MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020929	CCTG	2	8	630685	630692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14002	NC_020929	AT	3	6	630747	630752	50 %	50 %	0 %	0 %	478451891
14003	NC_020929	GTC	2	6	630765	630770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451891
14004	NC_020929	TAA	2	6	630773	630778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451891
14005	NC_020929	A	6	6	630777	630782	100 %	0 %	0 %	0 %	478451891
14006	NC_020929	TC	3	6	630785	630790	0 %	50 %	0 %	50 %	478451891
14007	NC_020929	AAG	2	6	630844	630849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451891
14008	NC_020929	GAA	2	6	630879	630884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451891
14009	NC_020929	AGGA	2	8	630925	630932	50 %	0 %	50 %	0 %	478451891
14010	NC_020929	TTA	2	6	630964	630969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451891
14011	NC_020929	CCTC	2	8	631003	631010	0 %	25 %	0 %	75 %	478451891
14012	NC_020929	ATC	2	6	631041	631046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451891
14013	NC_020929	AAC	2	6	631168	631173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451891
14014	NC_020929	A	7	7	631187	631193	100 %	0 %	0 %	0 %	478451891
14015	NC_020929	CT	3	6	631221	631226	0 %	50 %	0 %	50 %	478451891
14016	NC_020929	A	6	6	631347	631352	100 %	0 %	0 %	0 %	478451891
14017	NC_020929	ACA	2	6	631368	631373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451891
14018	NC_020929	AAGA	2	8	631389	631396	75 %	0 %	25 %	0 %	478451891
14019	NC_020929	GATT	2	8	631417	631424	25 %	50 %	25 %	0 %	478451892
14020	NC_020929	TCT	2	6	631435	631440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451892
14021	NC_020929	GCA	2	6	631488	631493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451892
14022	NC_020929	CTT	2	6	631504	631509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451892
14023	NC_020929	CTC	2	6	631528	631533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451892
14024	NC_020929	A	6	6	631558	631563	100 %	0 %	0 %	0 %	478451892
14025	NC_020929	CCT	2	6	631623	631628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451892
14026	NC_020929	AAG	2	6	631630	631635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451892
14027	NC_020929	TCC	2	6	631641	631646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451892
14028	NC_020929	CCT	2	6	631738	631743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451892
14029	NC_020929	ATT	2	6	631755	631760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451892
14030	NC_020929	TTC	2	6	631768	631773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451892
14031	NC_020929	ACA	2	6	631793	631798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451892
14032	NC_020929	CCT	2	6	631803	631808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451892
14033	NC_020929	A	6	6	631890	631895	100 %	0 %	0 %	0 %	478451892
14034	NC_020929	TCGAG	2	10	631900	631909	20 %	20 %	40 %	20 %	478451892
14035	NC_020929	T	6	6	631927	631932	0 %	100 %	0 %	0 %	478451892
14036	NC_020929	TTG	2	6	631957	631962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451892
14037	NC_020929	TCCT	2	8	631992	631999	0 %	50 %	0 %	50 %	478451892
14038	NC_020929	CAA	2	6	632076	632081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451892
14039	NC_020929	ATC	2	6	632103	632108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451892
14040	NC_020929	TCA	2	6	632119	632124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451892
14041	NC_020929	CTTT	2	8	632173	632180	0 %	75 %	0 %	25 %	478451892
14042	NC_020929	ATG	3	9	632223	632231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451892
14043	NC_020929	TC	4	8	632248	632255	0 %	50 %	0 %	50 %	478451892
14044	NC_020929	CTA	2	6	632301	632306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451892
14045	NC_020929	TGA	2	6	632314	632319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451892
14046	NC_020929	CAA	2	6	632358	632363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451893
14047	NC_020929	TTTG	2	8	632377	632384	0 %	75 %	25 %	0 %	478451893
14048	NC_020929	TTA	2	6	632405	632410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451893
14049	NC_020929	CTC	2	6	632427	632432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451893
14050	NC_020929	TAT	2	6	632434	632439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451893
14051	NC_020929	TGG	2	6	632463	632468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451893
14052	NC_020929	AGC	2	6	632479	632484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451893
