MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_020929	TCT	2	6	22679	22684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451345
503	NC_020929	AT	3	6	22787	22792	50 %	50 %	0 %	0 %	478451345
504	NC_020929	TTG	2	6	22873	22878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451345
505	NC_020929	TTC	2	6	22942	22947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451345
506	NC_020929	T	6	6	23019	23024	0 %	100 %	0 %	0 %	478451345
507	NC_020929	AT	3	6	23111	23116	50 %	50 %	0 %	0 %	478451345
508	NC_020929	CTG	2	6	23122	23127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451345
509	NC_020929	TCG	2	6	23141	23146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451345
510	NC_020929	GAA	2	6	23150	23155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
511	NC_020929	TTG	2	6	23204	23209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451345
512	NC_020929	CATT	2	8	23303	23310	25 %	50 %	0 %	25 %	478451345
513	NC_020929	AGA	2	6	23482	23487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
514	NC_020929	TGA	2	6	23513	23518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451345
515	NC_020929	GAA	2	6	23551	23556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
516	NC_020929	TTG	2	6	23573	23578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451345
517	NC_020929	AGA	2	6	23633	23638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
518	NC_020929	GCTT	2	8	23646	23653	0 %	50 %	25 %	25 %	478451345
519	NC_020929	GGTT	2	8	23694	23701	0 %	50 %	50 %	0 %	478451345
520	NC_020929	TGC	2	6	23720	23725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451345
521	NC_020929	ATT	2	6	23772	23777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451345
522	NC_020929	AAT	2	6	23814	23819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451345
523	NC_020929	TTG	2	6	23877	23882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451345
524	NC_020929	TTCT	2	8	24064	24071	0 %	75 %	0 %	25 %	478451345
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529	NC_020929	AGA	2	6	24308	24313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
530	NC_020929	GAG	2	6	24331	24336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451345
531	NC_020929	TTC	2	6	24394	24399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451345
532	NC_020929	GGAAA	2	10	24407	24416	60 %	0 %	40 %	0 %	478451345
533	NC_020929	GA	3	6	24430	24435	50 %	0 %	50 %	0 %	478451345
534	NC_020929	GA	3	6	24522	24527	50 %	0 %	50 %	0 %	478451345
535	NC_020929	GAA	2	6	24653	24658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
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541	NC_020929	GAA	2	6	24934	24939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
542	NC_020929	AAG	2	6	25075	25080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451345
543	NC_020929	A	7	7	25160	25166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020929	TTA	2	6	25173	25178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020929	T	8	8	25188	25195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020929	T	6	6	25219	25224	0 %	100 %	0 %	0 %	478451346
547	NC_020929	AGA	2	6	25346	25351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451346
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549	NC_020929	GGA	3	9	25510	25518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478451346
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551	NC_020929	TTGA	2	8	25653	25660	25 %	50 %	25 %	0 %	478451346
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555	NC_020929	TTCC	2	8	26001	26008	0 %	50 %	0 %	50 %	478451346
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559	NC_020929	AGAGG	2	10	26131	26140	40 %	0 %	60 %	0 %	478451346
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570	NC_020929	TAG	2	6	26735	26740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451346
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579	NC_020929	CGA	2	6	27037	27042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451346
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601	NC_020929	TGA	2	6	27902	27907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451347
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603	NC_020929	GGATA	2	10	27936	27945	40 %	20 %	40 %	0 %	478451347
604	NC_020929	A	7	7	27960	27966	100 %	0 %	0 %	0 %	478451347
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618	NC_020929	TAA	2	6	28479	28484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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620	NC_020929	ATTG	2	8	28537	28544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020929	AG	3	6	28569	28574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_020929	AGA	2	6	28591	28596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_020929	GAA	2	6	28641	28646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451349
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631	NC_020929	GCA	2	6	29016	29021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451349
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