MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 2382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020929	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478451326
2	NC_020929	AG	3	6	844	849	50 %	0 %	50 %	0 %	478451326
3	NC_020929	TC	3	6	2195	2200	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020929	TC	3	6	2267	2272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020929	AG	3	6	2750	2755	50 %	0 %	50 %	0 %	478451329
6	NC_020929	TC	3	6	2831	2836	0 %	50 %	0 %	50 %	478451329
7	NC_020929	GA	3	6	3418	3423	50 %	0 %	50 %	0 %	478451329
8	NC_020929	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	478451330
9	NC_020929	TC	3	6	5861	5866	0 %	50 %	0 %	50 %	478451331
10	NC_020929	GA	3	6	5872	5877	50 %	0 %	50 %	0 %	478451331
11	NC_020929	AT	3	6	5976	5981	50 %	50 %	0 %	0 %	478451331
12	NC_020929	TG	3	6	6129	6134	0 %	50 %	50 %	0 %	478451331
13	NC_020929	TA	3	6	6200	6205	50 %	50 %	0 %	0 %	478451331
14	NC_020929	AG	3	6	6537	6542	50 %	0 %	50 %	0 %	478451331
15	NC_020929	GA	3	6	7595	7600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020929	AC	3	6	8246	8251	50 %	0 %	0 %	50 %	478451333
17	NC_020929	AG	3	6	8989	8994	50 %	0 %	50 %	0 %	478451334
18	NC_020929	CT	4	8	9108	9115	0 %	50 %	0 %	50 %	478451334
19	NC_020929	GT	3	6	9190	9195	0 %	50 %	50 %	0 %	478451334
20	NC_020929	AG	3	6	9950	9955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020929	GA	3	6	10466	10471	50 %	0 %	50 %	0 %	478451336
22	NC_020929	AG	3	6	10683	10688	50 %	0 %	50 %	0 %	478451336
23	NC_020929	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020929	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	478451337
25	NC_020929	TA	3	6	12469	12474	50 %	50 %	0 %	0 %	478451337
26	NC_020929	TG	3	6	13372	13377	0 %	50 %	50 %	0 %	478451338
27	NC_020929	AG	3	6	13521	13526	50 %	0 %	50 %	0 %	478451338
28	NC_020929	AG	4	8	13677	13684	50 %	0 %	50 %	0 %	478451338
29	NC_020929	TA	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020929	TA	4	8	14163	14170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020929	AC	3	6	15006	15011	50 %	0 %	0 %	50 %	478451339
32	NC_020929	CT	3	6	15295	15300	0 %	50 %	0 %	50 %	478451339
33	NC_020929	AG	3	6	16345	16350	50 %	0 %	50 %	0 %	478451340
34	NC_020929	TC	3	6	16385	16390	0 %	50 %	0 %	50 %	478451340
35	NC_020929	GA	3	6	16914	16919	50 %	0 %	50 %	0 %	478451341
36	NC_020929	AG	3	6	16985	16990	50 %	0 %	50 %	0 %	478451341
37	NC_020929	GA	3	6	17769	17774	50 %	0 %	50 %	0 %	478451341
38	NC_020929	AG	3	6	18115	18120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020929	GA	3	6	18128	18133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020929	GA	3	6	18372	18377	50 %	0 %	50 %	0 %	478451342
41	NC_020929	TC	3	6	18822	18827	0 %	50 %	0 %	50 %	478451342
42	NC_020929	CT	3	6	19050	19055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020929	TC	3	6	19250	19255	0 %	50 %	0 %	50 %	478451343
44	NC_020929	GA	3	6	19265	19270	50 %	0 %	50 %	0 %	478451343
45	NC_020929	GA	3	6	19364	19369	50 %	0 %	50 %	0 %	478451343
46	NC_020929	AG	3	6	19830	19835	50 %	0 %	50 %	0 %	478451343
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50	NC_020929	TG	3	6	20720	20725	0 %	50 %	50 %	0 %	478451344
51	NC_020929	AG	3	6	21116	21121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_020929	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020929	TG	3	6	28992	28997	0 %	50 %	50 %	0 %	478451349
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109	NC_020929	GA	3	6	41625	41630	50 %	0 %	50 %	0 %	478451361
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111	NC_020929	GA	3	6	42601	42606	50 %	0 %	50 %	0 %	478451362
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113	NC_020929	AG	3	6	42847	42852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020929	CT	3	6	42913	42918	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020929	AG	3	6	43243	43248	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020929	TG	3	6	43606	43611	0 %	50 %	50 %	0 %	478451363
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119	NC_020929	TC	3	6	44335	44340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_020929	TA	3	6	44487	44492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_020929	AG	3	6	46997	47002	50 %	0 %	50 %	0 %	478451367
129	NC_020929	AG	3	6	48570	48575	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_020929	GA	3	6	56189	56194	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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