MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 98693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020891	CG	3	6	106626	106631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_020891	CCG	2	6	106638	106643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832160
3503	NC_020891	CCG	2	6	106658	106663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832160
3504	NC_020891	GC	3	6	106689	106694	0 %	0 %	50 %	50 %	473832160
3505	NC_020891	TCC	2	6	106698	106703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832160
3506	NC_020891	CCGG	2	8	106738	106745	0 %	0 %	50 %	50 %	473832160
3507	NC_020891	TGA	2	6	106762	106767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832160
3508	NC_020891	GTC	2	6	106778	106783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832160
3509	NC_020891	CGA	2	6	106822	106827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832160
3510	NC_020891	CGG	2	6	106836	106841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832160
3511	NC_020891	CGG	2	6	106855	106860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832160
3512	NC_020891	AGC	2	6	106908	106913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832160
3513	NC_020891	CGG	2	6	106918	106923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832160
3514	NC_020891	CGT	2	6	106934	106939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832160
3515	NC_020891	GCG	2	6	106946	106951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832160
3516	NC_020891	TGG	2	6	106956	106961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832160
3517	NC_020891	CGA	2	6	107026	107031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832160
3518	NC_020891	TCC	2	6	107046	107051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832160
3519	NC_020891	CGA	2	6	107053	107058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832160
3520	NC_020891	CGAC	2	8	107062	107069	25 %	0 %	25 %	50 %	473832160
3521	NC_020891	CGG	2	6	107074	107079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832160
3522	NC_020891	GCG	2	6	107087	107092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832160
3523	NC_020891	CG	3	6	107091	107096	0 %	0 %	50 %	50 %	473832160
3524	NC_020891	CCG	2	6	107148	107153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832161
3525	NC_020891	CTC	2	6	107223	107228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832161
3526	NC_020891	AGG	2	6	107249	107254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832161
3527	NC_020891	GC	4	8	107342	107349	0 %	0 %	50 %	50 %	473832161
3528	NC_020891	CGG	2	6	107359	107364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832161
3529	NC_020891	GGC	2	6	107374	107379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832161
3530	NC_020891	GGT	2	6	107396	107401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832161
3531	NC_020891	CGA	2	6	107435	107440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832161
3532	NC_020891	GCG	2	6	107443	107448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832161
3533	NC_020891	GCC	2	6	107461	107466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832161
3534	NC_020891	CAG	2	6	107478	107483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832161
3535	NC_020891	GC	4	8	107500	107507	0 %	0 %	50 %	50 %	473832161
3536	NC_020891	GCGG	2	8	107521	107528	0 %	0 %	75 %	25 %	473832161
3537	NC_020891	GCA	2	6	107543	107548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832161
3538	NC_020891	CGA	2	6	107552	107557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832161
3539	NC_020891	CGG	2	6	107603	107608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832161
3540	NC_020891	TCG	2	6	107687	107692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_020891	CCA	2	6	107718	107723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832162
3542	NC_020891	ACC	2	6	107735	107740	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832162
3543	NC_020891	GCG	2	6	107746	107751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
3544	NC_020891	GGC	2	6	107754	107759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
3545	NC_020891	GC	3	6	107792	107797	0 %	0 %	50 %	50 %	473832162
3546	NC_020891	CGG	2	6	107799	107804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
3547	NC_020891	GGC	2	6	107827	107832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
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3549	NC_020891	GGC	2	6	107857	107862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
3550	NC_020891	CGT	2	6	107883	107888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3551	NC_020891	CG	3	6	107901	107906	0 %	0 %	50 %	50 %	473832162
3552	NC_020891	TGA	2	6	107907	107912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832162
3553	NC_020891	TCG	2	6	107945	107950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3554	NC_020891	CGG	2	6	107979	107984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
3555	NC_020891	GCG	2	6	107992	107997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
3556	NC_020891	CTC	2	6	107998	108003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832162
3557	NC_020891	CCT	2	6	108009	108014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832162
3558	NC_020891	CGA	2	6	108042	108047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3559	NC_020891	CGA	2	6	108171	108176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3560	NC_020891	GCA	2	6	108201	108206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3561	NC_020891	TGT	2	6	108225	108230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	473832162
3562	NC_020891	ACG	2	6	108296	108301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3563	NC_020891	GAGC	2	8	108364	108371	25 %	0 %	50 %	25 %	473832162
3564	NC_020891	GAG	2	6	108376	108381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832162
3565	NC_020891	TCGCCC	2	12	108389	108400	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	473832162
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3568	NC_020891	GCC	2	6	108440	108445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832162
3569	NC_020891	GTC	2	6	108487	108492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3570	NC_020891	CGA	3	9	108519	108527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
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3572	NC_020891	CTG	2	6	108640	108645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3573	NC_020891	GAC	2	6	108676	108681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
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3575	NC_020891	CGG	2	6	108738	108743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
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3578	NC_020891	GGC	2	6	108837	108842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832162
3579	NC_020891	CGA	2	6	108948	108953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
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3581	NC_020891	CTC	2	6	109027	109032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832162
3582	NC_020891	TGA	2	6	109044	109049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832162
3583	NC_020891	AGG	2	6	109100	109105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832162