14053	NC_020929	GGCT	2	8	632561	632568	0 %	25 %	50 %	25 %	478451893
14054	NC_020929	TGC	2	6	632590	632595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451893
14055	NC_020929	GGCTC	2	10	632664	632673	0 %	20 %	40 %	40 %	478451894
14056	NC_020929	TA	3	6	632687	632692	50 %	50 %	0 %	0 %	478451894
14057	NC_020929	AGCC	2	8	632700	632707	25 %	0 %	25 %	50 %	478451894
14058	NC_020929	TCTT	2	8	632724	632731	0 %	75 %	0 %	25 %	478451894
14059	NC_020929	ATC	2	6	632765	632770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451894
14060	NC_020929	CT	3	6	632822	632827	0 %	50 %	0 %	50 %	478451894
14061	NC_020929	TGC	2	6	632838	632843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451894
14062	NC_020929	CTT	2	6	632906	632911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451894
14063	NC_020929	TGC	2	6	632968	632973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451894
14064	NC_020929	ACCA	2	8	632996	633003	50 %	0 %	0 %	50 %	478451894
14065	NC_020929	CT	3	6	633034	633039	0 %	50 %	0 %	50 %	478451894
14066	NC_020929	ATT	2	6	633081	633086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451894
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14068	NC_020929	ATC	2	6	633158	633163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451894
14069	NC_020929	ATG	2	6	633191	633196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451894
14070	NC_020929	CAG	2	6	633276	633281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451894
14071	NC_020929	ATC	2	6	633317	633322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451894
14072	NC_020929	CTC	2	6	633333	633338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451894
14073	NC_020929	CTAC	2	8	633352	633359	25 %	25 %	0 %	50 %	478451894
14074	NC_020929	TGG	2	6	633407	633412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451894
14075	NC_020929	ATT	2	6	633432	633437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451894
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14077	NC_020929	TCC	2	6	633487	633492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451894
14078	NC_020929	A	9	9	633509	633517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_020929	CTCC	2	8	633521	633528	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14080	NC_020929	A	6	6	633529	633534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14081	NC_020929	TTC	2	6	633542	633547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14082	NC_020929	TTG	2	6	633568	633573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_020929	TGC	2	6	633612	633617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451895
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14086	NC_020929	CAC	2	6	633871	633876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478451895
14087	NC_020929	C	6	6	633917	633922	0 %	0 %	0 %	100 %	478451895
14088	NC_020929	TG	3	6	633935	633940	0 %	50 %	50 %	0 %	478451895
14089	NC_020929	GAG	2	6	633996	634001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451895
14090	NC_020929	CT	3	6	634002	634007	0 %	50 %	0 %	50 %	478451895
14091	NC_020929	T	6	6	634041	634046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14092	NC_020929	A	6	6	634107	634112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14093	NC_020929	TCT	2	6	634129	634134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451896
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14095	NC_020929	CTT	2	6	634225	634230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451896
14096	NC_020929	AAAG	2	8	634238	634245	75 %	0 %	25 %	0 %	478451896
14097	NC_020929	GCA	2	6	634328	634333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451896
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14103	NC_020929	GGA	2	6	634584	634589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451896
14104	NC_020929	CTCGAG	2	12	634620	634631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	478451896
14105	NC_020929	AAT	2	6	634633	634638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451896
14106	NC_020929	AGCA	2	8	634651	634658	50 %	0 %	25 %	25 %	478451896
14107	NC_020929	GAA	2	6	634751	634756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451896
14108	NC_020929	ATT	2	6	634813	634818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451896
14109	NC_020929	GGC	2	6	634820	634825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478451896
14110	NC_020929	AAC	2	6	634867	634872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451896
14111	NC_020929	GCTCT	2	10	634905	634914	0 %	40 %	20 %	40 %	478451896
14112	NC_020929	TCGTT	2	10	634933	634942	0 %	60 %	20 %	20 %	478451896
