MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3006	NC_020929	A	6	6	135585	135590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_020929	GTTT	2	8	135591	135598	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3010	NC_020929	AG	4	8	135752	135759	50 %	0 %	50 %	0 %	478451439
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3025	NC_020929	AAC	2	6	136310	136315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451440
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3049	NC_020929	TGT	2	6	137037	137042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451442
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3098	NC_020929	AAGAG	2	10	138928	138937	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3111	NC_020929	T	7	7	139552	139558	0 %	100 %	0 %	0 %	478451445
3112	NC_020929	GAAA	2	8	139579	139586	75 %	0 %	25 %	0 %	478451445
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3125	NC_020929	AG	3	6	140399	140404	50 %	0 %	50 %	0 %	478451447
3126	NC_020929	GAA	2	6	140411	140416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451447
3127	NC_020929	TTA	2	6	140506	140511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451447
3128	NC_020929	GTT	2	6	140541	140546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451447
3129	NC_020929	AGA	2	6	140606	140611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451447
3130	NC_020929	TCCAG	2	10	140633	140642	20 %	20 %	20 %	40 %	478451447
3131	NC_020929	GAA	2	6	140684	140689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451448
3132	NC_020929	ATTG	2	8	140693	140700	25 %	50 %	25 %	0 %	478451448
3133	NC_020929	ATT	2	6	140727	140732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451448
3134	NC_020929	AAG	2	6	140788	140793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451448
3135	NC_020929	CTT	2	6	140805	140810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451448
3136	NC_020929	GCA	2	6	140844	140849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451448
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3138	NC_020929	GCT	2	6	140880	140885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451448
3139	NC_020929	GTG	2	6	141087	141092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451448
3140	NC_020929	TCA	2	6	141145	141150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451448
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3142	NC_020929	GTACA	2	10	141364	141373	40 %	20 %	20 %	20 %	478451448
3143	NC_020929	AGA	2	6	141395	141400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451448
3144	NC_020929	GAA	2	6	141579	141584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451448
3145	NC_020929	TAA	2	6	141713	141718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451448
3146	NC_020929	TAGAT	2	10	141737	141746	40 %	40 %	20 %	0 %	478451448
3147	NC_020929	TAT	2	6	141747	141752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451448
3148	NC_020929	CTCC	2	8	141753	141760	0 %	25 %	0 %	75 %	478451448
3149	NC_020929	CTG	2	6	141769	141774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451448
3150	NC_020929	CCT	2	6	141813	141818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451448
3151	NC_020929	TAT	2	6	141819	141824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451448
3152	NC_020929	TGG	2	6	141914	141919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451448
3153	NC_020929	TCA	2	6	141941	141946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451448
3154	NC_020929	TCT	2	6	141971	141976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451448
3155	NC_020929	ATTA	2	8	141990	141997	50 %	50 %	0 %	0 %	478451448
3156	NC_020929	T	8	8	142059	142066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_020929	T	6	6	142104	142109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_020929	AAG	2	6	142113	142118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3159	NC_020929	AAAAG	2	10	142149	142158	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3160	NC_020929	T	6	6	142173	142178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3161	NC_020929	GCT	2	6	142209	142214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3162	NC_020929	A	6	6	142225	142230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3163	NC_020929	ATC	2	6	142233	142238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3164	NC_020929	A	6	6	142282	142287	100 %	0 %	0 %	0 %	478451449
3165	NC_020929	CTC	2	6	142432	142437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451449
3166	NC_020929	AAAAC	2	10	142629	142638	80 %	0 %	0 %	20 %	478451449
3167	NC_020929	AGA	2	6	142783	142788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451450
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3169	NC_020929	GGA	2	6	142957	142962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451450
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3171	NC_020929	CTT	2	6	143058	143063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451450
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3173	NC_020929	A	6	6	143092	143097	100 %	0 %	0 %	0 %	478451450
3174	NC_020929	AT	3	6	143160	143165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3175	NC_020929	CTT	2	6	143187	143192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3176	NC_020929	AAG	2	6	143197	143202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451451
3177	NC_020929	AAAG	2	8	143277	143284	75 %	0 %	25 %	0 %	478451451
3178	NC_020929	T	6	6	143321	143326	0 %	100 %	0 %	0 %	478451451
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3181	NC_020929	TCA	2	6	143360	143365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451451
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3188	NC_020929	AG	3	6	143629	143634	50 %	0 %	50 %	0 %	478451451