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3585	NC_020891	CGTG	2	8	109137	109144	0 %	25 %	50 %	25 %	473832162
3586	NC_020891	GGA	2	6	109197	109202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832162
3587	NC_020891	CTC	2	6	109225	109230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832162
3588	NC_020891	CGA	2	6	109251	109256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3589	NC_020891	AGC	2	6	109259	109264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832162
3590	NC_020891	GCC	2	6	109312	109317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832162
3591	NC_020891	GCC	2	6	109336	109341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832162
3592	NC_020891	GGGCGT	2	12	109374	109385	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	473832162
3593	NC_020891	CG	3	6	109455	109460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3594	NC_020891	CGTG	2	8	109464	109471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3595	NC_020891	GTG	2	6	109517	109522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832163
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3600	NC_020891	CG	3	6	109646	109651	0 %	0 %	50 %	50 %	473832163
3601	NC_020891	CGC	2	6	109684	109689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_020891	CGC	2	6	109696	109701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_020891	GC	3	6	109700	109705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3604	NC_020891	CG	4	8	109706	109713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_020891	TCG	2	6	109730	109735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_020891	TCCCCT	2	12	109785	109796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_020891	CGG	2	6	109816	109821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_020891	ACG	2	6	109869	109874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_020891	CCAT	2	8	109893	109900	25 %	25 %	0 %	50 %	473832164
3610	NC_020891	CCG	2	6	109924	109929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832164
3611	NC_020891	CGG	2	6	109933	109938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832164
3612	NC_020891	CCGC	2	8	109946	109953	0 %	0 %	25 %	75 %	473832164
3613	NC_020891	CCT	2	6	109991	109996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832164
3614	NC_020891	TCGCGC	2	12	110026	110037	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	473832164
3615	NC_020891	ATC	2	6	110064	110069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832164
3616	NC_020891	CG	3	6	110083	110088	0 %	0 %	50 %	50 %	473832164
3617	NC_020891	TCG	2	6	110100	110105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
3618	NC_020891	CGG	2	6	110135	110140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832164
3619	NC_020891	TCG	3	9	110182	110190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
3620	NC_020891	GTC	2	6	110196	110201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
3621	NC_020891	CGG	2	6	110243	110248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832164
3622	NC_020891	CCT	2	6	110270	110275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832164
3623	NC_020891	TCT	2	6	110350	110355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	473832164
3624	NC_020891	TGG	2	6	110404	110409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832164
3625	NC_020891	ATC	2	6	110424	110429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832164
3626	NC_020891	GTG	2	6	110430	110435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832164
3627	NC_020891	CGC	2	6	110464	110469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832164
3628	NC_020891	TCG	2	6	110470	110475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
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3631	NC_020891	CGA	2	6	110534	110539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832164
3632	NC_020891	GC	3	6	110542	110547	0 %	0 %	50 %	50 %	473832164
3633	NC_020891	ATC	2	6	110610	110615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832164
3634	NC_020891	TCG	2	6	110641	110646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
3635	NC_020891	TCG	2	6	110677	110682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
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3640	NC_020891	GAT	2	6	110798	110803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832164
3641	NC_020891	CCCGCA	2	12	110824	110835	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	473832164
3642	NC_020891	CTG	2	6	110862	110867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
3643	NC_020891	CGT	2	6	110891	110896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
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3647	NC_020891	GTG	3	9	111036	111044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832164
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3651	NC_020891	CGCC	2	8	111104	111111	0 %	0 %	25 %	75 %	473832164
3652	NC_020891	CGA	2	6	111152	111157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832164
3653	NC_020891	CGT	2	6	111185	111190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832164
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3659	NC_020891	TCA	2	6	111361	111366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	473832164
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3662	NC_020891	CCGGA	2	10	111447	111456	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3663	NC_020891	GCCGCG	2	12	111498	111509	0 %	0 %	50 %	50 %	473832165
3664	NC_020891	GCC	2	6	111510	111515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832165
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3681	NC_020891	CCG	2	6	112209	112214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832166
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3690	NC_020891	CG	3	6	112448	112453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3691	NC_020891	GAG	3	9	112460	112468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3732	NC_020891	GCTCGG	2	12	113777	113788	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	473832167
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3735	NC_020891	CGT	2	6	113856	113861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3736	NC_020891	GCCG	2	8	113885	113892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3737	NC_020891	GGC	2	6	113966	113971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3738	NC_020891	GCA	2	6	114028	114033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3739	NC_020891	CGGCGA	2	12	114058	114069	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3740	NC_020891	GGCGG	2	10	114121	114130	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3741	NC_020891	CTC	2	6	114154	114159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3742	NC_020891	GGTC	2	8	114217	114224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3743	NC_020891	TCCG	2	8	114227	114234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3744	NC_020891	GCG	2	6	114241	114246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3992	NC_020891	CAG	2	6	121140	121145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832174
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3994	NC_020891	CGG	2	6	121253	121258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832174
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