MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clavibacter michiganensis subsp. nebraskensis NCPPB 2581 complete genome

Total Repeats: 98693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_020891	CGC	2	6	91225	91230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832144
3003	NC_020891	CCG	2	6	91278	91283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832144
3004	NC_020891	CTC	2	6	91319	91324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832144
3005	NC_020891	GCC	2	6	91394	91399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832144
3006	NC_020891	GCT	2	6	91438	91443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832144
3007	NC_020891	CGT	2	6	91487	91492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832144
3008	NC_020891	GAG	2	6	91505	91510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832144
3009	NC_020891	CGT	2	6	91522	91527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832144
3010	NC_020891	GCGG	2	8	91537	91544	0 %	0 %	75 %	25 %	473832144
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3012	NC_020891	CCA	2	6	91604	91609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832144
3013	NC_020891	GGCG	2	8	91618	91625	0 %	0 %	75 %	25 %	473832144
3014	NC_020891	GC	3	6	91651	91656	0 %	0 %	50 %	50 %	473832144
3015	NC_020891	GCGG	2	8	91673	91680	0 %	0 %	75 %	25 %	473832144
3016	NC_020891	GCG	2	6	91701	91706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832144
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3019	NC_020891	GC	3	6	91823	91828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_020891	ACG	2	6	91853	91858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_020891	GAC	2	6	91869	91874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_020891	CCGC	2	8	91879	91886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3023	NC_020891	CACG	2	8	91889	91896	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_020891	CG	4	8	91947	91954	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_020891	CGC	2	6	91981	91986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3026	NC_020891	CCG	2	6	91989	91994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3027	NC_020891	ATC	2	6	92020	92025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_020891	AGCGGG	2	12	92038	92049	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3029	NC_020891	TGA	2	6	92097	92102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_020891	CTG	2	6	92150	92155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832145
3031	NC_020891	CG	3	6	92188	92193	0 %	0 %	50 %	50 %	473832145
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3035	NC_020891	CCA	2	6	92300	92305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	473832145
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3039	NC_020891	GACGC	2	10	92453	92462	20 %	0 %	40 %	40 %	473832145
3040	NC_020891	CTG	2	6	92488	92493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832145
3041	NC_020891	GCTC	2	8	92513	92520	0 %	25 %	25 %	50 %	473832145
3042	NC_020891	GAG	2	6	92594	92599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832145
3043	NC_020891	CG	3	6	92607	92612	0 %	0 %	50 %	50 %	473832145
3044	NC_020891	CGC	2	6	92625	92630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832145
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3047	NC_020891	CTG	2	6	92737	92742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_020891	G	6	6	92742	92747	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_020891	CCG	2	6	92750	92755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3050	NC_020891	CTG	2	6	92780	92785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3051	NC_020891	TCCT	2	8	92789	92796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_020891	CGA	2	6	92824	92829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_020891	GGC	2	6	92843	92848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_020891	TCC	2	6	92850	92855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_020891	CCG	2	6	92872	92877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_020891	CGA	2	6	92880	92885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_020891	GA	3	6	92884	92889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_020891	GTG	2	6	92942	92947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	473832146
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3060	NC_020891	CGT	2	6	92980	92985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832146
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3062	NC_020891	GAG	2	6	93081	93086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	473832146
3063	NC_020891	CGC	2	6	93088	93093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832146
3064	NC_020891	CGATC	2	10	93112	93121	20 %	20 %	20 %	40 %	473832146
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3069	NC_020891	CTC	2	6	93311	93316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	473832146
3070	NC_020891	CCGC	2	8	93321	93328	0 %	0 %	25 %	75 %	473832146
3071	NC_020891	CG	3	6	93334	93339	0 %	0 %	50 %	50 %	473832146
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3098	NC_020891	GC	3	6	94209	94214	0 %	0 %	50 %	50 %	473832147
3099	NC_020891	GGC	2	6	94245	94250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832147
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3111	NC_020891	CGC	2	6	94538	94543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832147
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3124	NC_020891	CGA	2	6	94925	94930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832148
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3256	NC_020891	GAGGTC	3	18	99521	99538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	473832152
3257	NC_020891	ACG	2	6	99570	99575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832152
3258	NC_020891	GCC	2	6	99590	99595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	473832152
3259	NC_020891	CGG	3	9	99706	99714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832152
3260	NC_020891	GCCG	2	8	99791	99798	0 %	0 %	50 %	50 %	473832152
3261	NC_020891	CGA	2	6	99808	99813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832152
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3263	NC_020891	GAC	2	6	99849	99854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832152
3264	NC_020891	GTC	2	6	99872	99877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832152
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3273	NC_020891	TCG	2	6	100074	100079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	473832152
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3283	NC_020891	CCGT	2	8	100286	100293	0 %	25 %	25 %	50 %	473832152
3284	NC_020891	GC	4	8	100322	100329	0 %	0 %	50 %	50 %	473832152
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3287	NC_020891	GC	3	6	100398	100403	0 %	0 %	50 %	50 %	473832152
3288	NC_020891	GGC	2	6	100406	100411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832152
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3290	NC_020891	CGA	2	6	100462	100467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	473832152
3291	NC_020891	CGG	2	6	100520	100525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832152
3292	NC_020891	GGCCG	2	10	100594	100603	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3293	NC_020891	CG	3	6	100602	100607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3294	NC_020891	GGA	2	6	100635	100640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3295	NC_020891	GACGA	2	10	100652	100661	40 %	0 %	40 %	20 %	473832153
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3334	NC_020891	GCG	2	6	101762	101767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	473832154
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3342	NC_020891	TGA	2	6	101954	101959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	473832154
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3492	NC_020891	GACCC	2	10	106390	106399	20 %	0 %	20 %	60 %	473832159
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