14113	NC_020929	TTG	2	6	634975	634980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451896
14114	NC_020929	CTT	2	6	634995	635000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451896
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14117	NC_020929	AAAAT	2	10	635096	635105	80 %	20 %	0 %	0 %	478451896
14118	NC_020929	TGG	2	6	635151	635156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478451897
14119	NC_020929	CCTT	2	8	635168	635175	0 %	50 %	0 %	50 %	478451897
14120	NC_020929	TCCAT	2	10	635234	635243	20 %	40 %	0 %	40 %	478451897
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14122	NC_020929	CCT	2	6	635285	635290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451897
14123	NC_020929	CT	3	6	635289	635294	0 %	50 %	0 %	50 %	478451897
14124	NC_020929	CTA	2	6	635303	635308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451897
14125	NC_020929	GAAA	2	8	635397	635404	75 %	0 %	25 %	0 %	478451897
14126	NC_020929	A	6	6	635402	635407	100 %	0 %	0 %	0 %	478451897
14127	NC_020929	CTCTTT	2	12	635505	635516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451897
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14131	NC_020929	TAAACA	2	12	635633	635644	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	478451897
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14154	NC_020929	CAT	2	6	636387	636392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451899
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14185	NC_020929	CCT	2	6	637634	637639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14186	NC_020929	CGGAA	2	10	637850	637859	40 %	0 %	40 %	20 %	478451901
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14232	NC_020929	T	7	7	640005	640011	0 %	100 %	0 %	0 %	478451902
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14241	NC_020929	AGCG	2	8	640418	640425	25 %	0 %	50 %	25 %	478451902
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14243	NC_020929	TCT	2	6	640472	640477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451902
14244	NC_020929	TCT	2	6	640493	640498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451902
14245	NC_020929	GCT	2	6	640505	640510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451902
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14248	NC_020929	AGA	2	6	640738	640743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451902
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14252	NC_020929	GTT	2	6	641130	641135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451902
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14254	NC_020929	GA	3	6	641200	641205	50 %	0 %	50 %	0 %	478451902
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14352	NC_020929	GA	3	6	645635	645640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14353	NC_020929	AGG	2	6	645667	645672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14354	NC_020929	AC	3	6	645697	645702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14355	NC_020929	GCT	2	6	645703	645708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14357	NC_020929	TTA	2	6	645776	645781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14358	NC_020929	TAG	2	6	645821	645826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14360	NC_020929	T	7	7	645842	645848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14487	NC_020929	GCT	2	6	651569	651574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451911
14488	NC_020929	GAA	2	6	651629	651634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451911
14489	NC_020929	CCTT	2	8	651691	651698	0 %	50 %	0 %	50 %	478451911
14490	NC_020929	TCT	2	6	651737	651742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451911
14491	NC_020929	AT	3	6	651785	651790	50 %	50 %	0 %	0 %	478451911
14492	NC_020929	TCA	2	6	651832	651837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451911
14493	NC_020929	AGA	2	6	651841	651846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451911
14494	NC_020929	A	7	7	651850	651856	100 %	0 %	0 %	0 %	478451911
14495	NC_020929	TC	3	6	651894	651899	0 %	50 %	0 %	50 %	478451911
14496	NC_020929	CTG	2	6	651912	651917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451911
14497	NC_020929	T	6	6	651925	651930	0 %	100 %	0 %	0 %	478451911
14498	NC_020929	GTT	2	6	651947	651952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451911
14499	NC_020929	ACT	2	6	651969	651974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451911
14500	NC_020929	TCA	2	6	651985	651990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451911

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