3189	NC_020929	GAA	2	6	143638	143643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451451
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3194	NC_020929	GGAGC	2	10	143762	143771	20 %	0 %	60 %	20 %	478451451
3195	NC_020929	A	6	6	143803	143808	100 %	0 %	0 %	0 %	478451451
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3200	NC_020929	AGA	2	6	143904	143909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451451
3201	NC_020929	ATGGTT	2	12	143940	143951	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	478451451
3202	NC_020929	ATA	2	6	144023	144028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451451
3203	NC_020929	TTG	2	6	144099	144104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3204	NC_020929	TCA	2	6	144147	144152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451452
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3206	NC_020929	TTG	2	6	144230	144235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451452
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3209	NC_020929	TCTA	2	8	144326	144333	25 %	50 %	0 %	25 %	478451452
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3214	NC_020929	GTC	2	6	144613	144618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451452
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3217	NC_020929	ATA	3	9	144846	144854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451452
3218	NC_020929	GATC	2	8	144867	144874	25 %	25 %	25 %	25 %	478451452
3219	NC_020929	ATC	2	6	144878	144883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3220	NC_020929	TAA	2	6	144885	144890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3221	NC_020929	T	7	7	144949	144955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3222	NC_020929	T	7	7	144978	144984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3223	NC_020929	T	7	7	145011	145017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3224	NC_020929	CTT	2	6	145114	145119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451453
3225	NC_020929	GT	3	6	145162	145167	0 %	50 %	50 %	0 %	478451453
3226	NC_020929	CTGGG	2	10	145177	145186	0 %	20 %	60 %	20 %	478451453
3227	NC_020929	TTCA	2	8	145279	145286	25 %	50 %	0 %	25 %	478451453
3228	NC_020929	CTT	2	6	145313	145318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451453
3229	NC_020929	TGG	2	6	145343	145348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451453
3230	NC_020929	CTG	2	6	145376	145381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451453
3231	NC_020929	CTTA	2	8	145382	145389	25 %	50 %	0 %	25 %	478451453
3232	NC_020929	TGCG	2	8	145400	145407	0 %	25 %	50 %	25 %	478451453
3233	NC_020929	CAA	2	6	145429	145434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451453
3234	NC_020929	GCA	2	6	145441	145446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451453
3235	NC_020929	TCT	2	6	145475	145480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451453
3236	NC_020929	TTC	2	6	145514	145519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451453
3237	NC_020929	GTTT	2	8	145536	145543	0 %	75 %	25 %	0 %	478451453
3238	NC_020929	AG	3	6	145554	145559	50 %	0 %	50 %	0 %	478451453
3239	NC_020929	GTA	2	6	145573	145578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451453
3240	NC_020929	ACA	2	6	145848	145853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451454
3241	NC_020929	GTA	2	6	145894	145899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451454
3242	NC_020929	TCC	2	6	145916	145921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451454
3243	NC_020929	GTTTT	2	10	145924	145933	0 %	80 %	20 %	0 %	478451454
3244	NC_020929	CAA	2	6	145935	145940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451454
3245	NC_020929	GAT	2	6	145991	145996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451454
3246	NC_020929	A	6	6	146001	146006	100 %	0 %	0 %	0 %	478451454
3247	NC_020929	GA	4	8	146013	146020	50 %	0 %	50 %	0 %	478451454
3248	NC_020929	TCT	2	6	146042	146047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451454
3249	NC_020929	TCA	2	6	146087	146092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451454
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3251	NC_020929	TGA	2	6	146165	146170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451454
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3375	NC_020929	TGA	2	6	151681	151686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451457
3376	NC_020929	GCA	2	6	151730	151735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451457
3377	NC_020929	TAT	2	6	151913	151918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451457
3378	NC_020929	GAA	2	6	152065	152070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3379	NC_020929	AAG	2	6	152133	152138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3380	NC_020929	GTT	2	6	152141	152146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3381	NC_020929	T	9	9	152230	152238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3382	NC_020929	TTC	2	6	152250	152255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3384	NC_020929	GCTG	2	8	152349	152356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3385	NC_020929	GCG	2	6	152437	152442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3386	NC_020929	GGA	2	6	152443	152448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3387	NC_020929	TTG	2	6	152462	152467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451458
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3390	NC_020929	AGT	2	6	152522	152527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451458
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3496	NC_020929	AG	3	6	157773	157778	50 %	0 %	50 %	0 %	478451463
3497	NC_020929	ATC	2	6	157784	157789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451463
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