MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_020929	TGA	2	6	181407	181412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451480
4002	NC_020929	AGAGT	2	10	181415	181424	40 %	20 %	40 %	0 %	478451480
4003	NC_020929	GAA	2	6	181470	181475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451480
4004	NC_020929	AGG	2	6	181492	181497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451480
4005	NC_020929	AAG	3	9	181498	181506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451480
4006	NC_020929	TGA	2	6	181619	181624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_020929	TTCC	2	8	181749	181756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4008	NC_020929	ACA	2	6	181776	181781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_020929	TCTA	2	8	181817	181824	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_020929	GAA	2	6	181896	181901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_020929	ATT	2	6	181932	181937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_020929	AATT	2	8	181951	181958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_020929	TGT	2	6	181975	181980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_020929	T	6	6	182079	182084	0 %	100 %	0 %	0 %	478451481
4015	NC_020929	TTGAA	2	10	182105	182114	40 %	40 %	20 %	0 %	478451481
4016	NC_020929	TTTG	2	8	182119	182126	0 %	75 %	25 %	0 %	478451481
4017	NC_020929	ATC	2	6	182216	182221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451481
4018	NC_020929	TGCA	2	8	182237	182244	25 %	25 %	25 %	25 %	478451481
4019	NC_020929	TGT	2	6	182255	182260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451481
4020	NC_020929	AGT	2	6	182274	182279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451481
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4022	NC_020929	T	6	6	182324	182329	0 %	100 %	0 %	0 %	478451481
4023	NC_020929	CTC	2	6	182353	182358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451481
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4031	NC_020929	TGAGT	2	10	182919	182928	20 %	40 %	40 %	0 %	478451481
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4035	NC_020929	AGGGG	2	10	183116	183125	20 %	0 %	80 %	0 %	478451481
4036	NC_020929	GA	3	6	183157	183162	50 %	0 %	50 %	0 %	478451481
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4040	NC_020929	AAGA	2	8	183305	183312	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_020929	T	8	8	183329	183336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_020929	AGAAAA	2	12	183347	183358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_020929	A	6	6	183355	183360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_020929	TCG	2	6	183395	183400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451482
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4047	NC_020929	T	7	7	183432	183438	0 %	100 %	0 %	0 %	478451482
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4098	NC_020929	A	7	7	184960	184966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_020929	TAT	2	6	185038	185043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4101	NC_020929	GA	3	6	185110	185115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_020929	AGA	2	6	185120	185125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_020929	TGT	2	6	185179	185184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451484
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4107	NC_020929	CTG	2	6	185368	185373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451484
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4111	NC_020929	ATCG	2	8	185577	185584	25 %	25 %	25 %	25 %	478451484
4112	NC_020929	TCA	2	6	185662	185667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451485
4113	NC_020929	GGA	2	6	185677	185682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451485
4114	NC_020929	AGAGA	2	10	185770	185779	60 %	0 %	40 %	0 %	478451485
4115	NC_020929	GCA	2	6	185866	185871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451485
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4123	NC_020929	AC	3	6	186565	186570	50 %	0 %	0 %	50 %	478451486
4124	NC_020929	AGA	2	6	186664	186669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451486
4125	NC_020929	GTT	3	9	186793	186801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_020929	T	6	6	186807	186812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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