50 %	0 %	0 %	478446892
1515	NC_020930	TTCG	2	8	69807	69814	0 %	50 %	25 %	25 %	478446892
1516	NC_020930	TGT	2	6	69832	69837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446892
1517	NC_020930	TGAT	2	8	69924	69931	25 %	50 %	25 %	0 %	478446892
1518	NC_020930	T	6	6	69972	69977	0 %	100 %	0 %	0 %	478446892
1519	NC_020930	TCT	2	6	70088	70093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446892
1520	NC_020930	GGAGC	2	10	70211	70220	20 %	0 %	60 %	20 %	478446892
1521	NC_020930	TGC	2	6	70294	70299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446892
1522	NC_020930	A	7	7	70331	70337	100 %	0 %	0 %	0 %	478446892
1523	NC_020930	CT	3	6	70339	70344	0 %	50 %	0 %	50 %	478446892
1524	NC_020930	AGA	2	6	70348	70353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446892
1525	NC_020930	ATT	2	6	70359	70364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446892
1526	NC_020930	GCGAT	2	10	70401	70410	20 %	20 %	40 %	20 %	478446892
1527	NC_020930	GTT	2	6	70423	70428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446892
1528	NC_020930	GCT	2	6	70445	70450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478446892
1529	NC_020930	GCA	3	9	70547	70555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446892
1530	NC_020930	AAAG	2	8	70580	70587	75 %	0 %	25 %	0 %	478446892
1531	NC_020930	GCA	2	6	70594	70599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478446892
1532	NC_020930	ATT	2	6	70608	70613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446892
1533	NC_020930	TAT	2	6	70716	70721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446892
1534	NC_020930	CTT	2	6	70740	70745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446892
1535	NC_020930	GA	3	6	70749	70754	50 %	0 %	50 %	0 %	478446892
1536	NC_020930	CTCTT	2	10	70755	70764	0 %	60 %	0 %	40 %	478446892
1537	NC_020930	AGAA	2	8	70767	70774	75 %	0 %	25 %	0 %	478446892
1538	NC_020930	TGA	2	6	70795	70800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446892
1539	NC_020930	TTG	2	6	70884	70889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446892
1540	NC_020930	TCT	2	6	70907	70912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478446892
1541	NC_020930	GA	3	6	70948	70953	50 %	0 %	50 %	0 %	478446892
1542	NC_020930	AGCT	2	8	70989	70996	25 %	25 %	25 %	25 %	478446892
1543	NC_020930	TGA	2	6	71035	71040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446892
1544	NC_020930	GCAT	2	8	71050	71057	25 %	25 %	25 %	25 %	478446892
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1546	NC_020930	TCAA	2	8	71194	71201	50 %	25 %	0 %	25 %	478446892
1547	NC_020930	GT	3	6	71224	71229	0 %	50 %	50 %	0 %	478446892
1548	NC_020930	CT	3	6	71305	71310	0 %	50 %	0 %	50 %	478446892
1549	NC_020930	GA	3	6	71326	71331	50 %	0 %	50 %	0 %	478446892
1550	NC_020930	AGT	2	6	71368	71373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446892
1551	NC_020930	AGGGG	2	10	71401	71410	20 %	0 %	80 %	0 %	478446892
1552	NC_020930	AAGAA	2	10	71443	71452	80 %	0 %	20 %	0 %	478446892
1553	NC_020930	AGA	2	6	71515	71520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446892
1554	NC_020930	TGA	2	6	71551	71556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446892
1555	NC_020930	TAT	2	6	71562	71567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446892
1556	NC_020930	T	6	6	71651	71656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_020930	T	8	8	71672	71679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_020930	CAT	2	6	71737	71742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446893
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1560	NC_020930	GCTT	2	8	71796	71803	0 %	50 %	25 %	25 %	478446893
1561	NC_020930	A	6	6	71891	71896	100 %	0 %	0 %	0 %	478446893
1562	NC_020930	ATT	2	6	71941	71946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478446893
1563	NC_020930	CAA	2	6	72088	72093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478446893
1564	NC_020930	TCC	2	6	72112	72117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446893
1565	NC_020930	TTCT	2	8	72134	72141	0 %	75 %	0 %	25 %	478446893
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1567	NC_020930	GCTT	2	8	72180	72187	0 %	50 %	25 %	25 %	478446893
1568	NC_020930	AGA	2	6	72189	72194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478446893
1569	NC_020930	GAGC	2	8	72208	72215	25 %	0 %	50 %	25 %	478446893
1570	NC_020930	TCA	2	6	72233	72238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478446893
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1572	NC_020930	CTATTT	2	12	72251	72262	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	478446893
1573	NC_020930	TGA	2	6	72285	72290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446893
1574	NC_020930	ATG	2	6	72323	72328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478446893
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1577	NC_020930	CGT	2	6	72501	72506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_020930	T	7	7	72506	72512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_020930	CTTGC	2	10	72532	72541	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1580	NC_020930	GATA	2	8	72556	72563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1583	NC_020930	ATTGG	2	10	72733	72742	20 %	40 %	40 %	0 %	478446894
1584	NC_020930	T	6	6	72749	72754	0 %	100 %	0 %	0 %	478446894
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1601	NC_020930	CTC	2	6	73312	73317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478446894
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1611	NC_020930	TGT	2	6	73792	73797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478446894
1612	NC_020930	GAAAA	2	10	73805	73814	80 %	0 %	20 %	0 %	478446894
1613	NC_020930	A	7	7	73811	73817	100 %	0 %	0 %	0 %	478446894
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