MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis L1/115 complete genome

Total Repeats: 22965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6124	NC_020929	TTC	2	6	276740	276745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451570
6125	NC_020929	GAA	2	6	276771	276776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451570
6126	NC_020929	GA	3	6	276796	276801	50 %	0 %	50 %	0 %	478451570
6127	NC_020929	AAAG	2	8	276828	276835	75 %	0 %	25 %	0 %	478451570
6128	NC_020929	ATA	2	6	276926	276931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451570
6129	NC_020929	CAT	2	6	276994	276999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451570
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6132	NC_020929	GAT	2	6	277107	277112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451570
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6135	NC_020929	TAAT	2	8	277249	277256	50 %	50 %	0 %	0 %	478451570
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6139	NC_020929	GAA	2	6	277346	277351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451570
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6141	NC_020929	TCC	2	6	277529	277534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	478451570
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6144	NC_020929	CACGCG	2	12	277796	277807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478451570
6145	NC_020929	ATT	3	9	277820	277828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451570
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6148	NC_020929	TAC	2	6	278070	278075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6149	NC_020929	TCT	2	6	278099	278104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451571
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6152	NC_020929	TGTT	2	8	278150	278157	0 %	75 %	25 %	0 %	478451571
6153	NC_020929	TTG	2	6	278163	278168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451571
6154	NC_020929	AGA	2	6	278187	278192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478451571
6155	NC_020929	AAC	2	6	278245	278250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451571
6156	NC_020929	CAT	2	6	278253	278258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451571
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6158	NC_020929	GTT	2	6	278282	278287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478451571
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6162	NC_020929	TATC	2	8	278438	278445	25 %	50 %	0 %	25 %	478451571
6163	NC_020929	AGCT	2	8	278459	278466	25 %	25 %	25 %	25 %	478451571
6164	NC_020929	CTG	2	6	278625	278630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451571
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6168	NC_020929	ATA	2	6	278789	278794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451571
6169	NC_020929	TGC	2	6	278796	278801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451571
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6189	NC_020929	ATTC	2	8	279905	279912	25 %	50 %	0 %	25 %	478451571
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6202	NC_020929	GGGA	2	8	280479	280486	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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6206	NC_020929	CAT	2	6	280765	280770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451572
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6210	NC_020929	CTG	2	6	280934	280939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451572
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6215	NC_020929	CTCC	2	8	281332	281339	0 %	25 %	0 %	75 %	478451572
6216	NC_020929	AAGC	2	8	281354	281361	50 %	0 %	25 %	25 %	478451572
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6223	NC_020929	CT	3	6	281597	281602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6224	NC_020929	TAAA	2	8	281621	281628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6225	NC_020929	A	6	6	281626	281631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6226	NC_020929	T	6	6	281646	281651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6227	NC_020929	A	6	6	281666	281671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6228	NC_020929	TC	4	8	281688	281695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6229	NC_020929	T	6	6	281816	281821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6230	NC_020929	CTT	2	6	281858	281863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478451573
6231	NC_020929	ACT	2	6	281887	281892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
6232	NC_020929	GCTGT	2	10	281900	281909	0 %	40 %	40 %	20 %	478451573
6233	NC_020929	GTC	2	6	281968	281973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451573
6234	NC_020929	T	6	6	281987	281992	0 %	100 %	0 %	0 %	478451573
6235	NC_020929	ACT	2	6	282015	282020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
6236	NC_020929	ACT	2	6	282084	282089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
6237	NC_020929	TGC	2	6	282120	282125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478451573
6238	NC_020929	T	7	7	282130	282136	0 %	100 %	0 %	0 %	478451573
6239	NC_020929	CTCCTA	2	12	282137	282148	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	478451573
6240	NC_020929	AAC	2	6	282222	282227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451573
6241	NC_020929	TC	3	6	282337	282342	0 %	50 %	0 %	50 %	478451573
6242	NC_020929	ATC	2	6	282362	282367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
6243	NC_020929	TGGC	2	8	282372	282379	0 %	25 %	50 %	25 %	478451573
6244	NC_020929	TTCGA	2	10	282391	282400	20 %	40 %	20 %	20 %	478451573
6245	NC_020929	ATT	2	6	282426	282431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478451573
6246	NC_020929	AG	3	6	282433	282438	50 %	0 %	50 %	0 %	478451573
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6248	NC_020929	ACT	2	6	282473	282478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478451573
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6497	NC_020929	TGA	2	6	293319	293324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478451585
6498	NC_020929	GCA	3	9	293403	293411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478451585
6499	NC_020929	AAT	2	6	293473	293478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478451585
6500	NC_020929	ACA	2	6	293499	293504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478451585

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